國內(nèi)高通量測序進化分析技術

病毒（Virus）由一種核酸分子（DNA或RNA）與蛋白質(zhì)（Protein）構成或由蛋白質(zhì)構成（如朊病毒）。根據(jù)遺傳物質(zhì)的組成，可分為單鏈DNA病毒（ssDNA）、雙鏈DNA病毒（dsDNA）、單鏈RNA病毒（ssRNA）、雙鏈RNA病毒（dsRNA）和蛋白質(zhì)病毒（如朊病毒）。根據(jù)宿主類型的不同，可以分為噬菌體（細菌病毒）、植物病毒（煙花葉病毒）和動物病毒（如禽流感病毒、天花病毒和HIV等）。病毒全基因組測序（VirusWholeGenomeSequencing，VWGS），是指基于第二代高通量測序技術，對病毒全基因組進行測序，利用生物信息分析手段，得到病毒的全基因組序列，解析編碼信息，并獲得相應的變異信息。測序覆蓋度是反映測序隨機性的指標之一。國內(nèi)高通量測序進化分析技術

深度測序和個性化醫(yī)學的范式相比，P4醫(yī)學更強調(diào)早期預測和預防，強調(diào)對患者了解的系統(tǒng)性和參與性。準確醫(yī)學的概念則是在基因測序普及的基礎上，將整個個體的各種信息如生理信息（通過可穿戴設備可以即時監(jiān)控和收集到）和腸道菌群變化、各種組學信息（深度測序測定）整合，進行準確的疾病分型、調(diào)整和預防。隨著老年化時代的到來及臨床資源的限制，基于這三種范式的健康管理和準確診療將成為生物醫(yī)學研究與應用的基本范式，走向大眾生活，正如當年的計算機發(fā)展歷程一樣，會從原來的大型機器演變成可移動的小型工具。醫(yī)學與健康的將來也會隨著深度測序的普及和生物信息學數(shù)據(jù)處理能力的大幅度提高，而進入個性化的大眾管理時代。RNA高通量測序全基因組測序能檢測個體基因組中的全部遺傳信息，準確性高。

病毒全基因組測序，高通量測序技術的發(fā)展在生物信息學分析方面，通過新的分析軟件的研發(fā)和原有分析軟件的升級，對測序所得數(shù)據(jù)的分析也變得更加可靠；除此之外，伴隨著BasSpace等服務的出現(xiàn)，進行數(shù)據(jù)分析工作所需的設備成本也在逐步降低。將來，伴隨著高通量測序技術與數(shù)據(jù)分析技術的不斷進步，測序精度與可靠性的上升，測序與數(shù)據(jù)分析成本的下降，高通量測序技術會在各個領域得到應用。在病原微生物檢測和鑒定應用中，高通量測序技術勢必會成為不可或缺的技術并發(fā)揮越來越重要的作用。高通量測序?qū)嶒炞銐蜢`敏和完善，方能獲得準確、可信任的結(jié)果。

病毒準種的漂變將使毒株的特點及傳播方式發(fā)生改變，給現(xiàn)有的檢測手段和防治措施帶來嚴峻的挑戰(zhàn)。新一代高通量測序技術的出現(xiàn)使得檢測某個物種的混合PCR產(chǎn)物中低頻率的變異體十分便利它的出現(xiàn)加快了研究準種的規(guī)律性和影響因素的步伐。新一代測序儀將以往的測序費用降低了好幾個數(shù)量級。鑒于此，以前只有大型測序中心才能夠開展的項目，現(xiàn)在在小型實驗室里也能順利進行了，按照目前的發(fā)展速度，新一代高通量測序技術有望給生物學和生物醫(yī)學研究領域帶來**性的變革。病毒全基因組測序定使人類從根本上認知疾病發(fā)生的原因，做到正確的調(diào)整疾病和盡早的預防疾病。

探普生物對病毒的全基因組進行測序的實驗基于二代測序技術。樣本經(jīng)過核酸純化-文庫構建-生物信息學分析這3大基本流程后轉(zhuǎn)換成了序列數(shù)據(jù)。先，在核酸純化環(huán)節(jié)，探普提供專門針對性的核酸純化樣本指南，以提高目的物種的核酸純度和得率，與此同時探普生物也提供核酸純化服務。第二，文庫構建環(huán)節(jié)，樣本的核酸具備濃度低，總量少的特點。探普生物專門針對這一點開發(fā)了超微量核酸文庫構建，可以將0.01ng/μl甚至更低濃度的核酸構建成測序文庫。第三，生物信息學分析環(huán)節(jié)。生存環(huán)境和狀態(tài)決定了對病毒的全基因組進行測序的下機數(shù)據(jù)一般都伴隨大量的宿主和其他微生物的數(shù)據(jù)。探普生物基于該特點，優(yōu)化了自有數(shù)據(jù)庫，搭載了的生物信息學分析流程，可處理復雜背景下的目標物種序列。病毒全基因組測序具有的特點：采用高通量測序儀，全流程質(zhì)控。病毒基因測序找哪家

在探普生物進行病毒基因組測序是比較簡單的。國內(nèi)高通量測序進化分析技術

對病毒的全基因組進行測序時，生物信息學分析是如何進行的？生存環(huán)境和狀態(tài)決定了對病毒的全基因組進行測序的下機數(shù)據(jù)一般都伴隨大量的宿主和其他微生物的數(shù)據(jù)。探普生物基于該特點，優(yōu)化了自有數(shù)據(jù)庫，搭載了的生物信息學分析流程，可處理復雜背景下的目標物種序列。探普生物基于該特點，優(yōu)化了自有數(shù)據(jù)庫，專門搭載了生物信息學分析流程，可處理復雜背景下的目標物種序列。生物信息學流程主要包括對非目標數(shù)據(jù)進行去除以及對目標序列進行篩選，高質(zhì)量高完整度的序列拼接以及后續(xù)的高級分析，如SNP分析，進化分析，耐藥位點分析等。在探普的流程下，可以獲得完整性很高的基因組序列。國內(nèi)高通量測序進化分析技術

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