PCR實驗技術(shù)的發(fā)展歷程,Khorana(1971)等**早提出核酸體外擴增的設想:“經(jīng)DNA變性,與合適的引物雜交,用DNA聚合酶延伸引物,并不斷重復該過程便可合成tRNA基因?!?983年4月的一個星期五晚上,他開車去鄉(xiāng)下別墅的路上,猛然閃現(xiàn)出“多聚酶鏈式反應”的想法。1983年12月,Mullis用同位素標記法看到了10個循環(huán)后的49bp長度的***個PCR片段;1985年,KaryMullis在Cetus公司工作期間,發(fā)明了PCR。Mullis要合成DNA引物來進行測序工作,卻常為沒有足夠多的模板DNA而煩惱。1985年10月25日申請了PCR的**,1987年7月28日批準(**號4...
PCR實驗技術(shù)中的反向PCR(InversePCR)介紹:反向PCR起初設計用于確定臨近未知區(qū)域的序列。反向PCR有助于研究一個基因的啟動子序列;致*染色體重排如基因融合、異位或轉(zhuǎn)移;及病毒基因的整合。之所以稱為反向PCR,是因為引物設計用于向兩邊延伸而不像常規(guī)PCR中朝著彼此延伸。如今,反向PCR常用于定點突變,復制一個具有預期突變的目的質(zhì)粒。在研究基因組DNA未知序列的傳統(tǒng)實驗流程中,限制性內(nèi)切酶消化和連接先于反向PCR,接著對PCR擴增子進行測序。對于gDNA消化,需選擇一種限制性內(nèi)切酶進行酶切以獲得合適長度可自連的片段。同時,所選擇的內(nèi)切酶不應該切割已知序列,所以連接發(fā)生于側(cè)翼的未知序...
PCR實驗技術(shù)中的RT-PCR一步法和兩步法的優(yōu)缺點介紹:一步法:利用同一緩沖液,在同一體系中加入逆轉(zhuǎn)錄酶、引物、Taq酶、4種dNTP直接進行mRNA反轉(zhuǎn)錄與PCR擴增。發(fā)現(xiàn)Taq酶不僅具有DNA多聚酶的作用,而且具有反轉(zhuǎn)錄酶活性,可利用其雙重作用在同一體系中直接以mRNA為模板進行反轉(zhuǎn)錄和其后PCR擴增,從而使mRNA的PCR步驟更為簡化。所需樣品量減少到比較低限度,臨床小樣品的檢測非常有利。用一步法擴增可檢測出總RNA中小于1ng的低豐度mRNA.該法可用于低豐度mRNA的cDNA文庫的構(gòu)建及特異cDNA的克隆,并有可能與Taq酶的測序技術(shù)相組合,使得自動反轉(zhuǎn)錄、基因擴增與基因轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物的...
PCR樣本可分2種,DNA樣本和RNA樣本。一,DNA樣本:已經(jīng)提取好的DNA樣本,負80度保存,干冰運輸;血液樣本,需全血,加入抗凝劑,抗凝管4度保存;組織樣本,需凍存管或干凈滅菌的離心管裝,負80度保存,干冰運輸;細胞樣本,用胰酶消化后的細胞沉淀,負20度或負80度保存。二,RNA樣本:提取好的RNA樣本,負80度保存,干冰運輸;血液樣本,全血,加入抗凝劑,4度冰箱保存;組織樣本,凍存管或干凈滅菌離心管,負80度保存,干冰運輸;細胞樣本,用胰酶消化后的細胞沉淀,負20度或負80度保存。長時間保存,可加Trizol,其中血液用TrizolLS組織和細胞沉淀用Trizol。英瀚斯生物pcr檢測...
PCR實驗技術(shù)中的錨定PCR(AnchoredPCR)介紹:錨定PCR主要用于分析具有可變末端的DNA序列,Loh等用A-PCR對人外周血淋巴細胞T細胞受體α-鏈的mRNA的多變性進行了分析。先合成cDNA,并用末端脫氧核苷酸轉(zhuǎn)移酶在其3’-可變區(qū)末端加上一個PolyG尾巴。Loh等恒定區(qū)與可變區(qū)連接部位設一個引物,另一個引物是一個具5’-polyG尾巴的引物。帶有PolyG尾巴的引物是一個固定點,它可以并與PolyG尾巴結(jié)合,無論其余部分序列如何,只識別片段末端,利用此法可從前述mRNA中檢出至少20種不同序列,每一種都是獨特的,表明A-PCR不對任何特殊序列有傾向性結(jié)果,可用于T細胞及其它...
PCR引物設計的原則PCR反應中有兩條引物,即5′端引物和3′引物。設計引物時以一條DNA單鏈為基準(常以信息鏈為基準),5′端引物與位于待擴增片段5′端上的一小段DNA序列相同;3′端引物與位于待擴增片段3′端的一小段DNA序列互補。(1)引物設計的基本原則引物長度:15-30bp,常用為20bp左右。引物堿基:G+C含量以40-60%為宜,G+C太少擴增效果不佳,G+C過多易出現(xiàn)非特異條帶。ATGC比較好隨機分布,避免5個以上的嘌呤或嘧啶核苷酸的成串排列參照。引物內(nèi)部不應出現(xiàn)互補序列。兩個引物之間不應存在互補序列,尤其是避免3′端的互補重疊。引物與非特異擴增區(qū)的序列的同源性不要超過70%,...
PCR實驗技術(shù)中的3’RACE-PCR介紹:利用mRNA的3‘末端的poly(A)尾巴作為一個引物結(jié)合位點,以連有SMART寡核營酸序列通用接頭引物的Oligo(dT)30MN作為鎖定引物反轉(zhuǎn)錄合成標準1號鏈cDNA.然后用一個基因特異引物GSP1(genespecificprimer,GSP)作為上游引物,用一個含有部分接頭序列的通用引物UPM(universalprimer,UPM)作為下游引物,以cDNA1號鏈為模板,進行PCR循環(huán),把目的基因3‘末端的。DNA的片段擴增出來。 英瀚斯生物,專業(yè)分子檢測平臺做PCR檢測。 pcr檢測有哪些操作步驟?黑龍江熒光定量pcr檢測長片段...
PCR反應五要素:參加PCR反應的物質(zhì)主要有五種即:引物(PCR引物為DNA的片段,細胞內(nèi)DNA復制的引物為一段RNA鏈)、酶、dNTP、模板和緩沖液(其中需要Mg2+)。引物有多種設計方法,由PCR在實驗中的目的決定,但基本原則相同。PCR所用的酶主要有兩種來源:Taq和Pfu,分別來自兩種不同的噬熱菌。其中Taq擴增效率高但易發(fā)生錯配。Pfu擴增效率弱但有糾錯功能。所以實際使用時根據(jù)需要必須做不同的選擇。模板即擴增用的DNA,可以是任何來源,但有兩個原則,1號純度必須較高,第二濃度不能太高以免抑制。緩沖液的成分較為復雜,除水外一般包括四個有效成分:緩沖體系,一般使用HEPES或MOPS緩沖...
PCR實驗技術(shù)中的RT-PCR一步法和兩步法的優(yōu)缺點介紹:一步法:利用同一緩沖液,在同一體系中加入逆轉(zhuǎn)錄酶、引物、Taq酶、4種dNTP直接進行mRNA反轉(zhuǎn)錄與PCR擴增。發(fā)現(xiàn)Taq酶不僅具有DNA多聚酶的作用,而且具有反轉(zhuǎn)錄酶活性,可利用其雙重作用在同一體系中直接以mRNA為模板進行反轉(zhuǎn)錄和其后PCR擴增,從而使mRNA的PCR步驟更為簡化。所需樣品量減少到比較低限度,臨床小樣品的檢測非常有利。用一步法擴增可檢測出總RNA中小于1ng的低豐度mRNA.該法可用于低豐度mRNA的cDNA文庫的構(gòu)建及特異cDNA的克隆,并有可能與Taq酶的測序技術(shù)相組合,使得自動反轉(zhuǎn)錄、基因擴增與基因轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物的...
PCR是一種具有選擇性的體外擴增DNA的片段的方法。其特異性由兩個人工合成的引物DNA序列決定。所謂引物是指與待擴增核酸片段兩端互補的寡核苷酸,其本質(zhì)是ssDNA(單鏈DNA)的片段。指在引物指導下由酶催化的對特定模板(克隆或基因組DNA)的擴增反應,是模擬體內(nèi)DNA復制過程,在體外特異性擴增基因片段的一種技術(shù),在分子生物學中有普遍的應用,包括用于DNA作圖、DNA測序、分子系統(tǒng)遺傳學等。CR技術(shù)的基本原理類似于DNA的天然復制過程,其特異性依賴于與靶序列兩端互補的寡核苷酸引物。DNA的半保留復制是生物進化和傳代的重要途徑。雙鏈DNA在多種酶的作用下可以變性解旋成單鏈,在DNA聚合酶的參與下,...
PCR實驗技術(shù)中的反向PCR(InversePCR)介紹:反向PCR起初設計用于確定臨近未知區(qū)域的序列。反向PCR有助于研究一個基因的啟動子序列;致*染色體重排如基因融合、異位或轉(zhuǎn)移;及病毒基因的整合。之所以稱為反向PCR,是因為引物設計用于向兩邊延伸而不像常規(guī)PCR中朝著彼此延伸。如今,反向PCR常用于定點突變,復制一個具有預期突變的目的質(zhì)粒。在研究基因組DNA未知序列的傳統(tǒng)實驗流程中,限制性內(nèi)切酶消化和連接先于反向PCR,接著對PCR擴增子進行測序。對于gDNA消化,需選擇一種限制性內(nèi)切酶進行酶切以獲得合適長度可自連的片段。同時,所選擇的內(nèi)切酶不應該切割已知序列,所以連接發(fā)生于側(cè)翼的未知序...
pcr是一種在體外擴增特定DNA序列的技術(shù)方法,通過與特定DNA區(qū)域兩端互補的寡核苷酸為引物(primer)在試管中DNA聚合酶選擇性地單獨復制合成介于兩引物直接的基因片段,如同DNA復制中的半保留復制一樣,新合成的基因片段與模板鏈形成新的DNA雙鏈,經(jīng)反復的變性(denature)引物退火(anerling)和引物延伸(extention)三步循環(huán),前一循環(huán)合成的DNA鏈成為下一循環(huán)引物結(jié)合的模板,每循環(huán)一次,反應體系的DNA的量就增加一倍,20-30次反復循環(huán),即可由微量的DNA模板開始獲得大量的DNA特異片段。近年來,PCR迅速發(fā)展,已深入生命科學的各個領域,技術(shù)方法不端完善,基本的PC...
PCR實驗技術(shù)中的快速PCR(FastPCR)介紹:在快速PCR中,通過縮減PCR步驟所需的時間來完成更快的擴增,而不影響擴增產(chǎn)量和效率。快速循環(huán)條件尤其適用于均有高擴增能力的DNA聚合酶,這種聚合酶在每次結(jié)合中可引入更多的核苷酸。高擴增能力的聚合酶可保持高擴增效率,而PCR延伸時間是Taq聚合酶(低擴增能力)延伸時間的1/2到1/3(圖4)。通過將引物退火和延伸(如果溫度只相差幾度)合并成一步,PCR反應時間可進一步縮短。這個方案也被稱為兩步PCR方案。英瀚斯生物pcr,不只是檢測,還有專業(yè)數(shù)據(jù)分析。新疆細胞pcr公司PCR實驗室設計的中心問題是如何避免污染。在實際工作中,常見的有以下幾種污...
PCR的假陽性主要原因之一出現(xiàn)非特異性擴增帶:PCR擴增后出現(xiàn)的條帶與預計的大小不一致,或大或小,或者同時出現(xiàn)特異性擴增帶與非特異性擴增帶。非特異性條帶的出現(xiàn),其原因:一是引物與靶序列不完全互補、或引物聚合形成二聚體。二是Mg2+離子濃度過高、退火溫度過低,及PCR循環(huán)次數(shù)過多有關。其次是酶的質(zhì)和量,往往一些來源的酶易出現(xiàn)非特異條帶而另一來源的酶則不出現(xiàn),酶量過多有時也會出現(xiàn)非特異性擴增。其對策有:必要時重新設計引物。減低酶量或調(diào)換另一來源的酶。降低引物量,適當增加模板量,減少循環(huán)次數(shù)。適當提高退火溫度或采用二溫度點法(93℃變性,65℃左右退火與延伸)。PCR的假陽性主要原因之一出現(xiàn)片狀拖帶...
PCR在**和遺傳病方面也有一定的應用。*基因的表達增加和突變,在許多**早期和良性的階段就可出現(xiàn)。PCR技術(shù)不但能有效的檢測基因的突變,而且能準確檢測*基因的表達量,可據(jù)此進行早期診斷、分型、分期和預后判斷。幾乎所有慢性骨髓性白血病患者都可檢測到原*基因易位導致的BCR/ABL融合基因形成,定量PCR技術(shù)可通過檢測BCR/ABL融合基因的表達確定微量殘余惡性細胞存在的數(shù)量,以此作為***效果和估計復發(fā)的危險性的依據(jù)。一些病毒致*作用也與病毒載量有關,EB病毒載量的FQ-PCR檢測結(jié)果已被用于鼻咽*早期發(fā)現(xiàn)和隨訪。PCR技術(shù)初次臨床應用就是從檢測鐮狀細胞和β-地中海貧血的基因突變開始的?;虻?..
PCR實驗技術(shù)中的定量PCR介紹:由于序列擴增的產(chǎn)量依賴于模板DNA的量,所以PCR常用于對樣品中DNA進行定量,常用的應用是基因表達的定量。終點法PCR是一種可能的方法,但其有較大的缺點,通過凝膠電泳來檢測產(chǎn)量,檢測的靈敏度非常有限。更重要的是,使用終點PCR是在PCR反應結(jié)束后進行定量,此時擴增已經(jīng)達到平臺期,DNA凝膠染色的強度與DNA起始量不成線性關系。盡管如此,通過終點法PCR可以對基因表達進行半定量,可以使用一系列稀釋程度不同的DNA樣本作為模板起始量,或者在特定的PCR循環(huán)處獲取擴增產(chǎn)物,然后通過凝膠顯色強度來估計基因的表達量。熒光定量PCR檢測原理是什么?陜西有哪些pcr公司P...
PCR由變性--退火--延伸三個基本反應步驟構(gòu)成: 1、模板DNA的變性:模板DNA經(jīng)加熱至93℃左右一定時間后,使模板DNA雙鏈或經(jīng)PCR擴增形成的雙鏈DNA解離,使之成為單鏈,以便它與引物結(jié)合,為下輪反應作準備。 2、模板DNA與引物的退火(復性):模板DNA經(jīng)加熱變性成單鏈后,溫度降至55℃左右,引物與模板DNA單鏈的互補序列配對結(jié)合。3、引物的延伸:DNA模板--引物結(jié)合物在72℃、DNA聚合酶(如TaqDNA聚合酶)的作用下,以dNTP為反應原料,靶序列為模板,按堿基互補配對與半保留復制原理,合成一條新的與模板DNA鏈互補的半保留復制鏈。重復循環(huán)變性--退火--延伸三...
PCR實驗技術(shù)中的連接酶鏈反應(Ligasechainreaction,LCR)介紹:連接酶鏈反應(Ligasechainreaction,LCR),是一種新的DNA體外擴增和檢測技術(shù),主要用于點突變的研究及靶基因的擴增。連接酶鏈反應是Backman1997年為檢出靶基因序列中的點突變而設計發(fā)明,并申報了**。1988年Landegren也進行了該項研究。1988年Backman等又因分離熱穩(wěn)定的連接酶,1991年Backman和Barany分別用耐熱DNA連接酶進行了LCR試驗。耐熱DNA連接酶可以在熱循環(huán)中保持活性,提高連接反應的特異性,排除了背景擴增和免除了不斷補充酶的繁瑣程序。如何挑選...
PCR實驗技術(shù)中的熱啟動PCR介紹:熱啟動PCR是除了好的引物設計之外,提高PCR特異性的重要的方法之一。盡管TaqDNA聚合酶的比較好延伸溫度在72℃,聚合酶在室溫仍然有活性。因此,在進行PCR反應配制過程中,以及在熱循環(huán)剛開始,保溫溫度低于退火溫度時會產(chǎn)生非特異性的產(chǎn)物。這些非特異性產(chǎn)物一旦形成,就會被有效擴增。在用于引物設計的位點因為遺傳元件的定位而受限時,如site-directed突變、表達克隆或用于DNA工程的遺傳元件的構(gòu)建和操作,熱啟動PCR尤為有效。英瀚斯生物分子生物學平臺,配備專業(yè)定量pcr儀。江蘇組織pcr要多久PCR實驗技術(shù)中的直接PCR(DirectPCR)介紹:直接P...
PCR實驗技術(shù)中的RT-PCR一步法和兩步法的優(yōu)缺點介紹:一步法:利用同一緩沖液,在同一體系中加入逆轉(zhuǎn)錄酶、引物、Taq酶、4種dNTP直接進行mRNA反轉(zhuǎn)錄與PCR擴增。發(fā)現(xiàn)Taq酶不僅具有DNA多聚酶的作用,而且具有反轉(zhuǎn)錄酶活性,可利用其雙重作用在同一體系中直接以mRNA為模板進行反轉(zhuǎn)錄和其后PCR擴增,從而使mRNA的PCR步驟更為簡化。所需樣品量減少到比較低限度,臨床小樣品的檢測非常有利。用一步法擴增可檢測出總RNA中小于1ng的低豐度mRNA.該法可用于低豐度mRNA的cDNA文庫的構(gòu)建及特異cDNA的克隆,并有可能與Taq酶的測序技術(shù)相組合,使得自動反轉(zhuǎn)錄、基因擴增與基因轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物的...
PCR實驗技術(shù)中的熱啟動PCR介紹:熱啟動PCR是除了好的引物設計之外,提高PCR特異性的重要的方法之一。盡管TaqDNA聚合酶的比較好延伸溫度在72℃,聚合酶在室溫仍然有活性。因此,在進行PCR反應配制過程中,以及在熱循環(huán)剛開始,保溫溫度低于退火溫度時會產(chǎn)生非特異性的產(chǎn)物。這些非特異性產(chǎn)物一旦形成,就會被有效擴增。在用于引物設計的位點因為遺傳元件的定位而受限時,如site-directed突變、表達克隆或用于DNA工程的遺傳元件的構(gòu)建和操作,熱啟動PCR尤為有效。英瀚斯生物pcr檢測,提供原始數(shù)據(jù)和完整報告。湖北有哪些pcr怎么樣pcr是一種在體外擴增特定DNA序列的技術(shù)方法,通過與特定DN...
PCR實驗技術(shù)中的反向PCR(InversePCR)介紹:反向PCR起初設計用于確定臨近未知區(qū)域的序列。反向PCR有助于研究一個基因的啟動子序列;致*染色體重排如基因融合、異位或轉(zhuǎn)移;及病毒基因的整合。之所以稱為反向PCR,是因為引物設計用于向兩邊延伸而不像常規(guī)PCR中朝著彼此延伸。如今,反向PCR常用于定點突變,復制一個具有預期突變的目的質(zhì)粒。在研究基因組DNA未知序列的傳統(tǒng)實驗流程中,限制性內(nèi)切酶消化和連接先于反向PCR,接著對PCR擴增子進行測序。對于gDNA消化,需選擇一種限制性內(nèi)切酶進行酶切以獲得合適長度可自連的片段。同時,所選擇的內(nèi)切酶不應該切割已知序列,所以連接發(fā)生于側(cè)翼的未知序...
長片段PCR通常指擴增大于5kb的DNA的片段。長片段PCR傳統(tǒng)上使用TaqDNA聚合酶(為了快速延伸)和高保真酶(為了準確度)的混合物。隨著高合成能力、高保真DNA聚合酶的發(fā)明,長片段PCR現(xiàn)在可在短時間內(nèi)高準確性的完成。通過與一個強DNA結(jié)合蛋白的結(jié)合,聚合酶可獲得高擴增能力,可在短時間內(nèi)擴增長片段(如>20kbgDNA的片段)。初次之外,極高保真度(如>100xTaq)可確保長片段擴增的低錯誤率。當擴增>10kb的片段時,PCR實驗方案可能需要在以下5個關鍵位置進行適當優(yōu)化:確保使用高質(zhì)量、高純度的DNA樣本。如果DNA聚合酶的熱穩(wěn)定較低,使用更多量的DNA聚合酶以彌補多次循環(huán)中的聚合酶...
PCR反應的特異性決定因素為:①引物與模板DNA特異正確的結(jié)合;②堿基配對原則;③TaqDNA聚合酶合成反應的忠實性;④靶基因的特異性與保守性。其中引物與模板的正確結(jié)合是關鍵。引物與模板的結(jié)合及引物鏈的延伸是遵循堿基配對原則的。聚合酶合成反應的忠實性及TaqDNA聚合酶耐高溫性,使反應中模板與引物的結(jié)合(復性)可以在較高的溫度下進行,結(jié)合的特異性明顯增加,被擴增的靶基因片段也就能保持很高的正確度。再通過選擇特異性和保守性高的靶基因區(qū),其特異性程度就更高。英瀚斯生物可承接臨床樣本、動物組織、細胞樣本各類pcr檢測。湖南細胞pcr原理PCR實驗技術(shù)中的反向PCR介紹:反向PCR的目的在于擴增一段已...
PCR由變性--退火--延伸三個基本反應步驟構(gòu)成: 1、模板DNA的變性:模板DNA經(jīng)加熱至93℃左右一定時間后,使模板DNA雙鏈或經(jīng)PCR擴增形成的雙鏈DNA解離,使之成為單鏈,以便它與引物結(jié)合,為下輪反應作準備。 2、模板DNA與引物的退火(復性):模板DNA經(jīng)加熱變性成單鏈后,溫度降至55℃左右,引物與模板DNA單鏈的互補序列配對結(jié)合。3、引物的延伸:DNA模板--引物結(jié)合物在72℃、DNA聚合酶(如TaqDNA聚合酶)的作用下,以dNTP為反應原料,靶序列為模板,按堿基互補配對與半保留復制原理,合成一條新的與模板DNA鏈互補的半保留復制鏈。重復循環(huán)變性--退火--延伸三...