高通量測序技術(shù)又稱“下一代“測序技術(shù)或深度測序技術(shù),可以一次性對幾十萬至幾百萬條DNA分子進(jìn)行序列測定。現(xiàn)已普遍應(yīng)用在基因組測序、基因表達(dá)分析、非編碼小分子RNA鑒定、轉(zhuǎn)錄因子靶基因篩選及DNA甲基化等相關(guān)的研究領(lǐng)域。高通量測序技術(shù)是對傳統(tǒng)測序一次性的改變,一次對幾十萬到幾百萬條DNA分子進(jìn)行序列測定,因此在有些文獻(xiàn)中稱其為下一代測序技術(shù)(nextgenerationsequencing)足見其劃時(shí)代的改變,同時(shí)高通量測序使得對一個(gè)物種的轉(zhuǎn)錄組和基因組進(jìn)行細(xì)致全貌的分析成為可能,所以又被稱為深度測序(deepsequencing)。新一代測序中基因從頭測序和重測序有什么區(qū)別?國內(nèi)病毒測序進(jìn)化分析
能實(shí)現(xiàn)對病毒的全基因組進(jìn)行測序的技術(shù)手段:早期在高通量測序技術(shù)普及之前,對病毒的全基因組進(jìn)行測序是通過非特異性擴(kuò)增+克隆結(jié)合sanger測序來完成的。當(dāng)物種有了參考的序列之后,可以通過特異性擴(kuò)增+sanger測序獲得全基因組序列。Sanger測序準(zhǔn)確度高,讀長很長,但與此同時(shí),擴(kuò)增和克隆工作費(fèi)時(shí)費(fèi)力,由于流程繁瑣,加上快速變異導(dǎo)致引物無法通用,該方法對于大量基因組的測序工作而言,可操作性不強(qiáng),這對于研究者一直是一個(gè)困擾。高通量測序技術(shù)正式啟用之后,研究者可以將樣品處理至標(biāo)準(zhǔn)濃度和體積后進(jìn)行測序和分析,減少了工作量,增加了成功率。探普生物進(jìn)行了大量有針對性的研發(fā)和測試,開發(fā)了全套的實(shí)驗(yàn)和分析流程用于對病毒的全基因組進(jìn)行測序,該流程自運(yùn)行以來廣受研究者們好評。病毒全基因組測序排行病毒基因組測序包括完成圖測序、掃描圖測序和重測序幾個(gè)層面。
病毒全基因組測序定在探普生物長時(shí)間運(yùn)行過程中,我們接觸到的對病毒的全基因組進(jìn)行測序項(xiàng)目有比較豐富的應(yīng)用場景。先,從事基因進(jìn)化/疫苗/藥品/抗體研制方向的研究的研究者一定會(huì)用到測序。這種場景一般是用密集的sanger測序監(jiān)測某幾個(gè)關(guān)鍵基因,搭載一定頻率的全基因組測序。這樣的組合省時(shí)省力省經(jīng)費(fèi),同時(shí)能達(dá)到研究目的。此外,有的單位需要對傳染病的病原進(jìn)行流行病學(xué)監(jiān)測和研究,如疾控/疫控中心、醫(yī)院的傳染病科室以及一些高校和研究所的相應(yīng)課題組,可能需要對病毒的全基因組進(jìn)行測序以后,結(jié)合其他上下游的研究數(shù)據(jù),達(dá)到研究或者監(jiān)測疫病的目的。
病毒全基因組測序具有的特點(diǎn):1.不預(yù)設(shè)目標(biāo)檢出物,樣本的所有病原信息一網(wǎng)打盡;2.無需培養(yǎng)和特異性擴(kuò)增,對采集臨床樣本直接檢測;3.獨(dú)有的一定定量技術(shù),實(shí)現(xiàn)病原定量分析,使病原診斷更準(zhǔn)確;4.與臨床各領(lǐng)域有名**共同打造呼吸道系統(tǒng)、神經(jīng)內(nèi)科系統(tǒng)和血流系統(tǒng)傳染病原數(shù)據(jù)庫,更加貼合需求;5.采用高通量測序儀,全流程質(zhì)控,結(jié)果穩(wěn)定可靠;6.整體檢出率陽性率較傳統(tǒng)方法提升25~30%:肺泡灌洗液檢出率60~80%,腦脊液檢出率40~60%,血液檢出率40~60%;7.專業(yè)化服務(wù):臨床微生物**出具報(bào)告,專業(yè)醫(yī)學(xué)團(tuán)隊(duì)報(bào)告解讀。針對疑難報(bào)告,由**進(jìn)行深度解析;8.完善的售后服務(wù):基于PCR技術(shù)和抗原抗體技術(shù)的售后驗(yàn)證平臺,致力于解決臨床的每一個(gè)疑問。DNA病毒基因組測序:一種指定DNA病毒盡量完整的序列。
病毒全基因組測序,高通量測序技術(shù)的發(fā)展在生物信息學(xué)分析方面,通過新的分析軟件的研發(fā)和原有分析軟件的升級,對測序所得數(shù)據(jù)的分析也變得更加可靠;除此之外,伴隨著BasSpace等服務(wù)的出現(xiàn),進(jìn)行數(shù)據(jù)分析工作所需的設(shè)備成本也在逐步降低。將來,伴隨著高通量測序技術(shù)與數(shù)據(jù)分析技術(shù)的不斷進(jìn)步,測序精度與可靠性的上升,測序與數(shù)據(jù)分析成本的下降,高通量測序技術(shù)會(huì)在各個(gè)領(lǐng)域得到應(yīng)用。在病原微生物檢測和鑒定應(yīng)用中,高通量測序技術(shù)勢必會(huì)成為不可或缺的技術(shù)并發(fā)揮越來越重要的作用。高通量測序?qū)嶒?yàn)足夠靈敏和完善,方能獲得準(zhǔn)確、可信任的結(jié)果。病毒全基因組測序具有的特點(diǎn):采用高通量測序儀,全流程質(zhì)控。浙江全基因組二代測序分析方法
測序覆蓋度是反映測序隨機(jī)性的指標(biāo)之一。國內(nèi)病毒測序進(jìn)化分析
深度測序技術(shù)對經(jīng)濟(jì)市場的影響:未來社會(huì)的創(chuàng)新驅(qū)動(dòng)將由信息技術(shù)向心理社會(huì)健康方面轉(zhuǎn)移??梢灶A(yù)見,全球老年化社會(huì)到來后的經(jīng)濟(jì)主戰(zhàn)場將是健康行業(yè),而以基因測序預(yù)測健康和臨床準(zhǔn)確分型的市場將會(huì)越來越大。深度測序相關(guān)的經(jīng)濟(jì)市場有兩個(gè)方面。一是測序儀器和技術(shù)相關(guān)的市場,二是測序應(yīng)用市場的競爭。一個(gè)顯見的例子是,近年來深度測序技術(shù)促進(jìn)了對肺病的進(jìn)一步認(rèn)識和分型,更多的位點(diǎn)突變?nèi)鏏LK、ERCC1、MET、PI3K、RRM1等被陸續(xù)發(fā)現(xiàn),多基因檢測肺病致病驅(qū)動(dòng)基因?qū)︶t(yī)生準(zhǔn)確選擇靶向藥物十分重要。以肺病中常見的EGFR突變型為例,對于敏感性基因突變(19Del+L858R),第1代靶向藥物(如易瑞沙等)可以進(jìn)行良好的調(diào)整和控制;但是對于耐藥性基因突變(T790M),則需要第三代靶向藥物(AZD9291)才有較好的臨床效果。不久的將來,病癥患者將獲得更具個(gè)性化的藥物,從而達(dá)到準(zhǔn)確醫(yī)療。國內(nèi)病毒測序進(jìn)化分析
上海探普生物科技有限公司是我國病毒測序,病毒全基因組測序,病毒宏基因組測序,未知病原鑒定專業(yè)化較早的有限責(zé)任公司(自然)之一,公司位于放鶴路1088號6號樓307,成立于2018-10-30,迄今已經(jīng)成長為醫(yī)藥健康行業(yè)內(nèi)同類型企業(yè)的佼佼者。公司主要提供從事生物科技專業(yè)領(lǐng)域內(nèi)技術(shù)開發(fā)、技術(shù)轉(zhuǎn)讓、技術(shù)咨詢、技術(shù)服務(wù),化工原料及產(chǎn)品(除危險(xiǎn)化學(xué)品、監(jiān)控化學(xué)品、煙花爆竹、易制毒化學(xué)品),實(shí)驗(yàn)室設(shè)備,計(jì)算機(jī)、軟件及輔助設(shè)備,電子產(chǎn)品銷售,計(jì)算機(jī)軟件開發(fā)及維護(hù),計(jì)算機(jī)信息系統(tǒng)集成服務(wù)等。等領(lǐng)域內(nèi)的業(yè)務(wù),產(chǎn)品滿意,服務(wù)可高,能夠滿足多方位人群或公司的需要。多年來,已經(jīng)為我國醫(yī)藥健康行業(yè)生產(chǎn)、經(jīng)濟(jì)等的發(fā)展做出了重要貢獻(xiàn)。