病毒(Virus)由一種核酸分子(DNA或RNA)與蛋白質(zhì)(Protein)構(gòu)成或由蛋白質(zhì)構(gòu)成(如朊病毒)。根據(jù)遺傳物質(zhì)的組成,可分為單鏈DNA病毒(ssDNA)、雙鏈DNA病毒(dsDNA)、單鏈RNA病毒(ssRNA)、雙鏈RNA病毒(dsRNA)和蛋白質(zhì)病毒(如朊病毒)。根據(jù)宿主類型的不同,可以分為噬菌體(細(xì)菌病毒)、植物病毒(煙花葉病毒)和動(dòng)物病毒(如禽流感病毒、天花病毒和HIV等)。病毒全基因組測(cè)序(VirusWholeGenomeSequencing,VWGS),是指基于第二代高通量測(cè)序技術(shù),對(duì)病毒全基因組進(jìn)行測(cè)序,利用生物信息分析手段,得到病毒的全基因組序列,解析編碼信息,并獲得相應(yīng)的變異信息。Sanger測(cè)序準(zhǔn)確度高,讀長很長。RNA病毒全序列測(cè)序突變分析多少錢
在探普生物進(jìn)行病毒基因組測(cè)序的流程是怎么樣的?在探普生物進(jìn)行病毒基因組測(cè)序非常簡單,簡而言之,客戶只需要說清楚樣品情況,準(zhǔn)備樣品即可,其他事宜都由探普來進(jìn)行安排。大致流程如下:1)與銷售人員溝通項(xiàng)目需求和樣本情況;2)探普生物工作人員擬定項(xiàng)目合同,雙方協(xié)商合同內(nèi)容后簽字蓋章;3)按樣本準(zhǔn)備指南準(zhǔn)備好樣本,填寫信息單后通知銷售人員預(yù)訂干冰,安排樣本寄運(yùn)輸;4)客戶支付項(xiàng)目啟動(dòng)款,探普生物啟動(dòng)項(xiàng)目實(shí)驗(yàn)和分析并提供測(cè)序報(bào)告;5)客戶支付項(xiàng)目尾款,探普生物提交測(cè)序數(shù)據(jù)和分析結(jié)果;6)售后問題處理,項(xiàng)目結(jié)題。北京二代測(cè)序分析多少錢病毒株往往都需要獲得盡量完整的基因組序列來指導(dǎo)下一步的研究。
病毒全基因組測(cè)序定在探普生物長時(shí)間運(yùn)行過程中,我們接觸到的對(duì)病毒的全基因組進(jìn)行測(cè)序項(xiàng)目有比較豐富的應(yīng)用場(chǎng)景。先,從事基因進(jìn)化/疫苗/藥品/抗體研制方向的研究的研究者一定會(huì)用到測(cè)序。這種場(chǎng)景一般是用密集的sanger測(cè)序監(jiān)測(cè)某幾個(gè)關(guān)鍵基因,搭載一定頻率的全基因組測(cè)序。這樣的組合省時(shí)省力省經(jīng)費(fèi),同時(shí)能達(dá)到研究目的。此外,有的單位需要對(duì)傳染病的病原進(jìn)行流行病學(xué)監(jiān)測(cè)和研究,如疾控/疫控中心、醫(yī)院的傳染病科室以及一些高校和研究所的相應(yīng)課題組,可能需要對(duì)病毒的全基因組進(jìn)行測(cè)序以后,結(jié)合其他上下游的研究數(shù)據(jù),達(dá)到研究或者監(jiān)測(cè)疫病的目的。
未培養(yǎng)病毒基因組的信息標(biāo)準(zhǔn):①關(guān)于未培養(yǎng)病毒基因組標(biāo)準(zhǔn)的信息是在基因組標(biāo)準(zhǔn)框架內(nèi)制定的,包括病毒起源、基因組質(zhì)量、基因組注釋、分類信息、生物地理分布和宿主預(yù)測(cè);②UViGs有助于提高我們對(duì)病毒進(jìn)化歷史和病毒-宿主之間相互作用的理解;③病毒基因組組成和內(nèi)容、復(fù)制策略和宿主的異常多樣性意味著UViGs的完整性、質(zhì)量、分類學(xué)和生態(tài)學(xué)需要通過病毒特異性指標(biāo)來評(píng)估;④分析不同大小和不同樣品類型的UViGs對(duì)于探索病毒基因組序列空白是有價(jià)值的。測(cè)序的完成程度,決定著基因組的下游應(yīng)用。
哪些應(yīng)用場(chǎng)景需要對(duì)病毒的全基因組進(jìn)行測(cè)序?在探普生物長時(shí)間運(yùn)行過程中,我們接觸到的對(duì)病毒的全基因組進(jìn)行測(cè)序項(xiàng)目有比較豐富的應(yīng)用場(chǎng)景。先,從事基因進(jìn)化/疫苗/藥品/抗體研制方向的研究的研究者一定會(huì)用到測(cè)序。這種場(chǎng)景一般是用密集的sanger測(cè)序監(jiān)測(cè)某幾個(gè)關(guān)鍵基因,搭載一定頻率的全基因組測(cè)序。這樣的組合省時(shí)省力省經(jīng)費(fèi),同時(shí)能達(dá)到研究目的。此外,有的單位需要對(duì)傳染病的病原進(jìn)行流行病學(xué)監(jiān)測(cè)和研究,如疾控/疫控中心、醫(yī)院的傳染病科室以及一些高校和研究所的相應(yīng)課題組,可能需要對(duì)病毒的全基因組進(jìn)行測(cè)序以后,結(jié)合其他上下游的研究數(shù)據(jù),達(dá)到研究或者監(jiān)測(cè)疫病的目的。病毒全基因組測(cè)序具有的特點(diǎn):完善的售后服務(wù)。全基因組病毒分析價(jià)格
對(duì)病毒全基因組進(jìn)行測(cè)序,是利用生物信息分析手段,得到病毒的全基因組序列。RNA病毒全序列測(cè)序突變分析多少錢
對(duì)病毒的全基因組進(jìn)行測(cè)序:對(duì)病毒的全基因組進(jìn)行測(cè)序主要是通過非特異性擴(kuò)增+克隆結(jié)合sanger測(cè)序來完成的。當(dāng)物種有了參考的序列之后,可以通過特異性擴(kuò)增+sanger測(cè)序獲得全基因組序列。Sanger測(cè)序準(zhǔn)確度高,讀長很長,但與此同時(shí),擴(kuò)增和克隆工作費(fèi)時(shí)費(fèi)力,由于流程繁瑣,加上快速變異導(dǎo)致引物無法通用,該方法對(duì)于大量基因組的測(cè)序工作而言,可操作性不強(qiáng),這對(duì)于研究者一直是一個(gè)困擾。高通量測(cè)序技術(shù)正式啟用之后,研究者可以將樣品處理至標(biāo)準(zhǔn)濃度和體積后進(jìn)行測(cè)序和分析,減少了工作量,增加了成功率。探普生物進(jìn)行了大量有針對(duì)性的研發(fā)和測(cè)試,開發(fā)了全套的實(shí)驗(yàn)和分析流程用于對(duì)病毒的全基因組進(jìn)行測(cè)序,該流程自運(yùn)行以來廣受研究者們好評(píng)。RNA病毒全序列測(cè)序突變分析多少錢
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