EndoH糖苷內(nèi)切酶H(EndoH)在實(shí)驗(yàn)中通常用于分析以下類型的糖鏈:1.**高甘露糖型糖鏈**:EndoH能夠特異性地識別并切割高甘露糖型N-連接糖鏈,這些糖鏈通常存在于未成熟的糖蛋白中。2.**某些雜合型糖鏈**:EndoH也能對某些雜合型寡聚糖的殼二糖結(jié)構(gòu)進(jìn)行切割,去除糖蛋白中的N-連接高甘露糖。3.**N-連接糖鏈**:EndoH主要用于去除糖蛋白中的N-連接高甘露糖,這有助于研究糖鏈結(jié)構(gòu)和糖基化模式。4.**抗體糖型分析**:在IgG中,F(xiàn)c區(qū)Asn297處的保守N-連接糖對其活性至關(guān)重要,EndoH可用于分析這些糖鏈。5.**糖蛋白的糖基化模式**:EndoH有助于分析糖蛋白的糖基化位點(diǎn)、糖基化程度以及糖鏈的具體結(jié)構(gòu)。6.**糖鏈分析和結(jié)構(gòu)表征**:在糖鏈分析的主要策略中,EndoH作為高效、準(zhǔn)確、穩(wěn)定的去糖基化方法,有助于從糖蛋白上游離糖鏈,然后進(jìn)行詳細(xì)的分析表征。EndoH的使用可以為研究者提供關(guān)于糖蛋白糖基化模式的重要信息,尤其是在抗體藥物研究和開發(fā)中,對于理解糖鏈如何影響藥物的活性、穩(wěn)定性和免疫原性具有重要意義。
EndoS糖苷內(nèi)切酶在抗體藥物偶聯(lián)物(ADCs)的制備中發(fā)揮著至關(guān)重要的作用。EndoS是一種特異性的內(nèi)切糖苷酶,它能夠從IgG重鏈的N-糖基中切割N-連接的糖鏈。這種特異性使得EndoS在改造抗體的糖鏈結(jié)構(gòu)時非常有用,尤其是在開發(fā)定點(diǎn)ADCs時。在ADCs的制備過程中,EndoS的作用主要體現(xiàn)在以下幾個方面:1.**糖鏈切割**:EndoS能夠特異性地水解抗體Fc片段上的N-糖鏈,為后續(xù)的糖鏈改造和藥物偶聯(lián)提供條件。2.**糖鏈改造**:EndoS可以用于去除抗體上的原有糖鏈,然后通過酶的催化作用,將特定的糖鏈結(jié)構(gòu)重新連接到抗體上,實(shí)現(xiàn)糖鏈的定點(diǎn)修飾。3.**定點(diǎn)偶聯(lián)**:通過EndoS的催化作用,可以將小分子細(xì)胞毒藥物通過特定的糖鏈結(jié)構(gòu)“一步”定點(diǎn)連接到抗體的糖基化位點(diǎn),簡化了ADCs的制備流程。4.**提高ADCs的均一性和穩(wěn)定性**:EndoS介導(dǎo)的定點(diǎn)偶聯(lián)技術(shù)有助于獲得結(jié)構(gòu)均一性更好、穩(wěn)定性更高的ADCs,這對于提高藥物療效和減少副作用至關(guān)重要。5.**增強(qiáng)療效**:利用EndoS進(jìn)行的定點(diǎn)偶聯(lián)可以提高ADCs的體內(nèi)瘤抑制活性,即使在低載藥量的情況下也能保持高效的抗瘤效果。
重組的化膿性鏈球菌Cas9蛋白(SpCas9)是一種用于基因組編輯的核酸酶。它是CRISPR-Cas系統(tǒng)的一部分,該系統(tǒng)是一種細(xì)菌和古菌的適應(yīng)性免疫防御機(jī)制,能夠識別并切割入侵的外源核酸。Cas9蛋白在CRISPR系統(tǒng)中起到關(guān)鍵作用,它能夠識別特定的原間隔子相鄰基序(PAM),在引導(dǎo)RNA(gRNA)的引導(dǎo)下與目標(biāo)DNA結(jié)合并進(jìn)行切割。SpCas9蛋白由1053個氨基酸組成,相對較小的體積使其便于在體內(nèi)遞送,因此它在多種生物中都能進(jìn)行有效的基因組編輯。為了提高SpCas9的表達(dá)量和溶解度,研究人員采用了多種策略,例如使用GB1促溶標(biāo)簽和多重啟動子策略,這些策略可以顯著提高蛋白的產(chǎn)量和活性,同時保持其功能活性不受影響。在基因編輯過程中,SpCas9與gRNA形成穩(wěn)定的核糖核的蛋白(RNP)復(fù)合物,通過gRNA與基因組DNA的序列匹配來識別目標(biāo)位點(diǎn),并在距離NGGPAM序列3個堿基以內(nèi)的位置切割DNA。為了增強(qiáng)SpCas9的基因組編輯效率,研究人員還開發(fā)了嵌合融合蛋白,例如與5’至3’核酸外切酶重組J(RecJ)或GFP融合的SpyCas9蛋白,這些嵌合蛋白可以顯著提高靶向基因編輯效率,同時保持較低的脫靶效應(yīng)。
使用PreScissionProtease進(jìn)行蛋白質(zhì)切割后,可以采用以下方法來提高產(chǎn)品的純度:1.**親和層析**:利用GST標(biāo)簽或His標(biāo)簽等進(jìn)行一步或多步親和層析,以高純度分離目的蛋白。2.**離子交換層析**:根據(jù)蛋白質(zhì)的電荷特性,使用陽離子或陰離子交換層析進(jìn)一步純化蛋白質(zhì)。3.**凝膠滲透層析**:通過分子大小的排阻,去除分子量較大或較小的雜質(zhì)。4.**反向?qū)游?*:使用反相高效液相色譜(HPLC)技術(shù),根據(jù)蛋白質(zhì)與固定相的疏水相互作用進(jìn)行分離。5.**超濾/透析**:使用超濾膜或透析袋去除低分子量的雜質(zhì),如鹽分、緩沖液成分或小分子蛋白質(zhì)。6.**二次親和層析**:在初次親和層析后,可以進(jìn)行二次親和層析以進(jìn)一步提高純度。7.**蛋白質(zhì)純化柱**:使用商業(yè)化的蛋白質(zhì)純化柱,如GST-Sepharose或Ni-NTA柱,進(jìn)行快速純化。8.**等電聚焦電泳**:通過等電聚焦電泳(IEF)分離具有不同等電點(diǎn)的蛋白質(zhì)。9.**SDS-PAGE**:使用SDS-PAGE凝膠電泳分析蛋白質(zhì)的純度,并可通過凝膠切片回收相對純凈的蛋白質(zhì)條帶。10.**質(zhì)譜分析**:利用質(zhì)譜技術(shù)鑒定蛋白質(zhì)的確切質(zhì)量和序列來確保蛋白質(zhì)的純度和正確性。Taq DNA Polymerase 能夠在相對較高的溫度下保持穩(wěn)定,其適催化溫度在75-80°C。
EndoS糖苷內(nèi)切酶S(Endo-S)的特異性主要體現(xiàn)在其對糖蛋白的糖鏈結(jié)構(gòu)的識別和切割能力上。以下是Endo-S的一些關(guān)鍵特異性特點(diǎn):1.**糖鏈識別**:Endo-S能夠特異性識別糖鏈結(jié)構(gòu)中的某些特定序列或結(jié)構(gòu),尤其是N-連接糖鏈的殼二糖重要結(jié)構(gòu)。2.**切割位點(diǎn)**:Endo-S在糖鏈的特定位點(diǎn)進(jìn)行切割,通常是在N-乙酰葡糖胺(GlcNAc)和天冬酰胺之間的β-N-糖苷鍵。3.**不影響抗原性**:Endo-S的切割位點(diǎn)選擇性高,不會破壞糖蛋白的抗原決定簇,因此在某些應(yīng)用中可以保持糖蛋白的免疫原性。4.**應(yīng)用多樣性**:Endo-S可以用于多種糖蛋白的去糖基化,包括抗體和其他具有N-連接糖鏈的蛋白質(zhì)。5.**研究和藥物開發(fā)**:在研究糖蛋白的結(jié)構(gòu)和功能時,Endo-S提供了一種工具來研究糖鏈對蛋白質(zhì)性質(zhì)的影響。此外,在藥物開發(fā)中,Endo-S用于制備糖鏈定點(diǎn)ADC化合物,通過精確控制藥物與抗體的連接點(diǎn),提高藥物的療效和減少副作用。6.**兼容性**:Endo-S對多樣化的LacNAc修飾顯示出良好的兼容性,可以接受不同生物正交基團(tuán)、熒光基團(tuán)等衍生物作為底物,實(shí)現(xiàn)抗體糖基化修飾。7.**高效性**:Endo-S在催化糖鏈轉(zhuǎn)移或切割反應(yīng)中表現(xiàn)出高效性,有助于實(shí)現(xiàn)高效獲得功能修飾的糖工程抗體。E1通常被認(rèn)為是泛素化過程中的限速步驟,因?yàn)樗婕暗椒核氐募て鸷虯TP的水解。Recombinant Mouse NKG2D/CD314 Protein,hFc Tag
隨后,泛素分子從E1轉(zhuǎn)移到泛素結(jié)合酶E2,再通過泛素連接酶E3的作用,將泛素分子連接到靶蛋白上。Recombinant Human OSMR Protein,hFc Tag
NLS-Cas9-EGFPNuclease是一種融合蛋白,由Cas9核酸酶、核定位信號(NLS)和EGFP(綠色熒光蛋白)組成。這種融合蛋白的特點(diǎn)和科研應(yīng)用如下:**特點(diǎn):**1.**無DNA污染**:系統(tǒng)不添加外部DNA,降低了外源DNA污染的風(fēng)險。2.**高切割效率**:NLS確保Cas9蛋白能夠高效地進(jìn)入細(xì)胞核,從而提高DNA切割效率。3.**低脫靶效應(yīng)**:由于Cas9核酸酶的瞬時表達(dá),減少了在非目標(biāo)位點(diǎn)切割的可能性。4.**節(jié)省時間**:與需要轉(zhuǎn)錄和翻譯的mRNA或質(zhì)粒系統(tǒng)相比,NLS-Cas9-EGFPNuclease可以直接進(jìn)入細(xì)胞核,無需等待轉(zhuǎn)錄和翻譯過程。5.**EGFP標(biāo)簽**:EGFP作為報告基因,可用于追蹤或分選轉(zhuǎn)染細(xì)胞,便于通過熒光激起細(xì)胞分選(FACS)富集所需基因組編輯的細(xì)胞群,減少單細(xì)胞克隆和基因分型的勞動和成本。**科研應(yīng)用:**1.**體外DNA切割篩選**:可以用于篩選高效和特異性靶向的gRNA,通過體外DNA切割實(shí)驗(yàn)來驗(yàn)證gRNA的效率和特異性。2.**體內(nèi)基因編輯**:與特定的gRNA結(jié)合后,可以通過電穿孔或注射的方式進(jìn)行體內(nèi)基因編輯。3.**細(xì)胞追蹤和分選**:利用EGFP熒光標(biāo)記,可以追蹤轉(zhuǎn)染細(xì)胞并進(jìn)行分選,這對于研究基因編輯后的細(xì)胞群體特別有用。