湖北免疫共沉淀CoIP

來源: 發(fā)布時間:2024-11-14

免疫共沉淀(Co-Immunoprecipitation,Co-IP)的局限性主要包括:可能檢測不到低親和力和瞬間的相互作用:低親和力和瞬間的蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)之間的相互作用可能檢測不到,這可能導(dǎo)致某些重要的相互作用被遺漏。不能確保直接相互作用:免疫共沉淀不能保證沉淀的蛋白復(fù)合物是由直接相互作用的兩種蛋白組成。兩種蛋白質(zhì)的結(jié)合可能不是直接結(jié)合,而可能有第三者在中間起橋梁作用。靈敏度限制:免疫共沉淀的靈敏度不如某些其他技術(shù),如親和色譜,這可能影響到對低豐度蛋白或微弱相互作用的研究。樣本純度要求高:如果將蛋白復(fù)合物直接進(jìn)行質(zhì)譜分析,需要得到較高純度和濃度的蛋白復(fù)合物樣品,這并非易事,并且成本較高。對抗體要求高:用于免疫共沉淀的抗體不是總是與操作相合適,與Western blotting或者 ELISA相比容易出現(xiàn)假陽性反應(yīng)。免疫共沉淀法可信度高,可發(fā)現(xiàn)新蛋白搭檔,但存局限,需結(jié)合其他方法驗證。湖北免疫共沉淀CoIP

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免疫共沉淀CoIP實驗,細(xì)胞的收集及裂解方法如下:

收集2E7個細(xì)胞樣品,加入PBS洗滌細(xì)胞,離心后棄上清收集細(xì)胞沉淀。

準(zhǔn)備500μl預(yù)冷的CellLysisBuffer,分別加入5μlProteaseInhibitor、5μlPMSF,混勻后加進(jìn)細(xì)胞沉淀中吹打均勻,冰上孵育30min,期間渦旋混勻幾次。

4℃,12000rpm離心10min,取上清,進(jìn)行蛋白濃度測定及后續(xù)實驗。廣州基云生物,在IP互作組檢測和關(guān)鍵機(jī)制分子篩選驗證領(lǐng)域,具有豐富的經(jīng)驗,助力您的互作機(jī)制研究,歡迎垂詢合作。 北京互作機(jī)制CoIP-MS檢測蛋白質(zhì)與蛋白質(zhì)分子互作實驗方法介紹。

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Co-IP(免疫共沉淀)實驗操作的要點。1.細(xì)胞裂解:確保采用溫和的裂解條件,以保持細(xì)胞內(nèi)存在的蛋白間相互作用。使用非變性裂解液進(jìn)行裂解和洗滌。2.抗體固定:選擇經(jīng)過驗證的抗體,以減少假陽性結(jié)果。注意抗體與緩沖液的比例,避免抗體稀釋過度或過多。3.抗體結(jié)合:將抗體與樣品混合,確??贵w與目標(biāo)蛋白充分結(jié)合。4.磁珠或瓊脂糖添加:將抗體固定的磁珠或瓊脂糖加入混合物中,使其與抗體-蛋白復(fù)合物結(jié)合。5.沉淀:通過磁珠或瓊脂糖的沉降,分離出蛋白復(fù)合物。6.洗脫:使用洗脫緩沖液將蛋白質(zhì)復(fù)合物從磁珠或瓊脂糖上洗脫下來。7.增加洗脫之前的洗滌次數(shù)或在免疫共沉淀緩沖液中加入Triton X-100,以降低非特異性結(jié)合。遵循這些操作要點,可以確保Co-IP實驗的準(zhǔn)確性和可靠性,從而得到準(zhǔn)確的蛋白質(zhì)相互作用結(jié)果。

CoIP-Mass和CoIP-WB檢測要點:

互作蛋白篩選和驗證:數(shù)據(jù)分析以非標(biāo)定量信號強(qiáng)度(LFQintensity和FC>10)作為強(qiáng)陽篩選,以文獻(xiàn)查閱,功能匹配,批量CoIP-WB驗證,提高驗證成功率。理想CoIP-MS結(jié)果的蛋白定量都到超過1000種蛋白。其中絕大部分蛋白為非特異結(jié)合或背景蛋白。以目的蛋白的富集信號強(qiáng)度和差異倍數(shù)作為參考(相對強(qiáng)信號和差異),分析實驗組中明顯定量較高且差異較大的蛋白,作為重要候選蛋白。同時對重要候選蛋白進(jìn)行STRING互作分析,文獻(xiàn)分析,目的蛋白功能匹配分析,選擇Top的4-5個蛋白進(jìn)行CoIP-WB驗證,提高CoIP-WB成功率。 Co-IP外源檢測引入外源蛋白驗證互作,敏感度高但需嚴(yán)控條件,結(jié)合內(nèi)源檢測更準(zhǔn)確!

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Co-IP實驗原理主要基于抗原-抗體特異性結(jié)合以及蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用。具體來說,當(dāng)細(xì)胞在非變性條件下被裂解時,細(xì)胞內(nèi)存在的許多蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)間的相互作用會被保留下來。實驗中,利用靶蛋白的特異性抗體與靶蛋白結(jié)合形成復(fù)合物,然后通過免疫反應(yīng)將復(fù)合物與固定在固相支持物(如瓊脂糖珠或磁珠)上的親和劑(如Protein A/G)結(jié)合。經(jīng)過一系列的洗滌步驟后,可以去除非特異性結(jié)合的蛋白質(zhì),將目標(biāo)蛋白質(zhì)及其相互作用的蛋白質(zhì)富集在固相支持物上。通過電泳、質(zhì)譜分析等技術(shù)對富集的蛋白質(zhì)進(jìn)行分析,從而鑒定和定量相互作用的蛋白質(zhì)。Co-IP(免疫共沉淀)技術(shù)應(yīng)用場景。天津互作機(jī)制CoIP-MS

Co-IP技術(shù)廣泛應(yīng)用于生物醫(yī)學(xué)、藥物研發(fā)、蛋白質(zhì)組學(xué)等領(lǐng)域,助力科研人員探索生命奧秘!湖北免疫共沉淀CoIP

免疫共沉淀(Co-Immunoprecipitation)是以抗體和抗原之間的專一性作用為基礎(chǔ)的用于研究蛋白質(zhì)相互作用的經(jīng)典方法。是確定兩種蛋白質(zhì)在完整細(xì)胞內(nèi)生理性相互作用的有效方法。當(dāng)細(xì)胞在非變性條件下被裂解時,完整細(xì)胞內(nèi)存在的許多蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)間的相互作用被保留了下來。當(dāng)用預(yù)先固化在agarose beads上的蛋白質(zhì)A的抗體免疫沉淀A蛋白,那么與A蛋白在體內(nèi)結(jié)合的蛋白質(zhì)B也能一起沉淀下來。再通過蛋白變性分離,對B蛋白進(jìn)行檢測,進(jìn)而證明兩者間的相互作用。這種方法得到的目的蛋白是在細(xì)胞內(nèi)與興趣蛋白天然結(jié)合的,符合體內(nèi)實際情況,得到的結(jié)果可信度高。這種方法常用于測定兩種目標(biāo)蛋白質(zhì)是否在體內(nèi)結(jié)合;也可用于確定一種特定蛋白質(zhì)的新的作用搭檔。湖北免疫共沉淀CoIP

標(biāo)簽: CoIP 蛋白組芯片 ChIP RIP