蘇州ChIP免疫沉淀磁珠現(xiàn)貨

來源： 發(fā)布時間：2024-06-09

ChIP實驗的基本步驟包括：
1. 交聯(lián)（Crosslinking）：細胞被甲醛等交聯(lián)劑處理，使得蛋白質(zhì)和DNA之間的相互作用被固定，形成穩(wěn)定的蛋白質(zhì)-DNA復(fù)合物。
2. 細胞裂解：裂解細胞，釋放染色質(zhì)，同時保持蛋白質(zhì)-DNA復(fù)合物的完整性。
3. 超聲或酶解：通過超聲或酶解將染色質(zhì)切割成較小的片段，以便于后續(xù)步驟中的免疫沉淀。
4. 免疫沉淀（Immunoprecipitation）：加入針對特定組蛋白修飾或轉(zhuǎn)錄因子的抗體，這些抗體會特異性地結(jié)合到目標蛋白質(zhì)上。
5. 捕獲復(fù)合物：使用蛋白A或蛋白G結(jié)合的珠子捕獲抗體-蛋白質(zhì)-DNA復(fù)合物。
6. 洗滌：洗滌珠子以去除未特異性結(jié)合的蛋白質(zhì)和DNA片段。
7. 逆轉(zhuǎn)錄交聯(lián)：將捕獲的復(fù)合物從珠子上洗脫，并進行逆轉(zhuǎn)錄交聯(lián)，使固定的蛋白質(zhì)-DNA復(fù)合物分離。
8. DNA純化：純化從免疫沉淀中得到的DNA片段。
9. 分析：通過qPCR、芯片分析（ChIP-chip）或高通量測序（ChIP-seq）等方法分析沉淀的DNA片段，以確定特定蛋白質(zhì)在基因組上的結(jié)合位點。
免疫沉淀技術(shù)IP的實驗設(shè)計。蘇州ChIP免疫沉淀磁珠現(xiàn)貨

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Co-IP（免疫共沉淀）技術(shù)主要用于研究蛋白質(zhì)之間的相互作用，其實驗設(shè)計如下：
1. 樣品準備：Co-IP實驗通常有兩種，一種是內(nèi)源性蛋白相互作用驗證，一種是非內(nèi)源性蛋白相互作用驗證。內(nèi)源性相互作用通過質(zhì)粒共轉(zhuǎn)染的方式將兩種蛋白轉(zhuǎn)染至同一細胞內(nèi)表達；非內(nèi)源性相互作用則是將含有靶蛋白的組織進行預(yù)處理及細胞裂解獲得細胞裂解液。
2. 沉淀誘餌蛋白：利用磁珠偶聯(lián)抗體沉淀誘餌蛋白。在樣品中加入磁珠偶聯(lián)抗體，抗體會與誘餌蛋白結(jié)合，利用磁鐵將磁珠拉下，同時誘餌蛋白會一起被沉淀出來。
3. SDS-PAGE及WB檢測：得到沉淀后，需要驗證沉淀中是否存在相互作用蛋白。先利用SDS-PAGE將蛋白復(fù)合物分離，隨后利用WB檢測是否存在靶蛋白。
4. 實驗對照設(shè)置：為了避免“假陽性”，需要設(shè)置正確的對照，包括陰性對照和陽性對照（Input組）。Input組為直接利用抗體對細胞裂解液進行WB檢測，驗證細胞裂解液中存在蛋白。
5. 結(jié)果真實性：確保共沉淀的蛋白是由所加入的抗體沉淀得到的，而并非外源非特異蛋白。使用單克隆抗體有助于避免污染的發(fā)生。
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免疫沉淀技術(shù)RIP（RNA Immunoprecipitation，RNA免疫沉淀）是一種用于研究細胞內(nèi)RNA與蛋白質(zhì)相互作用的技術(shù)。RIP技術(shù)可以幫助我們了解轉(zhuǎn)錄后調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的動態(tài)過程，并發(fā)現(xiàn)miRNA等非編碼RNA的調(diào)節(jié)靶點。
RIP技術(shù)的原理是利用針對特定RNA結(jié)合蛋白的抗體，將細胞內(nèi)的RNA-蛋白質(zhì)復(fù)合物沉淀下來。然后，可以通過分離純化，對這些復(fù)合物中的RNA進行檢測，如qPCR驗證或測序分析。
表觀遺傳學(xué)和RNA生物學(xué)領(lǐng)域?qū)Σ煌琑NA作用和功能的關(guān)注增加。RNA-蛋白質(zhì)相互作用能夠調(diào)控mRNA和非編碼RNA的功能。對RNA潛能的這一新認識帶動了新方法的發(fā)展，使研究人員能夠定位 RNA-蛋白質(zhì)相互作用。

免疫沉淀Co-IP實驗中磁珠還是瓊脂糖珠的選擇取決于客戶實驗情況。
瓊脂糖珠海綿狀的結(jié)構(gòu)  (直徑 50-150 μm)  可以結(jié)合抗體  (繼而結(jié)合靶蛋白) ，它能夠直接高效、快速結(jié)合抗體，而不需借助特殊的專業(yè)設(shè)備。瓊脂糖珠呈多孔結(jié)構(gòu)，這使得它們擁有更大的表面積可與蛋白質(zhì)相互接觸，具有更高的結(jié)合載量。
與瓊脂糖珠不同，磁珠是固體，抗體的結(jié)合限于磁珠的表面。磁珠 (直徑 1-4 μm) 明顯小于瓊脂糖珠 ，盡管磁珠沒有多孔中心增加結(jié)合能力，但每體積的磁珠數(shù)量比瓊脂糖珠多，使磁珠擁有足夠的抗體結(jié)合表面積滿足高容量的抗體結(jié)合。
簡而言之，瓊脂糖珠的結(jié)合能力較強，而磁珠在得率，可重復(fù)性以及自動化方面有明顯的優(yōu)勢。
免疫沉淀RIP技術(shù)選瓊脂糖珠還是磁珠？

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免疫沉淀技術(shù)（Immunoprecipitation, IP）的實驗方法通常包括以下步驟：
1. 樣本準備
2. 蛋白質(zhì)濃度測定：使用BCA、Bradford或Lowry等方法測定裂解液中蛋白質(zhì)的濃度。
3. 抗體預(yù)處理：如果使用預(yù)固定的抗體，需先將抗體固定在固相支持物上，如瓊脂糖珠或磁性微珠。
4. 免疫沉淀反應(yīng)：將裂解液與特異性抗體（固定或未固定）混合，并在4°C下緩慢搖晃孵育過夜，以允許抗體與目標蛋白質(zhì)充分結(jié)合。
5. 固相支持物的回收：對于未固定的抗體，加入與抗體特異性結(jié)合的蛋白A或蛋白G結(jié)合的固相支持物。
6. 洗滌：去除未結(jié)合的蛋白質(zhì)和雜質(zhì)，通常需要多次洗滌固相支持物。
7. 洗脫：使用適當?shù)南疵摼彌_液（如加熱的SDS加載緩沖液或酸性緩沖液）從固相支持物上洗脫免疫復(fù)合物。
8. 后續(xù)分析：對洗脫的蛋白質(zhì)進行SDS-PAGE電泳、Western Blot、質(zhì)譜分析等，以進一步分析目標蛋白質(zhì)。
免疫沉淀ChIP抗體的選擇？蘇州Protein AG免疫沉淀選磁珠還是瓊脂糖珠

免疫沉淀技術(shù)的綜述。蘇州ChIP免疫沉淀磁珠現(xiàn)貨

ChIP（染色質(zhì)免疫沉淀）實驗是一種強大的技術(shù)，用于研究蛋白質(zhì)與DNA之間的相互作用，尤其是在轉(zhuǎn)錄調(diào)控、DNA修復(fù)、復(fù)制以及表觀遺傳學(xué)領(lǐng)域。然而，像所有實驗技術(shù)一樣，ChIP實驗也有其優(yōu)點和缺點。
ChIP實驗的優(yōu)點：
1. 體內(nèi)反應(yīng)的反映：ChIP提供了一種在體內(nèi)研究蛋白質(zhì)與DNA相互作用的方法，能夠真實、完整地反映結(jié)合在DNA序列上的靶蛋白的調(diào)控信息。
2. 全基因組覆蓋：ChIP技術(shù)可以覆蓋整個基因組，提供關(guān)于蛋白質(zhì)-DNA相互作用的視圖。
3. 適用于多種蛋白質(zhì)：ChIP可以用來研究組蛋白修飾、轉(zhuǎn)錄因子以及其他DNA結(jié)合蛋白。
ChIP實驗的缺點：
1. 實驗步驟繁瑣。
2. 需要大量起始材料：ChIP實驗通常需要大量的細胞或組織作為起始材料。
3. 交聯(lián)的影響：使用交聯(lián)劑可能會改變蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)，從而影響抗體的識別和蛋白質(zhì)-DNA的相互作用。
4. 染色質(zhì)碎裂的分辨率：染色質(zhì)碎裂的效率和分辨率直接影響ChIP的準確性，需要優(yōu)化以獲得結(jié)果。
5. 抗體質(zhì)量：抗體的質(zhì)量對實驗結(jié)果至關(guān)重要，但高質(zhì)量、特異性強的抗體可能難以獲得或成本較高。
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