江蘇PNGaseF去糖基化酶疾病機理研究

Genvois的SialEXO產(chǎn)品是唾液酸酶，用于N-和O-糖基化蛋白的有效去唾液酸化。SialEXO凍干由兩種唾液酸酶組成，每種唾液酸酶都具有獨特的活性，并且它們同時起作用。一種酶對α2-3、α2-6和α2-8連接的唾液酸具有很好的活性，另一種酶（SialEXO 2-3）通過α2-3-鍵快速水解唾液酸。SialEXO凍干可在2小時內(nèi)去除天然蛋白質(zhì)上的所有唾液酸。SialEXO在天然條件下水解糖蛋白，在pH值范圍為6.5至9時顯示出活性。這些酶來源于Akkermansia muciniphila，并在大腸桿菌中表達。兩種酶都含有 His 標簽，酶的分子量為 43 kDa 和 66 kDa。 由于GlycOCATCH樹脂和O-糖蛋白/肽之間的強相互作用。江蘇PNGaseF去糖基化酶疾病機理研究

Genovis的OglyZOR 是一種內(nèi)切糖苷酶（O-糖苷酶），可特異性水解天然糖蛋白上的he心 1 O-聚糖。OglyZOR 用于去除 O-糖，用于糖分析、確認 O-糖的存在和降低樣品的異質(zhì)性。Genovis的OglyZOR 是一種內(nèi)切糖苷酶（內(nèi)切-α-N-乙酰半乳糖氨酸酶），可催化來自天然糖蛋白的he心 1 和有限程度的he心 3 O-聚糖的水解。 OglyZOR酶活性需要去除唾液酸，因此，由唾液酸酶混合物組成的唾液酸凍干，用于去除α2-3，α2-6和α2-8連接的唾液酸，與OglyZOR一起提供。在pH 6.5至7.5和37°C下獲得良好活性。青海固定化小柱形式PNGaseF去糖基化酶瑞典GenovisGalactEXO由兩種半乳糖苷酶組成，均帶有His標簽，組分的分子量為87 kDa和109 kDa。

使用Genovis的OpeRATOR圖譜O-聚糖位點對依那西普進行LC-MS分析：依那西普是一種 Fc 融合蛋白，具有高度 O-糖基化的鉸鏈區(qū)域。將依那西普與OpeRAT一起孵育，并使用LC-MS/MS分析所得糖肽。促紅xibao生成素 （EPO） 是一種具有單個 O-糖基化位點的 ~30 kDa 糖蛋白。在PNGase F去除N-糖并使用SialEXO進行去唾液酸化后，用OpeRAT消化天然蛋白，并通過反相LC-MS分析所得蛋白質(zhì)片段。O-糖基化的位點可以通過識別OeRATOR消化位點直接推斷出來。為了獲得良好性能，需要去除唾液酸助劑，因此購買中包括2000個單位（如果SialEXO凍干）。1. 用于方法開發(fā)的靈活產(chǎn)品形式；2. 可以結合酶以提高效率；3. 適用于自動化工作流程；4. 即用型 - 只需加水即可。O-聚糖是OpeRATOR活性所必需的，而該酶在N-聚糖上沒有活性。OpeRATOR和SialEXO處理后，O-糖基化蛋白被消化成攜帶O-聚糖的肽。消化發(fā)生在O-糖基化位點的N端。

為了證明Genovis的PNGase F凍干和PNGase F固定在各種底物上的去糖基化能力，用PNGase F凍干或PNGase F固定化處理了一系列糖蛋白。使用天然反應條件在一小時內(nèi)有效去除曲妥珠單抗和依那西普上的所有N-糖，以及西妥昔單抗上的Fc-糖。當加入RapiGest?并在變性條件下進行反應時，西妥昔單抗的所有N-聚糖（包括Fab-聚糖）在PNGase F固定化10分鐘內(nèi)完全去除，PNGase F固定化15分鐘內(nèi)完全去除。在變性反應條件下，PNGase F 在 30 分鐘內(nèi)成功將更復雜的 F 融合蛋白阿巴西普和阿柏西普去糖基化。使用變性和還原反應條件，將常用的糖蛋白標準品RNase B在10或15分鐘內(nèi)完全去糖基化，分別使用PNGase F凍干或PNGase F固定化。在天然和變性條件下生成的去糖基化樣品與LC-MS分析兼容。實現(xiàn)高通量 N-糖去除，簡化糖蛋白底物的下游分析。

糖蛋白性能測試：O-聚糖的巖藻糖基化參與功能上重要的聚糖表位的合成，例如血型抗原和劉易斯結構。分析用這種復雜的聚糖結構修飾的糖蛋白可能具有挑戰(zhàn)性，需要高效和特異性的酶工具。我們在許多糖基工程TNFR蛋白上測試了Genovis的FucosEXO，這些蛋白攜帶多達11個O-聚糖，這些O-聚糖以不同的鍵裝飾。我們將該活性與其他市售巖藻苷酶進行了比較。FucosEXO 能夠在 1 小時內(nèi)對所有三種 TNFR 蛋白進行去巖藻糖磺酸處理，而用其他巖藻糖酶處理導致部分去除巖藻糖或根本沒有去除。PNGase F 以凍干粉的形式提供，裝在 1000 或 5 x 1000 單位小瓶中，分別用于消化 1 mg 或 5 x 1 mg 糖蛋白。陜西凍干粉形式PNGaseF去糖基化酶瑞典Genovis

GlycOCATCH親和純化以方便的離心柱形式提供，包含4 個 GlycOCATCH。江蘇PNGaseF去糖基化酶疾病機理研究

Fc N-聚糖在抗體的效應功能中起著至關重要的作用，但可能會增加蛋白質(zhì)表征測定的復雜性。在天然條件下用PNGase F去除Fc N-糖可以表征游離N-糖以及去糖基化抗體的功能和結構。 為了證明PNGase F固定化和PNGase F凍干在天然反應條件下有效去除Fc N-聚糖，對zhiliao性抗體曲妥珠單抗進行了處理。圖2中的質(zhì)量數(shù)偏移表明，在37°C下用Genovis的PNGase F凍干或PNGase F固定化孵育1小時后，曲妥珠單抗上的Fc N-聚糖成功去除，與在溶液中用PNGase F凍干處理的樣品相比，沒有酶干擾用PNGase F固定處理的樣品的分析。江蘇PNGaseF去糖基化酶疾病機理研究