上海二代測序技術

來源: 發(fā)布時間:2023-06-25

對病毒的全基因組進行測序:對病毒的全基因組進行測序主要是通過非特異性擴增+克隆結合sanger測序來完成的。當物種有了參考的序列之后,可以通過特異性擴增+sanger測序獲得全基因組序列。Sanger測序準確度高,讀長很長,但與此同時,擴增和克隆工作費時費力,由于流程繁瑣,加上快速變異導致引物無法通用,該方法對于大量基因組的測序工作而言,可操作性不強,這對于研究者一直是一個困擾。高通量測序技術正式啟用之后,研究者可以將樣品處理至標準濃度和體積后進行測序和分析,減少了工作量,增加了成功率。探普生物進行了大量有針對性的研發(fā)和測試,開發(fā)了全套的實驗和分析流程用于對病毒的全基因組進行測序,該流程自運行以來廣受研究者們好評。


DNA病毒基因組測序:一種指定DNA病毒盡量完整的序列。上海二代測序技術

上海二代測序技術,病毒全基因組測序

能實現(xiàn)對病毒的全基因組進行測序的技術手段:早期在高通量測序技術普及之前,對病毒的全基因組進行測序是通過非特異性擴增+克隆結合sanger測序來完成的。當物種有了參考的序列之后,可以通過特異性擴增+sanger測序獲得全基因組序列。Sanger測序準確度高,讀長很長,但與此同時,擴增和克隆工作費時費力,由于流程繁瑣,加上快速變異導致引物無法通用,該方法對于大量基因組的測序工作而言,可操作性不強,這對于研究者一直是一個困擾。高通量測序技術正式啟用之后,研究者可以將樣品處理至標準濃度和體積后進行測序和分析,減少了工作量,增加了成功率。探普生物進行了大量有針對性的研發(fā)和測試,開發(fā)了全套的實驗和分析流程用于對病毒的全基因組進行測序,該流程自運行以來廣受研究者們好評。




成都病毒高通量測序服務公司測序的完成程度,決定著基因組的下游應用。

上海二代測序技術,病毒全基因組測序

深度測序技術對經(jīng)濟市場具有的影響:未來社會的創(chuàng)新驅動將由信息技術向心理社會健康方面轉移??梢灶A見,全球老年化社會到來后的經(jīng)濟主戰(zhàn)場將是健康行業(yè),而以基因測序預測健康和臨床準確分型的市場將會越來越大。深度測序相關的經(jīng)濟市場有兩個方面。一是測序儀器和技術相關的市場,二是測序應用市場的競爭。一個顯見的例子是,近年來深度測序技術促進了對肺病的進一步認識和分型,更多的位點突變?nèi)鏏LK、ERCC1、MET、PI3K、RRM1等被陸續(xù)發(fā)現(xiàn),多基因檢測肺病致病驅動基因對醫(yī)生準確選擇靶向藥物十分重要。以肺病中常見的EGFR突變型為例,對于敏感性基因突變(19Del+L858R),第1代靶向藥物(如易瑞沙等)可以進行良好的調(diào)整和控制;但是對于耐藥性基因突變(T790M),則需要第三代靶向藥物(AZD9291)才有較好的臨床效果。不久的將來,病癥患者將獲得更具個性化的藥物,從而達到準確醫(yī)療。


目前對我國首例輸入性裂谷熱病例病毒進行全基因組測定,分析其進化來源及潛在變異.方法提取樣本核酸,非特異性反轉錄擴增病毒基因組RNA,使用IonTorrent二代測序儀進行病毒全基因組測定.對獲得的基因組數(shù)據(jù)進行序列拼接、比對、進化樹構建和關鍵位點分析.結果通過測定獲得了病毒全基因組11979nt,該測定病毒屬E基因分支,序列與先前南非分離株Kakamas相似度較高(>98%).病毒Gn蛋白C端信號肽區(qū)存在1個氨基酸突變.結論本研究分析測定的裂谷熱病毒全基因組與目前非洲流行株高度相似,病毒基因特征未出現(xiàn)明顯變異。


新一代測序中基因從頭測序和重測序有什么區(qū)別?

上海二代測序技術,病毒全基因組測序

需要對病毒的全基因組進行測序的應用場景:在探普生物長時間運行過程中,我們接觸到的對病毒的全基因組進行測序項目有比較豐富的應用場景。先,從事基因進化/疫苗/藥品/抗體研制方向的研究的研究者一定會用到測序。這種場景一般是用密集的sanger測序監(jiān)測某幾個關鍵基因,搭載一定頻率的全基因組測序。這樣的組合省時省力省經(jīng)費,同時能達到研究目的。此外,有的單位需要對傳染病的病原進行流行病學監(jiān)測和研究,如疾控/疫控中心、醫(yī)院的傳染病科室以及一些高校和研究所的相應課題組,可能需要對病毒的全基因組進行測序以后,結合其他上下游的研究數(shù)據(jù),達到研究或者監(jiān)測疫病的目的。


二代測序相較sanger測序,差異主要就是單次運行可以獲得海量的數(shù)據(jù)量。上海二代測序技術

Sanger測序準確度高,讀長很長。上海二代測序技術

病毒全基因組測序定在探普生物長時間運行過程中,我們接觸到的對病毒的全基因組進行測序項目有比較豐富的應用場景。先,從事基因進化/疫苗/藥品/抗體研制方向的研究的研究者一定會用到測序。這種場景一般是用密集的sanger測序監(jiān)測某幾個關鍵基因,搭載一定頻率的全基因組測序。這樣的組合省時省力省經(jīng)費,同時能達到研究目的。此外,有的單位需要對傳染病的病原進行流行病學監(jiān)測和研究,如疾控/疫控中心、醫(yī)院的傳染病科室以及一些高校和研究所的相應課題組,可能需要對病毒的全基因組進行測序以后,結合其他上下游的研究數(shù)據(jù),達到研究或者監(jiān)測疫病的目的。


上海二代測序技術

上海探普生物科技有限公司在病毒測序,病毒全基因組測序,病毒宏基因組測序,未知病原鑒定一直在同行業(yè)中處于較強地位,無論是產(chǎn)品還是服務,其高水平的能力始終貫穿于其中。公司始建于2018-10-30,在全國各個地區(qū)建立了良好的商貿(mào)渠道和技術協(xié)作關系。上海探普生物以病毒測序,病毒全基因組測序,病毒宏基因組測序,未知病原鑒定為主業(yè),服務于醫(yī)藥健康等領域,為全國客戶提供先進病毒測序,病毒全基因組測序,病毒宏基因組測序,未知病原鑒定。產(chǎn)品已銷往多個國家和地區(qū),被國內(nèi)外眾多企業(yè)和客戶所認可。