河南N-聚糖水解酶PNGaseF去糖基化酶蛋白質(zhì)組學(xué)研究

Genovis的ImpaRATOR? 和 OpeRATOR? - 兩種協(xié)同的作用：O-糖蛋白酶。使用ImpaRATOR或OpeRATOR消化后分析依那西普重糖基化區(qū)域O-聚糖位點(diǎn)的覆蓋率（圖3）。使用OpeRATOR鑒定對(duì)應(yīng)于所有13個(gè)O-聚糖位點(diǎn)的肽，而使用ImpaRATOR只能明確鑒定10個(gè)位點(diǎn)。ImpaRATOR 可能比 OpeRATOR （1） 具有更具選擇性的氨基酸序列偏好，此處由 S186 和 T245 位點(diǎn)缺乏消化來(lái)表明。此外，ImpaRATOR 在兩個(gè)相鄰的 O-糖基化氨基酸之間顯示出有限的裂解，如 S213 位點(diǎn)酶解肽的缺乏以及 T200 和 T217 位點(diǎn)酶解肽的低強(qiáng)度所證明的那樣。在OpeRATOR酶解樣品（T184-S199和T200-H204;圖2b和d），而在ImpaRATOR消化的樣品中，具有漏裂的相應(yīng)肽（S184-H204）的強(qiáng)度更高。 雖然OpeRATOR顯示出更高的O-聚糖位點(diǎn)覆蓋率，但使用ImpaRATOR進(jìn)行消化可以表征O-聚糖結(jié)構(gòu)，包括唾液酸化物種。例如，條形圖插入顯示了兩種糖肽 T184-V198 和 T205-P207 的 O-聚糖種類。這應(yīng)該與使用OpeRATOR的消化進(jìn)行比較，在OpeRATOR中，必須去除唾液酸才能產(chǎn)生酶活性，這意味著有關(guān)唾液酸化的信息丟失。總而言之，ImpaRATOR 和 OpeRATOR 酶共同提供了有關(guān)聚糖組成和 O-聚糖位點(diǎn)的完整信息。GalactEXO中的酶來(lái)源于Akkermansia muciniphila，并在大腸桿菌中表達(dá)。河南N-聚糖水解酶PNGaseF去糖基化酶蛋白質(zhì)組學(xué)研究

用于糖蛋白去唾液酸化的凍干酶混合物。Genovis的SialEXO 凍干劑以凍干粉的形式提供，裝在 2000 個(gè)單位的小瓶中，用于 2 mg 糖蛋白的去唾液酸化。1. 用于方法開發(fā)的靈活格式；2. 可以結(jié)合酶以提高效率；3. 適用于自動(dòng)化工作流程；4. 即用型 - 只需加水即可。用于水解ɑ2-3-連接唾液酸的凍干酶。 Genovis的SialEXO 2-3凍干劑以凍干粉末的形式提供，裝在500個(gè)單位的小瓶中，用于0.5mg糖蛋白的去唾液酸化。 與唾液酸酶混合物 SialEXO 相比，SialEXO 2-3 是一種 α2-3 特異性唾液酸酶，允許對(duì) α2-3 連接的唾液酸進(jìn)行靶向分析。O-和N-糖基化蛋白的高效α2-3去唾液酸化可以在1小時(shí)內(nèi)實(shí)現(xiàn)。青海瑞典GenovisPNGaseF去糖基化酶瑞典Genovis依那西普是一種 Fc 融合蛋白，具有高度 O-糖基化的鉸鏈區(qū)域。

GlycOCATCH用于純化粘蛋白型O-糖基化蛋白和肽。它是基于無(wú)活性的Genovis的OpeRATOR?酶，該酶經(jīng)過工程改造，可以高親和力結(jié)合O-糖基化蛋白和肽。GlycOCATCH的應(yīng)用包括O糖蛋白和肽的特異性富集或去除、糖組學(xué)、復(fù)雜樣品的研究和生物制藥的表征。1. 粘蛋白型O-糖基化蛋白和肽的特異性富集；2. 可靠 - 高親和力結(jié)合;3. 快速且易于使用的工作流程。不需要輔助因子或特殊緩沖液。GalNAcEXO中的酶來(lái)源于Akkermansia muciniphila，在大腸桿菌中表達(dá)，帶有His標(biāo)簽，分子量為52 kDa。1. 用于方法開發(fā)的靈活格式；2. 可以結(jié)合酶以提高效率；3. 適用于自動(dòng)化工作流程； 4. 即用型 - 只需加水即可！用于水解糖蛋白上GalNAc殘基的凍干酶。Genovis的GalNAcEXO凍干劑以凍干粉末的形式提供，裝在2000單位的小瓶中，用于水解2mg糖蛋白上的GalNAc殘基。

我們展示了使用兩種蛋白作為底物的OmniGLYZOR的性能。依那西普是一種 Fc 融合蛋白，含有 TNFα 受體的胞外結(jié)構(gòu)域。該結(jié)構(gòu)域用 2 個(gè) N-糖和 8-11 個(gè) 1 個(gè)具有不同程度唾液酸化的 O-聚糖修飾。在 37°C 下將這種重糖基化蛋白在 OmniGLYZOR Microspin 柱上孵育 1 小時(shí)，可完全去除所有 N-和 O-糖，如中級(jí) LC-MS 分析所示。促紅xibao生成素 （EPO） 是一種攜帶 3 個(gè) N-聚糖和 1 個(gè)he心 1 個(gè) O-聚糖的小蛋白質(zhì)，其總質(zhì)量的近 40% 由聚糖組成。O-連接聚糖通常存在于蛋白質(zhì)的暴露位置，因?yàn)樗鼈冊(cè)诘鞍踪|(zhì)折疊發(fā)生后附著。只有負(fù)責(zé)其合成的糖基轉(zhuǎn)移酶才能接觸到這些暴露的位點(diǎn)。采用合適的酶策略來(lái)去除這些GalNAc并簡(jiǎn)化生物制藥的表征。

GlycOCATCH設(shè)計(jì)用于特異性結(jié)合粘蛋白型O-糖基化蛋白和肽。親和樹脂基于無(wú)活性的Genovis的OpeRATOR酶，該酶經(jīng)過工程設(shè)計(jì)，可以高親和力結(jié)合O-糖基化蛋白和肽。 結(jié)合在pH 5-8的生理緩沖液中進(jìn)行。由于GlycOCATCH樹脂和O-糖蛋白/肽之間的強(qiáng)相互作用，可以用8M尿素進(jìn)行洗脫?；蛘?，可以使用活性O(shè)peRATOR酶進(jìn)行洗脫，該酶消化O-聚糖位點(diǎn)的N末端結(jié)合的O-糖蛋白。在后一種情況下，肽在天然條件下回收。OpeRATOR 凍干酶包含在購(gòu)買中。由于 O-糖蛋白上的旋亞氨酸化 O-聚糖與樹脂結(jié)合效率更高，因此唾液酸酶混合物 SialEXO 凍干也包含在購(gòu)買中。用于LC-MS分析之前制備樣品，以鑒定其他PTM或確認(rèn)氨基酸序列。天津凍干粉形式PNGaseF去糖基化酶糖生物學(xué)研究

ImpaRATOR 酶不會(huì)消化未修飾的絲氨酸或蘇氨酸殘基，也不會(huì)在糖蛋白的N-糖基化位點(diǎn)。河南N-聚糖水解酶PNGaseF去糖基化酶蛋白質(zhì)組學(xué)研究

genvois的OpeRATOR 是一種內(nèi)切蛋白酶，可催化直接靠近 O-聚糖的天然粘蛋白型 O-糖基化蛋白的肽鍵的水解。內(nèi)切蛋白酶具有高特異性，可消化絲氨酸或蘇氨酸殘基的O-聚糖N端的蛋白質(zhì)。 OpeRATOR 活性需要粘蛋白型的 O-聚糖，并且該酶不會(huì)用 N-連接聚糖消化糖蛋白。該酶對(duì)具有亞洲化he心1 O-聚糖的位點(diǎn)z活躍。它還消化唾液酸化的he心 1 和he心 3，但程度要低得多。為了獲得z佳性能，需要去除唾液酸，因此，SialEXO凍干（唾液酸酶混合物）包含在購(gòu)買中。 河南N-聚糖水解酶PNGaseF去糖基化酶蛋白質(zhì)組學(xué)研究