上海探普生物科技有限公司對樣本進(jìn)行宏病毒組測序具有的優(yōu)勢:全國開設(shè)病毒宏基因組測序的公司不超過3家,只有探普生物是專門為病毒研究者服務(wù)的,探普生物的研發(fā)團(tuán)隊和實驗團(tuán)隊都來自全國各地病毒學(xué)、微生物學(xué)專業(yè)的高校,碩士及以上學(xué)歷成員超過60%,團(tuán)隊具備普通測序?qū)嶒灪头治龌A(chǔ)之外,同時具備病毒學(xué)及微生物學(xué)的學(xué)術(shù)背景,相當(dāng)了解病毒相關(guān)樣本情況、研究方向等。研究者在項目咨詢的時候就可以明顯感覺到探普生物的專業(yè)性,溝通順暢,省時省力。宏基因組測序以特定環(huán)境中的整個微生物群落作為研究的對象,不需對微生物進(jìn)行分離培養(yǎng)。山東腸道微生物測序公司
病毒宏基因組測序可直接對樣本中的核酸進(jìn)行高通量測序,鑒定樣本中可能存在的病原菌,輔助臨床決策。覆蓋細(xì)菌、病毒、寄生蟲、衣原體、立克次氏體、螺旋體等13396種微生物;同時進(jìn)行耐藥基因檢測,涵蓋266種耐藥菌,2984種抗性基因。宏基因組測序在新發(fā)腹瀉病毒鑒定中的應(yīng)用:發(fā)現(xiàn)和鑒定新病毒以及確定新病毒與疾病的關(guān)系是預(yù)防、診斷和新發(fā)病毒性傳染病的首要任務(wù)。高通量測序技術(shù)突破了傳統(tǒng)技術(shù)方法的局限,可以直接以標(biāo)本中所有的遺傳物質(zhì)為研究對象,從而能夠快速地鑒定出標(biāo)本中存在的病毒,形成了一門研究特定環(huán)境中病毒群落的新興學(xué)科:病毒宏基因組學(xué)(宏病毒組)。山東腸道微生物測序公司所謂宏基因組學(xué)是一種以環(huán)境樣品中的微生物群體基因組為研究對象。
病毒宏基因組測序:在運用宏基因組測序方法檢測的樣本量位居全球前列,樣本總數(shù)居國內(nèi)第二,其中腦脊液檢測量位列全球前二強。除了傳染病的應(yīng)用場景之外,利用mNGS還可以對菌群進(jìn)行菌株鑒定分型、耐藥基因與毒力基因的檢測,適用于抗傳染院內(nèi)傳染管理的評估。在越來越多的證據(jù)表明微生物對人體免疫系統(tǒng)能夠產(chǎn)生影響,以及微生物菌群會參與到神經(jīng)退行性疾病、糖尿病等疾病的發(fā)生和發(fā)展當(dāng)中,微生物療法獲得了越來越多的關(guān)注,而mNGS未來也可以為人們深入分析人體菌群微生態(tài)、研究微生物療法提供一種可靠的技術(shù)手段。
病毒宏基因組測序的流程:在探普生物進(jìn)行病毒宏基因組測序的流程非常簡單,簡而言之,客戶只需要說清楚樣品情況,準(zhǔn)備樣品即可,其他事宜都由探普來進(jìn)行安排。大致流程如下:1)與銷售人員溝通項目需求和樣本情況;2)探普生物工作人員擬定項目合同,雙方協(xié)商合同內(nèi)容后簽字蓋章;3)按樣本準(zhǔn)備指南準(zhǔn)備好樣本,填寫信息單后通知銷售人員預(yù)訂干冰,安排樣本寄運輸;4)客戶支付項目啟動款,探普生物啟動項目實驗和分析并提供測序報告;5)客戶支付項目尾款,探普生物提交測序數(shù)據(jù)和分析結(jié)果;6)售后問題處理,項目結(jié)題。在探普生物進(jìn)行病毒宏基因組測序的流程簡單。
病原體-宏基因組的測序:1.開發(fā)了一種經(jīng)過驗證的臨床mNGS檢測方法,用于在許可的微生物實驗室中診斷腦脊髓液(CSF)引起的腦膜炎和腦炎的傳染原因。2.開發(fā)了定制的生物信息學(xué)管道SURPI+,以快速分析mNGS數(shù)據(jù),生成檢測到的病原體的自動摘要,并提供用于評估和解釋結(jié)果的圖形用戶界面。3.mNGS提供了一種全方面的方法,通過該方法可以在一次測定中準(zhǔn)確鑒定幾乎所有潛在病原體-病毒,細(xì)菌,寄生蟲。4.將mNGS測試遷移到臨床微生物學(xué)實驗室仍然面臨許多挑戰(zhàn):1、缺乏用于mNGS臨床驗證的既定藍(lán)圖;2、難以將病原體從殖民者或污染物中區(qū)分開;3、缺乏專為臨床診斷使用的生物信息學(xué)軟件;4、注重質(zhì)量和全方面性的可獲得的參考數(shù)據(jù)庫;5、臨床實驗室改進(jìn)修正案(CLIA)環(huán)境中,患者診斷測試固有的法規(guī)遵從性要求。宏基因組測序技術(shù)不依賴于微生物的分離培養(yǎng)。山東腸道微生物測序公司
宏病毒組是病毒的宏基因組,該技術(shù)是隨著高通量測序技術(shù)的興起而發(fā)展起來的。山東腸道微生物測序公司
目前構(gòu)建的病毒宏基因組學(xué)文庫主要有載體克隆文庫和基于高通量測序技術(shù)的加接頭的文庫。隨著深度測序技術(shù)的不斷發(fā)展,第二代高通量測序技術(shù)、第三代單分子測序技術(shù)已經(jīng)普遍地應(yīng)用于各項研究領(lǐng)域中,以454測序技術(shù)和Illumina測序技術(shù)為表示的二代測序法得到迅速推廣用于構(gòu)建病毒宏基因組文庫,相信將來第三代測序平臺如tSMSTM(truesinglemolecularsequeneing)技術(shù)平臺、SMRT(singlemoleculereal-time)技術(shù)平臺、FRET測序技術(shù)及納米孔單分子技術(shù)為表示的第三代測序法也將應(yīng)用于構(gòu)建病毒宏基因組文庫。Donaldson等[23]采用高通量測序技術(shù)構(gòu)建了蝙蝠腸道的病毒宏基因組學(xué)文庫,獲得了600000條讀長(Reads)的核酸序列。山東腸道微生物測序公司
上海探普生物科技有限公司位于放鶴路1088號6號樓307,是一家專業(yè)的從事生物科技專業(yè)領(lǐng)域內(nèi)技術(shù)開發(fā)、技術(shù)轉(zhuǎn)讓、技術(shù)咨詢、技術(shù)服務(wù),化工原料及產(chǎn)品(除危險化學(xué)品、監(jiān)控化學(xué)品、煙花爆竹、易制毒化學(xué)品),實驗室設(shè)備,計算機、軟件及輔助設(shè)備,電子產(chǎn)品銷售,計算機軟件開發(fā)及維護(hù),計算機信息系統(tǒng)集成服務(wù)等。公司。專業(yè)的團(tuán)隊大多數(shù)員工都有多年工作經(jīng)驗,熟悉行業(yè)專業(yè)知識技能,致力于發(fā)展探普的品牌。公司堅持以客戶為中心、從事生物科技專業(yè)領(lǐng)域內(nèi)技術(shù)開發(fā)、技術(shù)轉(zhuǎn)讓、技術(shù)咨詢、技術(shù)服務(wù),化工原料及產(chǎn)品(除危險化學(xué)品、監(jiān)控化學(xué)品、煙花爆竹、易制毒化學(xué)品),實驗室設(shè)備,計算機、軟件及輔助設(shè)備,電子產(chǎn)品銷售,計算機軟件開發(fā)及維護(hù),計算機信息系統(tǒng)集成服務(wù)等。市場為導(dǎo)向,重信譽,保質(zhì)量,想客戶之所想,急用戶之所急,全力以赴滿足客戶的一切需要。上海探普生物始終以質(zhì)量為發(fā)展,把顧客的滿意作為公司發(fā)展的動力,致力于為顧客帶來***的病毒測序,病毒全基因組測序,病毒宏基因組測序,未知病原鑒定。