PCR的假陽性主要原因之一出現(xiàn)非特異性擴增帶:PCR擴增后出現(xiàn)的條帶與預計的大小不一致,或大或小,或者同時出現(xiàn)特異性擴增帶與非特異性擴增帶。非特異性條帶的出現(xiàn),其原因:一是引物與靶序列不完全互補、或引物聚合形成二聚體。二是Mg2+離子濃度過高、退火溫度過低,及PCR循環(huán)次數(shù)過多有關。其次是酶的質和量,往往一些來源的酶易出現(xiàn)非特異條帶而另一來源的酶則不出現(xiàn),酶量過多有時也會出現(xiàn)非特異性擴增。其對策有:必要時重新設計引物。減低酶量或調換另一來源的酶。降低引物量,適當增加模板量,減少循環(huán)次數(shù)。適當提高退火溫度或采用二溫度點法(93℃變性,65℃左右退火與延伸)。PCR的假陽性主要原因之一出現(xiàn)片狀拖帶或涂抹帶:PCR擴增有時出現(xiàn)涂抹帶或片狀帶或地毯樣帶。其原因往往由于酶量過多或酶的質量差,dNTP濃度過高,Mg2+濃度過高,退火溫度過低,循環(huán)次數(shù)過多引起。其對策有:減少酶量,或調換另一來源的酶。②減少dNTP的濃度。適當降低Mg2+濃度。增加模板量,減少循環(huán)次數(shù)。pcr檢測實驗成功的訣竅!新疆常見pcr哪家好
PCR實驗技術中的高GC含量PCR(GC-richPCR)介紹:具有高GC含量(>65%)的模板由于G和C堿基間的強氫鍵影響,比較難以擴增。高GC含量序列同時也涉及二級結構。因此,高GC含量序列可使DNA聚合酶在擴增時卡住,從而影響了DNA的合成。為了擴增高GC含量片段,雙鏈模板必須分離,以便引物結合及DNA聚合酶讀取序列。為了克服強GC相互作用,較常用的方法是依靠PCR添加劑或共溶劑來幫助DNA變性(圖6A),如DMSO。這些試劑通常會降低引物的Tm,所以退火溫度也需做相應的調整。高合成能力的DNA聚合酶由于其與模板的強結合能力,有助于高GC含量模板的PCR擴增(圖6B)。高熱穩(wěn)定性DNA聚合酶也有益于高GC含量PCR擴增,因為更高的變性溫度(如98℃代替95℃)可促進解鏈和PCR擴增。安徽pcr價格英瀚斯生物,專業(yè)分子檢測平臺,高質量pcr檢測。
PCR實驗技術中的多重PCR(MultiplexPCR))介紹:多重PCR可實現(xiàn)在同一反應管中同時擴增多個不同的片段。多重PCR不僅意味著節(jié)約時間、試劑和樣本,同時使得多個擴增子進行同時比較成為可能。當一個反應管中存在多個引物對時,如在多重PCR中,非特異性擴增和擴增效率的降低是較關注的問題,因為反應的優(yōu)化不可能針對所有的引物對和片段。因此,引物的設計至關重要,以減少錯配引起的非特異性擴增。引物序列對于目標片段應該是獨特的,且所有引物的Tm值差異應在5℃內。在進行多重PCR前,每個引物對應在單個反應中驗證其特異性和擴增效率。而且,不同大小的擴增子應在凝膠電泳中可區(qū)分開,以便鑒定。除了引物設計和擴增子大小,熱啟動DNA聚合酶和特殊優(yōu)化的PCR緩沖液對于多重PCR也是必需的,它們可有助于擴增的成功率和擴增的特異性。
PCR的特異性影響因素有很多,在此我們作一歸納,供大家參考:①退火步驟的嚴格性:提高退火溫度可以減少不匹配的雜交,從而提高特異性。②減短退火時間及延伸時間可以減少錯誤引發(fā)及錯誤延伸。③引物二聚體是較常見的副產(chǎn)品,降低引物及酶的濃度也可以減少錯誤引發(fā),尤其是引物的二聚化。④改變mgcl2(有時kcl)濃度可以改進特異性,這可能是提高反應嚴格性或者對taq酶的直接作用。一般認為PCR產(chǎn)物應在48h以內完成電泳檢測,有些比較好于當日電泳檢測,大于48h后帶型就會出現(xiàn)不規(guī)則,甚至消失。pcr檢測知識要點總結匯總。
PCR實驗技術中的Touch-downPCR介紹:Touch-downPCR又稱降落PCR.即選定一個溫度范圍,如50—35℃,每降1-2℃進行1-2個循環(huán),然后在50度下進行15個循環(huán)。Touch-down的原理隨著退火溫度的降低,特異性逐步降低,但特異性條帶在溫度較高時已經(jīng)擴增出來,其濃度遠遠超過非特異性條帶,隨著退火溫度的降低,特異性條帶優(yōu)先被擴增。選擇初始復性溫度的原則起始復性溫度應該比引物的Tm值高出5-10度,然后每個循環(huán)遞減1-2度Touch-downPCR的應用范圍lowcopyoftargetedDNA;highdegreedegeneracy(orlessspecific)ofthefirstsetofprimers;做pcr檢測,需要注意哪些事項?黑龍江細胞pcr實驗
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PCR方法主要可以分為三類:終點PCR、qPCR和dPCR。終點PCR終點PCR是較原始、較簡單的PCR方法,如今仍在被我們普遍使用。使用者只能在PCR反應結束之后,通過凝膠電泳、毛細管電泳等方法對產(chǎn)物進行檢測。終點PCR本身是無法定量的,因為該反應產(chǎn)出的DNA量不一定能反映較初情況。舉例來說,不同樣品和序列的擴增效率是有差異的。qPCR和dPCR研究者們通過兩種途徑克服了PCR定量分析的挑戰(zhàn):實時定量PCR(qPCR)和數(shù)字PCR(dPCR)。qPCR主要是利用插入性染料或熒光探針(比如TaqMan),人們可以通過監(jiān)控PCR過程中的熒光強度比較多個樣品的DNA水平。數(shù)字PCR(dPCR)的基本工作原理很簡單,先將樣品劃分為多個PCR反應,每個反應較多只含有一個模板。然后通過計數(shù)正負反應來確定初始樣品中模板分子的數(shù)量。新疆常見pcr哪家好
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