傳統(tǒng)病原微生物檢測方法是生化方法。生化方法檢測病原微生物實際上是測定微生物特異性酶。由于各種微生物所具有的酶系統(tǒng)不完全相同,對許多物質(zhì)的分解能力亦不一致。因此可利用不同底物產(chǎn)生的不同代謝產(chǎn)物來間接檢測該微生物內(nèi)酶的有無,從而達到檢測特定微生物的目的。如沙門氏菌能產(chǎn)生辛酯酶,這一性能是除沙門氏菌外的各屬腸桿菌科細菌所不具備的。根據(jù)這一特性,甄宏太等報道了快速檢測沙門氏菌的辛酯酶法。大腸埃希氏菌具β2葡萄糖醛酸酶,但以O157:H7為腸出血性大腸埃希氏菌(EHEC)卻不具此酶,故β2葡萄糖醛酸酶陰性已成為初步篩查EHEC的重要特征。室內(nèi)舒適的溫度,濕度等環(huán)境條件以及相對密閉的室內(nèi)更為各種有害微生物滋生創(chuàng)造了條件。廣州隨機PCR病毒檢測診斷
微生物檢測的相關知識:在保藏厭氧菌種或研究微生物的動力時常采用此法。做穿刺接種時,用的接種工具是接種針。用的培養(yǎng)基一般是半固體培養(yǎng)基。它的做法是:用接種針蘸取少量的菌種,沿半固體培養(yǎng)基中心向管底作直線穿刺,如某細菌具有鞭毛而能運動,則在穿刺線周圍能夠生長。澆混接種:該法是將待接的微生物先放入培養(yǎng)皿中,然后再倒入冷卻至45℃左右的固體培養(yǎng)基,迅速輕輕搖勻,這樣菌液就達到稀釋的目的。待平板凝固之后,置合適溫度下培養(yǎng),就可長出單個的微生物菌落。廣州隨機PCR病毒檢測診斷室內(nèi)空氣是微生物污染的傳播途徑。
微生物鑒定可以采用不同微生物對周圍環(huán)境的資源的利用度有所不同的特性來區(qū)別。比如說微生物能否以二氧化碳作為微生物自身生長的碳源以及對糖類等物質(zhì)的需求程度來區(qū)分。亦或者說對不同類型生長因子的需求也是重點。其實我們還可以通過控制微生物的生長環(huán)境來判斷微生物的種屬類型。比如說該微生物生長需氧,以及適合在什么溫度進行生長繁殖,什么溫度微生物會轉(zhuǎn)入芽孢形態(tài)進行休眠,根據(jù)這些表現(xiàn)的不同,都可進行微生物的的鑒別。
未知病原微生物樣本需要經(jīng)歷:核酸純化-文庫構建-生物信息學分析這三大基本流程才能完成鑒定。高通量測序技術之解決疑難鑒定問題并提高檢測的靈敏度,在病原微生物檢測與鑒定方面,對一些非典型癥狀的樣品,依靠先驗知識與傳統(tǒng)檢測方法無法有效對病原微生物進行檢測時,高通量測序技術通過對基因組進行全序列測序,可有效檢測出在某種材料中可能攜帶的之前未報道過的病原微生物,或鑒定出混合侵染樣品中的不同病原分離物,降低有害生物傳入的風險。相對傳統(tǒng)的生物學、血清學與分子生物學檢測技術,高通量測序技術具有更高的特異性和靈敏性,即使在樣品中病原微生物存在量較低的情況下依然能夠做出快速、準確的檢測,尤其適用于病原微生物侵染初期的樣品材料的檢測。微生物鑒定可以用微生物對噬菌體的敏感性作為指標來鑒定微生物的種屬。
傳統(tǒng)的血清學與分子生物學方法如ELISA與PCR,由于病原微生物的特異性差異,有時只能用于病原微生物特定種甚至特定種特定株系分離物的檢測;而電鏡與生物學接種鑒定方法又難以將病原微生物鑒定至物種水平。相比之下,高通量測序技術可以提供一條新的病原微生物鑒定途徑。病原微生物檢測的不可知性使得高通量測序成為研究這類病原微生物的有用工具。目前,該技術在人類與動植物病原微生物的鑒定中已經(jīng)有較多的應用。高通量測序在臨床virology領域的應用病毒作為一種古老的物種存在于自然界,幾乎能夠在任何物種寄生,與人類健康息息相關。雖然大部分病毒沒有出現(xiàn)明顯的臨床癥狀,少數(shù)病毒能夠引起人類多種疾病,表現(xiàn)出包括發(fā)熱、腹瀉,出血、出疹、呼吸道癥狀、神經(jīng)系統(tǒng)癥狀等。生存環(huán)境和狀態(tài)決定了對病毒的全基因組進行測序的下機數(shù)據(jù)一般都伴隨大量的宿主和其他微生物的數(shù)據(jù)。浙江新病原鑒定公司
微生物鑒定可以采用不同微生物對周圍環(huán)境的資源的利用度有所不同的特性來區(qū)別。廣州隨機PCR病毒檢測診斷
微生物檢測方法中比濁法是根據(jù)菌懸液的透光量間接地測定細菌的數(shù)量。細菌懸浮液的濃度在一定范圍內(nèi)與透光度成反比,與光密度成正比,所以,可用光電比色計測定菌液,用光密度(OD值)表示樣品菌液濃度。此法簡便快捷,但只能檢測含有大量細菌的懸浮液,得出相對的細菌數(shù)目,對顏色太深的樣品,不能用此法測定。測定細胞重量法此法分為濕重法和干重法。濕重法系單位體積培養(yǎng)物經(jīng)離心后將濕菌體進行稱重;干重法系單位體積培養(yǎng)物經(jīng)離心后,以清水洗凈放人干燥器加熱烘干,使之失去水分然后稱重。此法適于菌體濃度較高的樣品,是微生物檢測的一種常用方法。廣州隨機PCR病毒檢測診斷
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