目前深度測序數(shù)據(jù)是生物醫(yī)學(xué)領(lǐng)域數(shù)量增加快、應(yīng)用廣的數(shù)據(jù)，對這些數(shù)據(jù)的管理、分析和應(yīng)用給生物信息學(xué)帶來了巨大的挑戰(zhàn)。早期的測序技術(shù)是“測定沒有計算快”，下一代測序技術(shù)發(fā)展以來，變?yōu)槿缃竦摹坝嬎銢]有測定快”。深度測序數(shù)據(jù)的迅猛增長使得數(shù)據(jù)科學(xué)分析方面的人才十分缺乏，深度測序和大數(shù)據(jù)處理都是新生事物，將深度測序數(shù)據(jù)應(yīng)用到臨床更需要數(shù)學(xué)統(tǒng)計、計算機和生物、臨床醫(yī)學(xué)領(lǐng)域的多學(xué)科交叉的高級人才。測序深度是測序量除以基因組長度,例如測序深度10*就相當(dāng)于測了10次的全基因組。病毒全基因組測序產(chǎn)品特點：對采集臨床樣本直接檢測。RNA病毒全序列排行
目前對我國首例輸入性裂谷熱病例病毒進行全基因組測定,分析其進化來源及潛在變異.方法提取樣本核酸,非特異性反轉(zhuǎn)錄擴增病毒基因組RNA,使用IonTorrent二代測序儀進行病毒全基因組測定.對獲得的基因組數(shù)據(jù)進行序列拼接、比對、進化樹構(gòu)建和關(guān)鍵位點分析.結(jié)果通過測定獲得了病毒全基因組11979nt,該測定病毒屬E基因分支,序列與先前南非分離株Kakamas相似度較高(＞98％)。病毒Gn蛋白C端信號肽區(qū)存在1個氨基酸突變.結(jié)論本研究分析測定的裂谷熱病毒全基因組與目前非洲流行株高度相似,病毒基因特征未出現(xiàn)明顯變異。廣州深度測序檢測病毒全基因組測序產(chǎn)品特點：樣本的所有病原信息一網(wǎng)打盡。
對病毒的全基因組進行測序：對病毒的全基因組進行測序主要是通過非特異性擴增+克隆結(jié)合sanger測序來完成的。當(dāng)物種有了參考的序列之后，可以通過特異性擴增+sanger測序獲得全基因組序列。Sanger測序準確度高，讀長很長，但與此同時，擴增和克隆工作費時費力，由于流程繁瑣，加上快速變異導(dǎo)致引物無法通用，該方法對于大量基因組的測序工作而言，可操作性不強，這對于研究者一直是一個困擾。高通量測序技術(shù)正式啟用之后，研究者可以將樣品處理至標準濃度和體積后進行測序和分析，減少了工作量，增加了成功率。探普生物進行了大量有針對性的研發(fā)和測試，開發(fā)了全套的實驗和分析流程用于對病毒的全基因組進行測序，該流程自運行以來廣受研究者們好評。
哪些應(yīng)用場景需要對病毒的全基因組進行測序？在探普生物長時間運行過程中，我們接觸到的對病毒的全基因組進行測序項目有比較豐富的應(yīng)用場景。先，從事基因進化/疫苗/藥品/抗體研制方向的研究的研究者一定會用到測序。這種場景一般是用密集的sanger測序監(jiān)測某幾個關(guān)鍵基因，搭載一定頻率的全基因組測序。這樣的組合省時省力省經(jīng)費，同時能達到研究目的。此外，有的單位需要對傳染病的病原進行流行病學(xué)監(jiān)測和研究，如疾控/疫控中心、醫(yī)院的傳染病科室以及一些高校和研究所的相應(yīng)課題組，可能需要對病毒的全基因組進行測序以后，結(jié)合其他上下游的研究數(shù)據(jù)，達到研究或者監(jiān)測疫病的目的。測序的完成程度，決定著基因組的下游應(yīng)用。
高通量基因組測序中，什么是測序深度和覆蓋度？測序深度是指測序得到的總堿基數(shù)與待測基因組大小的比值。假設(shè)一個基因大小為2M，測序深度為10X，那么獲得的總數(shù)據(jù)量為20M。覆蓋度是指測序獲得的序列占整個基因組的比例。由于基因組中的高GC、重復(fù)序列等復(fù)雜結(jié)構(gòu)的存在，測序終拼接組裝獲得的序列往往無法覆蓋有所的區(qū)域，這部分沒有獲得的區(qū)域就稱為Gap。例如一個細菌基因組測序，覆蓋度是98%，那么還有2%的序列區(qū)域是沒有通過測序獲得的。分析不同大小和不同樣品類型的UViGs對于探索病毒基因組序列空白是有價值的。江蘇病毒序列測序進化分析公司
在探普生物長時間運行過程中，接觸到的對病毒的全基因組進行測序項目有比較豐富的應(yīng)用場景。RNA病毒全序列排行
病毒全基因組測序定：上海探普生物科技有限公司的對病毒的全基因組進行測序有什么優(yōu)勢？全國開設(shè)病毒相關(guān)測序的公司不超過5家，只有探普生物是專門為病毒研究者服務(wù)的，探普生物的研發(fā)團隊和實驗團隊都來自全國各地病毒學(xué)、微生物學(xué)專業(yè)的高校，碩士及以上學(xué)歷成員超過60%，團隊具備普通測序?qū)嶒灪头治龌A(chǔ)之外，同時具備病毒學(xué)及微生物學(xué)的學(xué)術(shù)背景，相當(dāng)了解病毒相關(guān)樣本情況、研究方向等。研究者在項目咨詢的時候就可以明顯感覺到探普生物的專業(yè)性，溝通順暢，省時省力。RNA病毒全序列排行
上海探普生物科技有限公司位于放鶴路1088號6號樓307，擁有一支專業(yè)的技術(shù)團隊。專業(yè)的團隊大多數(shù)員工都有多年工作經(jīng)驗，熟悉行業(yè)專業(yè)知識技能，致力于發(fā)展探普的品牌。公司以用心服務(wù)為重點價值，希望通過我們的專業(yè)水平和不懈努力，將從事生物科技專業(yè)領(lǐng)域內(nèi)技術(shù)開發(fā)、技術(shù)轉(zhuǎn)讓、技術(shù)咨詢、技術(shù)服務(wù)，化工原料及產(chǎn)品（除危險化學(xué)品、監(jiān)控化學(xué)品、煙花爆竹、易制毒化學(xué)品），實驗室設(shè)備，計算機、軟件及輔助設(shè)備，電子產(chǎn)品銷售，計算機軟件開發(fā)及維護，計算機信息系統(tǒng)集成服務(wù)等。等業(yè)務(wù)進行到底。上海探普生物始終以質(zhì)量為發(fā)展，把顧客的滿意作為公司發(fā)展的動力，致力于為顧客帶來***的病毒測序，病毒全基因組測序，病毒宏基因組測序，未知病原鑒定。