鄭州宏病毒學分析診斷

病毒宏基因組測序的研究案例：噬菌體是糞便病毒組的主要成員，糞便病毒組移植（FVT）或能有效的調(diào)節(jié)腸道菌群。在該項概念驗證試驗中發(fā)現(xiàn)，接受瘦小鼠的糞便病毒組移植后，飼喂高脂食物的小鼠體重增長變慢，同時還能保持正常的血糖指標，F(xiàn)VT引起的腸道菌群變化介導了這些保護性功能代謝作用。這項研究表明，F(xiàn)VT療法或能用來改善肥胖和糖尿病等腸道菌群相關(guān)代謝類疾病。對噬菌體不造成損傷，大程度保證了病毒活性，適用于下游FVT研究。宏病毒組學(ViralMetagenomics)是宏基因組學的一個分支，但與傳統(tǒng)的宏基因組學概念不同，它是在宏基因組學概念的基礎(chǔ)上，結(jié)合病毒自身的特點，將宏基因組學方法應(yīng)用到病毒學領(lǐng)域而形成的。DNA宏基因組測序已被用于診斷各種臨床傳染性疾病。鄭州宏病毒學分析診斷

在傳統(tǒng)的診斷檢測中對病原體的診斷檢測是通過體外培養(yǎng)的方式進行，但是不同微生物的培養(yǎng)條件不一樣；不同的微生物的培養(yǎng)技術(shù)要求也不一樣；同時，體外培養(yǎng)受時間、空間和培養(yǎng)技術(shù)人員的限制。宏基因組分析技術(shù)是一種的病源體診斷檢測技術(shù)，可以在不通過任何培養(yǎng)過程的條件下，通過基因序列的比對，發(fā)現(xiàn)和鑒別罕見病源體引起的疾病，從而針對性地使用藥物，使病源微生物傳染所形成的疾病的準確、高效。元基因組（宏基因組）學研究不要求對每個微生物進行分離、純化和培養(yǎng)，而是直接從樣品中提取基因組DNA后進行測序分析。通過元基因組測序，能夠揭示微生物群落多樣性、種群結(jié)構(gòu)、進化關(guān)系、功能活性及環(huán)境之間的相互協(xié)作關(guān)系，極大地擴展了微生物學的研究范圍。北京病毒多樣性分析服務(wù)宏基因組測序技術(shù)，克服了傳統(tǒng)的純培養(yǎng)方法的技術(shù)限制。

目前構(gòu)建的病毒宏基因組學文庫主要有載體克隆文庫和基于高通量測序技術(shù)的加接頭的文庫。隨著深度測序技術(shù)的不斷發(fā)展，第二代高通量測序技術(shù)、第三代單分子測序技術(shù)已經(jīng)普遍地應(yīng)用于各項研究領(lǐng)域中，以454測序技術(shù)和Illumina測序技術(shù)為表示的二代測序法得到迅速推廣用于構(gòu)建病毒宏基因組文庫，相信將來第三代測序平臺如tSMSTM（truesinglemolecularsequeneing）技術(shù)平臺、SMRT（singlemoleculereal-time）技術(shù)平臺、FRET測序技術(shù)及納米孔單分子技術(shù)為表示的第三代測序法也將應(yīng)用于構(gòu)建病毒宏基因組文庫。Donaldson等[23]采用高通量測序技術(shù)構(gòu)建了蝙蝠腸道的病毒宏基因組學文庫，獲得了600000條讀長（Reads）的核酸序列。

宏病毒組學是宏基因組學的一個分支，但與傳統(tǒng)的宏基因組學概念不同，它是在宏基因組學概念的基礎(chǔ)上，結(jié)合病毒自身的特點，將宏基因組學方法應(yīng)用到病毒學領(lǐng)域而形成的。2002年，Breitbart等(BreitbartM,etal,2002)將宏基因組學方法應(yīng)用于海洋病毒群落的研究，發(fā)現(xiàn)噬菌體為海水中主要病毒組，這一研究標志著宏病毒組學正式應(yīng)用于科學研究。簡而言之，宏病毒組學就是應(yīng)用特殊方法把特定環(huán)境中所有病毒與其他微生物分開，然后提取的病毒核酸，用高通量技術(shù)進行病毒核酸測序，依托現(xiàn)有數(shù)據(jù)庫進行相應(yīng)的比對工作，并運用軟件分析處理后得到研究樣品中病毒群落的組成信息。病原微生物二代測序，也稱宏基因組測序（mNGS）。

病毒宏基因組測序是在宏基因組學理論的基礎(chǔ)上,結(jié)合現(xiàn)有的病毒分子生物學檢測技術(shù)而興起的一個新的學科分支。而所謂宏基因組學(metagenomics)就是一種以環(huán)境樣品中的微生物群體基因組為研究對象,以功能基因篩選和測序分析為研究手段,以微生物多樣性、種群結(jié)構(gòu)、進化關(guān)系、功能活性、相互協(xié)作關(guān)系及與環(huán)境之間的關(guān)系為研究目的的新的微生物研究方法。一般包括從環(huán)境樣品中提取基因組DNA,克隆DNA到合適的載體,導入宿主菌體,篩選目的轉(zhuǎn)化子等工作。生物進行病毒宏基因組測序，樣品具備什么條件才可以獲得比較質(zhì)量的宏基因組分析效果？北京病毒多樣性分析服務(wù)

宏基因組是1998年提出的新名詞。鄭州宏病毒學分析診斷

優(yōu)化臨床制備病毒宏基因組測序所用樣本的方法：①介紹高通量病毒宏基因組測序的樣本制備步驟，對臨床樣本的總核酸進行隨機擴增；②檢測了從血漿樣本中富集/擴增DNA及RNA病毒的不同方法，一種包括過濾、核酸酶消化、在不同反應(yīng)中隨機擴增DNA及RNA的步驟是較好的；③隨后在包含了不同病毒科的樣本中驗證此方法，可高讀數(shù)地檢測到大多數(shù)病毒序列，且優(yōu)于現(xiàn)行的其它樣本制備方法；④該方法不只適用于血漿樣本，還可用于尿液、咽喉拭子等臨床樣本。鄭州宏病毒學分析診斷

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