Real-time PCR操作流程:1、收集樣品。2相關試劑總RNA提取試劑TREzolReagent(RNA提取試劑),M-MLV(cDNA逆轉錄酶),RNA純化試劑,RealqPCRMasterMix(螢光定量PCR預混試劑)。3實驗儀器螢光定量PCR儀;PCR儀;低溫離心機。4總RNA提取。5cDNA合成在0.5ml的離心管中加入1µl模板總RNA(1µg/µl);Real-time PCR操作流程:2µl隨機引物(T18,10pmol/ul);2µl10mMdNTPmix;加水至15µl體系。混勻后70℃變性RNA5分鐘,冰上速冷1分鐘,離心將溶液收集至管底加入6µl5×PCRbuffer;1µlRNaseout;1µlM-MLVRT;加水至30µl體系。PCR儀中反應條件設定37℃延伸60min,70℃保溫15min終止反應。合成好的cDNA置于-20℃保存?zhèn)溆?。重疊延伸聚合酶鏈反應可以創(chuàng)造特定的長DNA構建體。連云港微量Real-time PCR原理及步驟
聚合酶鏈式反應準備:PCR引物設計,PCR反應中有兩條引物,即5′端引物和3′引物。設計引物時以一條DNA單鏈為基準(常以信息鏈為基準),5′端引物與位于待擴增片段5′端上的一小段DNA序列相同;3′端引物與位于待擴增片段3′端的一小段DNA序列互補。引物設計的基本原則:引物長度:15-30bp,常用為20bp左右。引物堿基:G+C含量以40-60%為宜,G+C太少擴增效果不佳,G+C過多易出現(xiàn)非特異條帶。ATGC很好隨機分布,避免5個以上的嘌呤或嘧啶核苷酸的成串排列參照。廣州組織熒光定量PCR逆轉錄-聚合酶鏈反應較廣用于表達譜,以確定基因的表達或鑒定RNA轉錄物的序列。
聚合酶鏈反應同時擴增單個精子中幾個基因座的能力增強了極大地增強了通過研究減數(shù)分裂后染色體交叉來進行基因定位的傳統(tǒng)任務。通過分析數(shù)千個單個精子,已經直接觀察到非常緊密基因座之間罕見的交叉事件。類似地,可以分析異常的缺失、插入、易位或倒位,所有這些都無需等待(或支付)漫長而艱苦的受精、胚胎發(fā)生等過程。定點突變:聚合酶鏈反應可用于產生突變基因,突變由科學家隨意選擇??梢赃x擇這些突變來理解蛋白質是如何完成其功能的,并改變或改善蛋白質功能。聚合酶鏈式反應的模板的取材主要依據PCR的擴增對象,可以是病原體標本如病毒、細菌、菌類等。
Real-time PCR鏈反應的常見問題分析與解決方法:反應緩沖液未完全融化或未充分混勻。確保反應緩沖液融化完全并徹底混勻。引物特異性差。利用BLAST檢查引物特異性或重新設計引物。引物量過多。減少反應體系中引物的用量。模板量過多。質粒DNA的用量應<50ng,而基因組DNA則應<200ng。外源DNA污染。確保操作的潔凈。陰性對照出現(xiàn)條帶:試劑,頭,工作臺污染。使用全新的試劑和頭,對工作臺進行清潔。條帶大小與理論不符:污染。使用全新的試劑和頭,對工作臺進行清潔。模板或引物使用錯誤。更換引物和模板。基因亞型。對研究的基因進行序列分析和BLAST研究。逆轉錄-聚合酶鏈反應較廣用于表達譜,以確定基因的表達或鑒定RNA轉錄物的序列。PCR由變性-退火-延伸三個基本反應步驟構成。
Real-time PCR鏈式反應的特點:靈敏度高:PCR產物的生成量是以指數(shù)方式增加的,能將皮克(pg=10-12)量級的起始待測模板擴增到微克(μg=-6)水平。能從100萬個細胞中檢出一個靶細胞;在病毒的檢測中,PCR的靈敏度可達3個RFU(空斑形成單位);在細菌學中很小檢出率為3個細菌。簡便、快速:PCR反應用耐高溫的TaqDNA聚合酶,一次性地將反應液加好后,即在DNA擴增液和水浴鍋上進行變性-退火-延伸反應,一般在2~4小時完成擴增反應。擴增產物一般用電泳分析,不一定要用同位素,無放射性污染、易推廣。純度要求低:不需要分離病毒或細菌及培養(yǎng)細胞,DNA粗制品及RNA均可作為擴增模板??芍苯佑门R床標本如血液、體腔液、洗嗽液、毛發(fā)、細胞、活組織等DNA擴增檢測。武漢微量Real-time PCR供應商聚合酶鏈反應的試劑應分配到一次性的等分試樣中。Real-time PCR提高實驗的重復性。廣州組織熒光定量PCR
PCR反應的特異性決定因素為:引物與模板DNA特異正確的結合。連云港微量Real-time PCR原理及步驟
Real-time PCR探針法適用于:1、具有高適應性和可靠性,實驗結果穩(wěn)定重複性好,特異性更高。2、適用于擴增序列專一的體系的檢測。3、樣品中靶基因含量過低的定量PCR檢測。4、靶基因的特異序列較短,無論怎樣較佳化引物設計條件都不能解決。5、存在與靶基因同源的序列,在PCR中容易出現(xiàn)非特異性擴增,對特異性要求較高的定量。6、普遍用于人類傳染病的診斷和病原定量,在動物病原體基因的檢測,畜禽產品的檢驗檢疫,生物製品的鑒定。Real-time PCR探針法:PCR擴增時在加入一對引物的同時加入一個特異性的螢光探針,該探針為一寡核苷酸,兩端分別標記一個報告螢光基團和一個淬滅螢光基團。探針完整時,報告基團發(fā)射的螢光信號被淬滅基團吸收;PCR擴增時,Taq酶的5’-3’外切酶活性將探針酶切降解,使報告螢光基團和淬滅螢光基團分離,從而螢光監(jiān)測系統(tǒng)可接收到螢光信號,即每擴增一條DNA鏈,就有一個螢光分子形成,實現(xiàn)了螢光信號的累積與PCR產物形成完全同步。連云港微量Real-time PCR原理及步驟
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