微生物鑒定的用途：醫(yī)療保?。簻?zhǔn)確、快速地鑒定細(xì)菌和寄生蟲，以進(jìn)行正確和及時(shí)的疾病診斷，并進(jìn)行適當(dāng)?shù)脑\療。流行病學(xué)：為了追蹤病原體和追蹤疾病的傳播和暴發(fā)，以及鑒定新的隔離物，例如耐藥隔離。制藥工業(yè)：由于微生物是對無菌性的重大威脅，對環(huán)境微生物的準(zhǔn)確鑒定通常是制藥行業(yè)良好的生產(chǎn)實(shí)踐(GMP)要求。其他用途：包括刑事調(diào)查、微生物取證和環(huán)境研究等。傳統(tǒng)的微生物鑒定方法依賴于表型鑒定，主要是用染色法、培養(yǎng)法和簡單的生化檢驗(yàn)。宏觀特征包括微生物的整體外觀，其形狀、大小、顏色和氣味等，可以用肉眼看到。通過在瓊脂培養(yǎng)基檢查其形態(tài)學(xué)/宏觀特征來確定微生物的類型。同一物種在不同的培養(yǎng)基中會出現(xiàn)不同的表現(xiàn)。病毒的顆粒很小、以納米為測量單位。RNA未知病原檢測
病毒是一種個(gè)體微小，結(jié)構(gòu)簡單，只含一種核酸（DNA或RNA），必須在活細(xì)胞內(nèi)寄生并以復(fù)制方式增殖的生物。病毒是一種非細(xì)胞生命形態(tài)，它由一個(gè)核酸長鏈和蛋白質(zhì)外殼構(gòu)成，病毒沒有自己的代謝機(jī)構(gòu)，沒有酶系統(tǒng)。病毒是顆粒很小、以納米為測量單位、結(jié)構(gòu)簡單、寄生性嚴(yán)格，以復(fù)制進(jìn)行繁殖的一類非細(xì)胞型微生物。病毒是比細(xì)菌還小、沒有細(xì)胞結(jié)構(gòu)、只能在細(xì)胞中增殖的微生物。病毒由蛋白質(zhì)和核酸組成。一般，大部分病毒要用電子顯微鏡才能觀察到。隨機(jī)PCR微生物篩查上哪找病毒的結(jié)構(gòu)簡單、寄生性嚴(yán)格，以復(fù)制進(jìn)行繁殖的一類非細(xì)胞型微生物。
在實(shí)驗(yàn)室中，為了分離某些厭氧菌，可以利用裝有原培養(yǎng)基的試管作為培養(yǎng)容器，把這支試管放在沸水0浴中加熱數(shù)分鐘，以便逐出培養(yǎng)基中的溶解氧。然后快速冷卻，并進(jìn)行接種。接種后，加入無菌的石蠟于培養(yǎng)基表面，使培養(yǎng)基與空氣隔絕。另一種方法是，在接種后，利用n2或co2取代培養(yǎng)基中的氣體，然后在火焰上把試管口密封。有時(shí)為了更有效地分離某些厭氧菌，可以把所分離的樣品接種于培養(yǎng)基上，然后再把培養(yǎng)皿放在完全密封的厭氧培養(yǎng)裝置中。
微生物檢測方法中常用的有平板菌落計(jì)數(shù)法，是根據(jù)每個(gè)活的細(xì)菌能長出一個(gè)菌落的原理設(shè)計(jì)的。取一定容量的菌懸液，作一系列的倍比稀釋，然后將定量的稀釋液進(jìn)行平板培養(yǎng)，根據(jù)培養(yǎng)出的菌落數(shù)，可算出活菌數(shù)。此法靈敏度高，是一種檢測污染活菌數(shù)的方法，也是目前國際上許多國家所采用的方法。使用該法應(yīng)注意：①一般選取菌落數(shù)在30～300之間的平板進(jìn)行計(jì)數(shù)，過多或過少均不準(zhǔn)確;②為了防止菌落蔓延，影響計(jì)數(shù)，可在培養(yǎng)基中加入0.001%的2,3,5-氯化三苯基四氮唑(TTC);③本法限用于形成菌落的微生物。普遍應(yīng)用于水、牛奶、食物、藥品等各種材料的細(xì)菌檢驗(yàn)，是很常用的微生物檢測方法。一般來說，在一定的培養(yǎng)條件下，同種微生物表現(xiàn)出穩(wěn)定的菌落特征。
微生物鑒定的傳統(tǒng)的鑒定方法雖然仍被普遍使用，但存在兩大缺點(diǎn)。它們只適用于可以體外培養(yǎng)的生物體，而且一些菌株表現(xiàn)出不符合已知種屬模式的獨(dú)特的生化特性。許多現(xiàn)代方法并不依賴于活的培養(yǎng)物，它們常常能揭示通過傳統(tǒng)方法檢測不到的有機(jī)體之間的細(xì)微差別。PCR，包括實(shí)時(shí)熒光定量PCR，可能是普遍應(yīng)用于微生物鑒定的分子技術(shù)。利用PCR技術(shù)，可以快速檢測和鑒定臨床標(biāo)本的微生物種類，從而加快診斷程序。大多數(shù)基于PCR的方法涉及一組通用的PCR引物，通過測序PCR擴(kuò)增的序列來鑒定細(xì)菌/樣品。16SrRNA基因是PCR細(xì)菌鑒定的金標(biāo)準(zhǔn)序列，而內(nèi)部轉(zhuǎn)錄間隔區(qū)(ITS)區(qū)域是種類的主要條碼標(biāo)記。未知病原微生物中有很多微生物通過傳統(tǒng)技術(shù)是無法鑒別的。新病原篩查原理
未知病毒是指未被證實(shí)的某種病毒。RNA未知病原檢測
生物的個(gè)體在一生的生長繁殖過程中，經(jīng)過不同的發(fā)育階段。這種過程對特定的生物來講是重復(fù)循環(huán)的，常稱為該種生物的生活周期或生活史。各種生物都有自己的生活史。在分類鑒定中，生活史有時(shí)也是一項(xiàng)指標(biāo)，如黏細(xì)菌就是以它的生活史作為分類鑒定的依據(jù)。很多細(xì)菌有十分相似的外表結(jié)構(gòu)(如鞭毛)或有作用相同的酶(如乳酸桿菌屬內(nèi)各種細(xì)菌都有乳酸脫氫酶)。雖然它們的蛋白質(zhì)分子結(jié)構(gòu)各異，但在普通技術(shù)下(如電子顯微鏡或生化反應(yīng))，仍無法分辨它們。然而利用抗原與抗體的高度敏感特異性反應(yīng)，就可用來鑒定相似的菌種，或?qū)νN微生物分型。用已知菌種、型或菌株制成的抗血清，與待鑒定的對象是否發(fā)生特異性的血清學(xué)反應(yīng)來鑒定未知菌種、型或菌株。該法常用于腸道菌、噬菌體和病毒的分類鑒定。利用此法，已將傷寒桿菌、肺炎鏈球菌等菌分成數(shù)十種菌型。RNA未知病原檢測
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