國(guó)內(nèi)病毒序列技術(shù)

來(lái)源: 發(fā)布時(shí)間:2022-10-17

病毒全基因組測(cè)序定:探普生物對(duì)病毒的全基因組進(jìn)行測(cè)序的實(shí)驗(yàn)基于二代測(cè)序技術(shù)。樣本經(jīng)過(guò)核酸純化-文庫(kù)構(gòu)建-生物信息學(xué)分析這3大基本流程后轉(zhuǎn)換成了序列數(shù)據(jù)。先,在核酸純化環(huán)節(jié),探普提供專(zhuān)門(mén)針對(duì)性的核酸純化樣本指南,以提高目的物種的核酸純度和得率,與此同時(shí)探普生物也提供核酸純化服務(wù)。第二,文庫(kù)構(gòu)建環(huán)節(jié),樣本的核酸具備濃度低,總量少的特點(diǎn)。探普生物專(zhuān)門(mén)針對(duì)這一點(diǎn)開(kāi)發(fā)了超微量核酸文庫(kù)構(gòu)建,可以將0.01ng/μl甚至更低濃度的核酸構(gòu)建成測(cè)序文庫(kù)。第三,生物信息學(xué)分析環(huán)節(jié)。生存環(huán)境和狀態(tài)決定了對(duì)病毒的全基因組進(jìn)行測(cè)序的下機(jī)數(shù)據(jù)一般都伴隨大量的宿主和其他微生物的數(shù)據(jù)。探普生物基于該特點(diǎn),優(yōu)化了自有數(shù)據(jù)庫(kù),搭載了專(zhuān)門(mén)用的的生物信息學(xué)分析流程,可處理復(fù)雜背景下的目標(biāo)物種序列。傳統(tǒng)Sanger測(cè)序相比,NGS技術(shù)的發(fā)展使得一個(gè)小的研究小組可以擁有大量病毒株的全基因組序列。國(guó)內(nèi)病毒序列技術(shù)

DNA病毒基因組測(cè)序:動(dòng)物、人、植物被特定病毒株侵染、分離到病毒株、連續(xù)傳代的病毒株往往都需要獲得盡量完整的基因組序列來(lái)指導(dǎo)下一步的研究,傳統(tǒng)的sanger測(cè)序需要了解序列、設(shè)計(jì)引物、做很多PCR,往往效率很低,而NGS作為一種無(wú)需特異性引物擴(kuò)增的測(cè)序方式,可以直接從DNA中獲得序列。DNA病毒基因組測(cè)序:如果,1,您的目的是:獲得一種指定DNA病毒盡量完整的序列;2,您可以提供該病毒的中英文名稱(chēng);3,您了解樣本中病毒的載量情況、培養(yǎng)狀況、ct值等任一信息。那么,探普為你準(zhǔn)備了完整的下單、樣本準(zhǔn)備方法,經(jīng)過(guò)探普的實(shí)驗(yàn),測(cè)序、分析,你將獲得:1,1-5Gb測(cè)序數(shù)據(jù)量rawdata;2,一般可獲得95%以上的拼接序列,100kb以上大基因組病毒除外;其他特殊要求如:突變分析、進(jìn)化分析都可直接與技術(shù)支持聯(lián)系。武漢病毒二代測(cè)序突變分析公司病毒全基因組測(cè)序具有的特點(diǎn):無(wú)需培養(yǎng)和特異性擴(kuò)增,對(duì)采集臨床樣本直接檢測(cè)。

對(duì)病毒的全基因組進(jìn)行測(cè)序:對(duì)病毒的全基因組進(jìn)行測(cè)序主要是通過(guò)非特異性擴(kuò)增+克隆結(jié)合sanger測(cè)序來(lái)完成的。當(dāng)物種有了參考的序列之后,可以通過(guò)特異性擴(kuò)增+sanger測(cè)序獲得全基因組序列。Sanger測(cè)序準(zhǔn)確度高,讀長(zhǎng)很長(zhǎng),但與此同時(shí),擴(kuò)增和克隆工作費(fèi)時(shí)費(fèi)力,由于流程繁瑣,加上快速變異導(dǎo)致引物無(wú)法通用,該方法對(duì)于大量基因組的測(cè)序工作而言,可操作性不強(qiáng),這對(duì)于研究者一直是一個(gè)困擾。高通量測(cè)序技術(shù)正式啟用之后,研究者可以將樣品處理至標(biāo)準(zhǔn)濃度和體積后進(jìn)行測(cè)序和分析,減少了工作量,增加了成功率。探普生物進(jìn)行了大量有針對(duì)性的研發(fā)和測(cè)試,開(kāi)發(fā)了全套的實(shí)驗(yàn)和分析流程用于對(duì)病毒的全基因組進(jìn)行測(cè)序,該流程自運(yùn)行以來(lái)廣受研究者們好評(píng)。

需要對(duì)病毒的全基因組進(jìn)行測(cè)序的應(yīng)用場(chǎng)景:在探普生物長(zhǎng)時(shí)間運(yùn)行過(guò)程中,我們接觸到的對(duì)病毒的全基因組進(jìn)行測(cè)序項(xiàng)目有比較豐富的應(yīng)用場(chǎng)景。先,從事基因進(jìn)化/疫苗/藥品/抗體研制方向的研究的研究者一定會(huì)用到測(cè)序。這種場(chǎng)景一般是用密集的sanger測(cè)序監(jiān)測(cè)某幾個(gè)關(guān)鍵基因,搭載一定頻率的全基因組測(cè)序。這樣的組合省時(shí)省力省經(jīng)費(fèi),同時(shí)能達(dá)到研究目的。此外,有的單位需要對(duì)傳染病的病原進(jìn)行流行病學(xué)監(jiān)測(cè)和研究,如疾控/疫控中心、醫(yī)院的傳染病科室以及一些高校和研究所的相應(yīng)課題組,可能需要對(duì)病毒的全基因組進(jìn)行測(cè)序以后,結(jié)合其他上下游的研究數(shù)據(jù),達(dá)到研究或者監(jiān)測(cè)疫病的目的。病毒是由一種核酸分子與蛋白質(zhì)構(gòu)成或只由蛋白質(zhì)構(gòu)成。

病原學(xué)的診斷注意事項(xiàng):病原學(xué)的診斷始終是傳染性疾病診斷的重要一環(huán),二代測(cè)序作為病原學(xué)診斷的性技術(shù),也在臨床上不斷的探索、落地,“中國(guó)宏基因組學(xué)第二代測(cè)序技術(shù)檢測(cè)傳染病原體的臨床應(yīng)用**共識(shí)”是世界開(kāi)始針對(duì)所有傳染性疾病的宏基因組學(xué)第二代測(cè)序技術(shù)臨床應(yīng)用**共識(shí),是中國(guó)傳染性疾病臨床**對(duì)二代測(cè)序技術(shù)的臨床應(yīng)用的規(guī)范與質(zhì)量控制達(dá)成的共識(shí)。由于二代測(cè)序的成本仍然較高,尚不能作為輕癥傳染性疾病的主要選擇(A,Ⅲ),完成一次二代測(cè)序需要數(shù)千元人民幣,與之相比,完成1次血培養(yǎng)約40元人民幣,完成1次16SPCR檢測(cè)則需約50元人民幣。病毒的全基因組測(cè)序以及對(duì)應(yīng)的生物信息學(xué)分析方法是研究病毒進(jìn)化、毒力因子變異、疫病爆發(fā)之間的關(guān)系。長(zhǎng)沙二代測(cè)序檢測(cè)

全基因組測(cè)序能檢測(cè)個(gè)體基因組中的全部遺傳信息,準(zhǔn)確性高。國(guó)內(nèi)病毒序列技術(shù)

對(duì)病毒的全基因組進(jìn)行測(cè)序價(jià)格合理:上海探普生物科技有限公司致力于醫(yī)藥、保養(yǎng),以科技創(chuàng)新實(shí)現(xiàn)管理的追求。探普生物擁有一支經(jīng)驗(yàn)豐富、技術(shù)創(chuàng)新的專(zhuān)業(yè)研發(fā)團(tuán)隊(duì),以高度的專(zhuān)注和執(zhí)著為客戶(hù)提供病毒測(cè)序,病毒全基因組測(cè)序,病毒宏基因組測(cè)序,未知病原鑒定。探普生物繼續(xù)堅(jiān)定不移地走高質(zhì)量發(fā)展道路,既要實(shí)現(xiàn)基本面穩(wěn)定增長(zhǎng),又要聚焦關(guān)鍵領(lǐng)域,實(shí)現(xiàn)轉(zhuǎn)型再突破。探普生物始終關(guān)注醫(yī)藥、保養(yǎng)市場(chǎng),以敏銳的市場(chǎng)洞察力,實(shí)現(xiàn)與客戶(hù)的成長(zhǎng)共贏。國(guó)內(nèi)病毒序列技術(shù)

上海探普生物科技有限公司是一家有著先進(jìn)的發(fā)展理念,先進(jìn)的管理經(jīng)驗(yàn),在發(fā)展過(guò)程中不斷完善自己,要求自己,不斷創(chuàng)新,時(shí)刻準(zhǔn)備著迎接更多挑戰(zhàn)的活力公司,在上海市等地區(qū)的醫(yī)藥健康中匯聚了大量的人脈以及**,在業(yè)界也收獲了很多良好的評(píng)價(jià),這些都源自于自身不努力和大家共同進(jìn)步的結(jié)果,這些評(píng)價(jià)對(duì)我們而言是比較好的前進(jìn)動(dòng)力,也促使我們?cè)谝院蟮牡缆飞媳3謯^發(fā)圖強(qiáng)、一往無(wú)前的進(jìn)取創(chuàng)新精神,努力把公司發(fā)展戰(zhàn)略推向一個(gè)新高度,在全體員工共同努力之下,全力拼搏將共同上海探普生物供應(yīng)和您一起攜手走向更好的未來(lái),創(chuàng)造更有價(jià)值的產(chǎn)品,我們將以更好的狀態(tài),更認(rèn)真的態(tài)度,更飽滿(mǎn)的精力去創(chuàng)造,去拼搏,去努力,讓我們一起更好更快的成長(zhǎng)!