ArcticZymes Technologies提供獨(dú)特特性的鹽活性核酸酶(Salt Active Nucleases,SANs)系列產(chǎn)品,主要包含SAN HQ高鹽核酸酶和M-SAN HQ中鹽核酸酶。這兩款酶都是非特異核酸內(nèi)切酶,跟Benzonase一樣能高效降解任何形式(雙鏈、單鏈、線狀、環(huán)狀)的DNA和RNA;都來自于深海microbes,通過Pichia pastoris發(fā)酵生產(chǎn)得到。這兩款酶的區(qū)別在于發(fā)揮酶活的適宜鹽濃度不同,——M-SAN HQ中鹽核酸酶的適宜鹽濃度在175mM-250mM,而SAN HQ高鹽核酸酶的適宜鹽濃度在400mM-600mM。ArcticZymes致力于提供高質(zhì)量產(chǎn)品,具有好的批間一致性、穩(wěn)定可靠的質(zhì)量。浙江高鹽核酸酶70921-202
在生物工藝中,核酸酶的主要作用是高效消化宿主細(xì)胞DNA(HCD),并將其分解成足夠小的片段,以便在下游純化過程中去除。雖然大多數(shù)核酸酶可以在生理鹽條件下高效地將裸DNA降解成微小片段,比如Benzonase和SANs都可以把dsDNA分解成小于8nt的寡核苷酸鏈,但實(shí)際生產(chǎn)中的核酸污染情況更加復(fù)雜。HCD通常以染色質(zhì)形式存在,與細(xì)胞裂解碎片、病毒顆粒等結(jié)合在一起,影響核酸酶的識別及剪切。因此,HCD去除的關(guān)鍵在于——核酸酶如何在復(fù)雜的生產(chǎn)體系中識別并剪切HCD。湖北基因藥物生產(chǎn)用高鹽核酸酶SAN HQ終產(chǎn)品經(jīng)過0.22 μm過濾除菌;
AAV病毒滴度通常分為物理滴度和infection滴度。物理滴度一般是指基因組滴度或者衣殼滴度。在測定AAV的含量時,通常采用基因組滴度或者衣殼滴度作為單位,其中基因組滴度為攜帶基因組的AAV的濃度,衣殼滴度為AAV物理顆粒的濃度?;蚪M滴度一般采用qPCR、ddPCR、染料法、UV/Vis等方法來測定;衣殼滴度主要是通過ELISA、HPLC等方法來測定。AAV基因組滴度檢測的關(guān)鍵在于盡可能徹底去除AAV衣殼外的HCD殘留,減少污染核酸對qPCR或ddPCR的影響。經(jīng)典方法是加入常規(guī)核酸酶(如Dnase I、Benzonase等)消化AAV衣殼外的HCD殘留,然后加入Proteinase K破碎病毒衣殼,進(jìn)行后續(xù)檢測。經(jīng)過對比發(fā)現(xiàn),用SAN HQ高鹽核酸酶替代常規(guī)核酸酶處理AAV病毒,能夠更高效去除衣殼外的核酸殘留,qPCR或ddPCR結(jié)果重復(fù)性更高、更穩(wěn)定。
殘留的宿主DNA是生產(chǎn)中產(chǎn)生的雜質(zhì),其存在潛在的致瘤性、傳染性和免疫原性等風(fēng)險。相關(guān)研究表明,基因的大小普遍在200bp以上,因此大于200bp有可能會有一定的致病性,而且殘留DNA片段越大,生物制品的風(fēng)險等級越高。因此,各國監(jiān)管機(jī)構(gòu)對其提出了嚴(yán)格要求。美國食品藥品監(jiān)督管理局(FDA)在《關(guān)于人類基因zhiliao新產(chǎn)品生產(chǎn)指導(dǎo)文件》中明確指出HCD的片段要小于200bp。2022年5月,國家藥品監(jiān)督管理局藥品評審中心(CDE)發(fā)布的《體內(nèi)基因藥物產(chǎn)品藥學(xué)研究與評價技術(shù)指導(dǎo)原則(試行)》中也明確指出需對DNA殘留量和殘留片段大小進(jìn)行控制,建議盡量將DNA殘留片段的大小控制在200bp以下。SAN HQ高鹽核酸酶更適合用于AAV生產(chǎn)。
綜合腺相關(guān)病毒AAV制備的三個工藝階段介紹,可以看出下游處理可以占病毒生產(chǎn)總成本的很大一部分,而且難度也是非常大,尤其是純化過程。原因之一是由于有超過100種不同血清型的變體AAV衣殼,不同血清型的AAV蛋白存在差異。因此,各種血清型的表面特性增加AAV純化難度。原因之二是:針對工藝和產(chǎn)品相關(guān)的雜質(zhì)(包括宿主細(xì)胞物質(zhì),DNA和空衣殼),缺乏一個有效和可重復(fù)的平臺方法,尤其是來從空衣殼中分離出完整的衣殼。為了解決以上問題,國內(nèi)外大的藥企公司都致力于純化新產(chǎn)品的開發(fā),以期達(dá)到:(1)實(shí)現(xiàn)病毒顆粒的分離(2)減少產(chǎn)品相關(guān)雜質(zhì)(3)保持效力和產(chǎn)量的目標(biāo)。SAN HQ高鹽核酸酶在高鹽濃度下具有較高活性。山東高鹽核酸酶70921-160
一個美國客戶對SAN HQ高鹽核酸酶純化病毒載體的效率進(jìn)行了評估。浙江高鹽核酸酶70921-202
桿狀病毒表達(dá)載體體系Baculovirus/Sf9(Baculovirusexpression vector,BEV),是應(yīng)用桿狀病毒表達(dá)載體(BEV)系統(tǒng)infect昆蟲細(xì)胞Sf9,是一種替代哺乳動物包裝細(xì)胞系的生產(chǎn)方案。整個系統(tǒng)包含兩種BEV,其中一個BEV攜帶兩側(cè)有ITRs的目的基因,另一BEV則攜帶rep/cap基因。這兩種BEV同時infectSf9即可組裝AAV。由于桿狀病毒具有輔助功能,因此BEV系統(tǒng)與可以穩(wěn)定表達(dá)rep的Sf9細(xì)胞相結(jié)合,可用于靈活的、高滴度的大規(guī)模載體生產(chǎn)。BEV體系安全性好,infection效率高,生產(chǎn)工藝較之sTT更易放大,有更高的體積生產(chǎn)率優(yōu)勢。浙江高鹽核酸酶70921-202