廣州微生物群體多樣性分析檢測

宏基因組測序?qū)Νh(huán)境樣本所有微生物基因組DNA進行提取和高通量測序，分析樣本環(huán)境中所有微生物基因組信息。宏基因組測序解讀微生物群體的多樣性與豐度信息，分析微生物群體基因組及功能，也探求微生物與環(huán)境、微生物與宿主之間的關(guān)系，發(fā)掘和研究新的功能基因。生物信息分析內(nèi)容1.測序質(zhì)量分析與統(tǒng)計、評估；2.數(shù)據(jù)庫比對；3.物種豐度分析；4.功能基因注釋；5.基因功能豐度差異分析；6.Pathway富集分析；7.豐度差異基因/物種聚類分析；8.PCA分析。DNA病毒基因組測序：獲得一種指定DNA病毒盡量完整的序列。廣州微生物群體多樣性分析檢測

病原體-宏基因組測序:1.開發(fā)了一種經(jīng)過驗證的臨床mNGS檢測方法，用于在許可的微生物實驗室中診斷腦脊髓液（CSF）引起的腦膜炎和腦炎的傳染原因。2.開發(fā)了定制的生物信息學管道SURPI+，以快速分析mNGS數(shù)據(jù)，生成檢測到的病原體的自動摘要，并提供用于評估和解釋結(jié)果的圖形用戶界面。3.mNGS提供了一種全方面的方法，通過該方法可以在一次測定中準確鑒定幾乎所有潛在病原體-病毒，細菌，寄生蟲。4.將mNGS測試遷移到臨床微生物學實驗室仍然面臨許多挑戰(zhàn)：1、缺乏用于mNGS臨床驗證的既定藍圖；2、難以將病原體從殖民者或污染物中區(qū)分開；3、缺乏專為臨床診斷使用的生物信息學軟件；4、注重質(zhì)量和全方面性的可獲得的參考數(shù)據(jù)庫；5、臨床實驗室改進修正案（CLIA）環(huán)境中，患者診斷測試固有的法規(guī)遵從性要求。廣州微生物群體多樣性分析檢測宏基因組測序克服了傳統(tǒng)的純培養(yǎng)方法的技術(shù)限制。

傳統(tǒng)微生物檢測由于時間長、陽性率低、檢測目標單一，限制了傳染疾病的診治。宏基因組測序技術(shù)不依賴于微生物的分離培養(yǎng)，克服了傳統(tǒng)的純培養(yǎng)方法的技術(shù)限制，為研究和開發(fā)利用占微生物種類99%以上的未可培養(yǎng)的微生物提供了一種新的途徑和良好的策略。宏基因組測序以無需純化培養(yǎng)、能夠快速全方面的展示序列信息的優(yōu)勢，逐步在臨床上得到了普遍應(yīng)用。病原宏基因組測序檢測出病原體并報告相應(yīng)被檢測出的序列數(shù)，再依據(jù)大數(shù)據(jù)庫判定是否為致病病原體。然而不同的測序平臺采用不同的數(shù)據(jù)庫，再由不同的研發(fā)、臨床和檢驗**解讀，缺乏統(tǒng)一標準，結(jié)果也會出現(xiàn)差異。因此仍需將病原宏基因組測序檢測數(shù)據(jù)和臨床更好的結(jié)合，從而更準確鑒定致病病原體。

病毒宏基因組：宏基因組學或元基因組（metagenomics），其定義為“Thecollectivegenomesofsoilmicroflora”。該學科可追溯到第1次提出環(huán)境基因組學的概念，在對太平洋浮游生物進行系統(tǒng)分類時構(gòu)建了第1個噬菌體文庫，并發(fā)現(xiàn)了15種全新的細菌序列。宏基因組學概念是“土壤中所有微生物基因組的總和”命名為土壤宏基因組，系統(tǒng)給出了宏基因組的概念，提出針對特定環(huán)境樣品中遺傳物質(zhì)總和進行非培養(yǎng)研究。對宏基因組進一步概括為“應(yīng)用現(xiàn)代的分子生物學技術(shù)直接從環(huán)境中獲取的目的微生物群落基因組，叫宏基因組”。一直以來，病毒基因組測序都是疾病診斷、流行病學調(diào)查和宿主-病原關(guān)系研究的重要手段。

宏基因組有廣義和狹義兩種概念。廣義的概念是指所有可能與人的生活密切相關(guān)的微生物的基因組，包括長期共生在體內(nèi)的微生物，也包括可以進入體內(nèi)，對人類的生活造成不同形式的影響的微生物。而狹義的宏基因組是指長期共生在體內(nèi)的微生物。宏基因組測序分析技術(shù)：單是共生在人體內(nèi)的微生物就有1000多種，特別是胃腸道內(nèi)的微生物為豐富。宏基因組除了這些微生物外，也包括以其他方式偶爾進入人體內(nèi)的微生物，這些微生物可能形成病源體，影響我們的健康?，F(xiàn)在科學家可以分析和發(fā)現(xiàn)引起疾病的異常微生物存在與活動，從而保護人體的健康。生化方法檢測病原微生物實際上是測定微生物特異性酶。浙江皮膚微生物多樣性測序分析技術(shù)

隨著醫(yī)學微生物學研究技術(shù)的不斷發(fā)展，病原學診斷已不再局限于病原體水平。廣州微生物群體多樣性分析檢測

上海探普生物科技有限公司對樣本進行宏病毒組測序有什么優(yōu)勢？全國開設(shè)病毒宏基因組測序的公司不超過3家，只有探普生物是專門為病毒研究者服務(wù)的，探普生物的研發(fā)團隊和實驗團隊都來自全國各地病毒學、微生物學專業(yè)的高校，碩士及以上學歷成員超過60%，團隊具備普通測序?qū)嶒灪头治龌A(chǔ)之外，同時具備病毒學及微生物學的學術(shù)背景，相當了解病毒相關(guān)樣本情況、研究方向等。研究者在項目咨詢的時候就可以明顯感覺到探普生物的專業(yè)性，溝通順暢，省時省力。廣州微生物群體多樣性分析檢測