深度測序技術(shù)對經(jīng)濟市場具有的影響:未來社會的創(chuàng)新驅(qū)動將由信息技術(shù)向心理社會健康方面轉(zhuǎn)移??梢灶A(yù)見,全球老年化社會到來后的經(jīng)濟主戰(zhàn)場將是健康行業(yè),而以基因測序預(yù)測健康和臨床準確分型的市場將會越來越大。深度測序相關(guān)的經(jīng)濟市場有兩個方面。一是測序儀器和技術(shù)相關(guān)的市場,二是測序應(yīng)用市場的競爭。一個顯見的例子是,近年來深度測序技術(shù)促進了對肺病的進一步認識和分型,更多的位點突變?nèi)鏏LK、ERCC1、MET、PI3K、RRM1等被陸續(xù)發(fā)現(xiàn),多基因檢測肺病致病驅(qū)動基因?qū)︶t(yī)生準確選擇靶向藥物十分重要。以肺病中常見的EGFR突變型為例,對于敏感性基因突變(19Del+L858R),第1代靶向藥物(如易瑞沙等)可以進行良好的調(diào)整和控制;但是對于耐藥性基因突變(T790M),則需要第三代靶向藥物(AZD9291)才有較好的臨床效果。不久的將來,病癥患者將獲得更具個性化的藥物,從而達到準確醫(yī)療。病毒全基因組測序產(chǎn)品特點:結(jié)果穩(wěn)定可靠。武漢高通量測序分析上哪找
病毒全基因組測序定:目前對我國首例輸入性裂谷熱病例病毒進行全基因組測定,分析其進化來源及潛在變異,方法提取樣本核酸,非特異性反轉(zhuǎn)錄擴增病毒基因組RNA,使用IonTorrent二代測序儀進行病毒全基因組測定.對獲得的基因組數(shù)據(jù)進行序列拼接、比對、進化樹構(gòu)建和關(guān)鍵位點分析.結(jié)果通過測定獲得了病毒全基因組11979nt,該測定病毒屬E基因分支,序列與先前南非分離株Kakamas相似度較高(>98%).病毒Gn蛋白C端信號肽區(qū)存在1個氨基酸突變.結(jié)論本研究分析測定的裂谷熱病毒全基因組與目前非洲流行株高度相似,病毒基因特征未出現(xiàn)明顯變異。北京二代測序突變分析服務(wù)公司病毒全基因組測序產(chǎn)品特點:對采集臨床樣本直接檢測。
病毒全基因組測序定:測序深度,測序得到的堿基總量(bp)與基因組大?。℅enome)的比值,它是評價測序量的指標之一。測序深度(SequencingDepth):測序得到的堿基總量(bp)與基因組大?。℅enome)的比值,它是評價測序量的指標之一。測序深度與基因組覆蓋度之間是一個正相關(guān)的關(guān)系,測序帶來的錯誤率或假陽性結(jié)果會隨著測序深度的提升而下降。重測序的個體,如果采用的是雙末端或Mate-Pair方案,當測序深度在10~15X以上時,基因組覆蓋度和測序錯誤率控制均得以保證。
深度測序技術(shù)對科學研究范式相關(guān)影響:個性化醫(yī)學、P4醫(yī)學和準確醫(yī)學等研究范式都是在近幾年深度測序技術(shù)迅猛發(fā)展的基礎(chǔ)上提出的。個人基因組測定的可行性,使得大眾有可能測定和分析自己的基因組、尋找到個人健康相關(guān)的基因風險因素,從而可以在生活習慣、飲食等方面提早進行個性化預(yù)測和預(yù)防。由于互聯(lián)網(wǎng)的發(fā)展和即時檢驗技術(shù)(point-of-care-testing,POCT)的應(yīng)用,人們可以通過網(wǎng)絡(luò)進行交流和參與到整個診療過程,這便是P4醫(yī)學的概念:預(yù)測性(predictive)、預(yù)防性(preventive)、個性化(personalized)及參與性(participatory)。全基因組測序能檢測個體基因組中的全部遺傳信息,準確性高。
發(fā)現(xiàn)病例的要盡快對病毒進行全基因組測序的原因是:通過對病毒全基因組高通量測序可以在較短時間內(nèi)獲取病毒的全部基因信息,解釋病毒的來源、傳播、變異演化等科學問題,為后續(xù)流行病學調(diào)查指明方向,為相關(guān)病例的追蹤溯源提供重要依據(jù),目前對病毒溯源分型主要檢測手段就是高通量測序技術(shù)。高通量測序技術(shù)如何進行病毒溯源?先對獲得的早期病例標本開展病毒全基因組高通量序列測定,通過與本地流行病毒及全球其他地區(qū)測定過序列的病毒比較,如果該病例傳染的病毒在基因組上和北美流行株更接近,比如在全長接近3萬個堿基的序列上,兩者只相差幾個堿基,相似度為99%以上,這就是為我們推斷該病例攜帶病毒為北美流行株提供依據(jù)。高通量測序技術(shù)正式啟用之后,研究者可以將樣品處理至標準濃度和體積后進行測序和分析。四川全基因組病毒二代測序要多久
高通量測序技術(shù)本身并不是以病毒為目標開發(fā)的。武漢高通量測序分析上哪找
RNA病毒基因組測序工作:動物、人、植物被特定病毒株侵染、分離到病毒株、連續(xù)傳代的病毒株往往都需要獲得盡量完整的基因組序列來指導下一步的研究,傳統(tǒng)的sanger測序需要了解序列、設(shè)計引物、做很多PCR,往往效率很低,而NGS作為一種無需特異性引物擴增的測序方式,可以直接從RNA中獲得序列。如果,1,您的目的是:獲得一種指定RNA病毒盡量完整的序列;2,您可以提供該病毒的中英文名稱;3,您了解樣本中病毒的載量情況、培養(yǎng)狀況、ct值等任一信息。那么,RNA病毒基因組測序可以幫助你,探普為你準備了完整的下單、樣本準備方法。武漢高通量測序分析上哪找
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