國內(nèi)病毒全基因組測序突變分析檢測

來源: 發(fā)布時(shí)間:2022-04-09

探普生物對病毒的全基因組進(jìn)行測序的實(shí)驗(yàn)基于二代測序技術(shù)。樣本經(jīng)過核酸純化-文庫構(gòu)建-生物信息學(xué)分析這3大基本流程后轉(zhuǎn)換成了序列數(shù)據(jù)。先,在核酸純化環(huán)節(jié),探普提供專門針對性的核酸純化樣本指南,以提高目的物種的核酸純度和得率,與此同時(shí)探普生物也提供核酸純化服務(wù)。第二,文庫構(gòu)建環(huán)節(jié),樣本的核酸具備濃度低,總量少的特點(diǎn)。探普生物專門針對這一點(diǎn)開發(fā)了超微量核酸文庫構(gòu)建,可以將0.01ng/μl甚至更低濃度的核酸構(gòu)建成測序文庫。第三,生物信息學(xué)分析環(huán)節(jié)。生存環(huán)境和狀態(tài)決定了對病毒的全基因組進(jìn)行測序的下機(jī)數(shù)據(jù)一般都伴隨大量的宿主和其他微生物的數(shù)據(jù)。探普生物基于該特點(diǎn),優(yōu)化了自有數(shù)據(jù)庫,搭載了的生物信息學(xué)分析流程,可處理復(fù)雜背景下的目標(biāo)物種序列。病毒是由一種核酸分子與蛋白質(zhì)構(gòu)成或只由蛋白質(zhì)構(gòu)成。國內(nèi)病毒全基因組測序突變分析檢測

國內(nèi)病毒全基因組測序突變分析檢測,病毒全基因組測序

病毒基因組測序包括完成圖測序、掃描圖測序和重測序三個(gè)層面,通過二代/三代測序平臺(tái),獲得病毒的基因組的序列信息,并在結(jié)構(gòu)基因組學(xué)、比較基因組學(xué)層面通過差異分析、同源基因分析、共線性分析、物種進(jìn)化分析等手段探究病毒的毒力系統(tǒng)、基因組的進(jìn)化與演變歷程等。對疑似傳染標(biāo)本采集提取后直接進(jìn)行高通量測序,通過病原微生物數(shù)據(jù)庫比對和智能化算法分析,獲得疑似致病微生物種屬信息,并提供全方面深入的報(bào)告,為疑難危重傳染提供快速準(zhǔn)確診斷依據(jù),促進(jìn)藥物的合理應(yīng)用。江蘇全基因組病毒測序技術(shù)病毒基因組測序包括完成圖測序、掃描圖測序和重測序幾個(gè)層面。

國內(nèi)病毒全基因組測序突變分析檢測,病毒全基因組測序

病毒全基因組測序具有的特點(diǎn):1.不預(yù)設(shè)目標(biāo)檢出物,樣本的所有病原信息一網(wǎng)打盡;2.無需培養(yǎng)和特異性擴(kuò)增,對采集臨床樣本直接檢測;3.獨(dú)有的一定定量技術(shù),實(shí)現(xiàn)病原定量分析,使病原診斷更準(zhǔn)確;4.與臨床各領(lǐng)域有名**共同打造呼吸道系統(tǒng)、神經(jīng)內(nèi)科系統(tǒng)和血流系統(tǒng)傳染病原數(shù)據(jù)庫,更加貼合需求;5.采用高通量測序儀,全流程質(zhì)控,結(jié)果穩(wěn)定可靠;6.整體檢出率陽性率較傳統(tǒng)方法提升25~30%:肺泡灌洗液檢出率60~80%,腦脊液檢出率40~60%,血液檢出率40~60%;7.專業(yè)化服務(wù):臨床微生物**出具報(bào)告,專業(yè)醫(yī)學(xué)團(tuán)隊(duì)報(bào)告解讀。針對疑難報(bào)告,由**進(jìn)行深度解析;8.完善的售后服務(wù):基于PCR技術(shù)和抗原抗體技術(shù)的售后驗(yàn)證平臺(tái),致力于解決臨床的每一個(gè)疑問。

未培養(yǎng)病毒基因組的信息標(biāo)準(zhǔn):①關(guān)于未培養(yǎng)病毒基因組標(biāo)準(zhǔn)的信息是在基因組標(biāo)準(zhǔn)框架內(nèi)制定的,包括病毒起源、基因組質(zhì)量、基因組注釋、分類信息、生物地理分布和宿主預(yù)測;②UViGs有助于提高我們對病毒進(jìn)化歷史和病毒-宿主之間相互作用的理解;③病毒基因組組成和內(nèi)容、復(fù)制策略和宿主的異常多樣性意味著UViGs的完整性、質(zhì)量、分類學(xué)和生態(tài)學(xué)需要通過病毒特異性指標(biāo)來評估;④分析不同大小和不同樣品類型的UViGs對于探索病毒基因組序列空白是有價(jià)值的。高通量測序能否定向檢測細(xì)菌病毒等微生物?

國內(nèi)病毒全基因組測序突變分析檢測,病毒全基因組測序

哪些應(yīng)用場景需要對病毒的全基因組進(jìn)行測序?在探普生物長時(shí)間運(yùn)行過程中,我們接觸到的對病毒的全基因組進(jìn)行測序項(xiàng)目有比較豐富的應(yīng)用場景。先,從事基因進(jìn)化/疫苗/藥品/抗體研制方向的研究的研究者一定會(huì)用到測序。這種場景一般是用密集的sanger測序監(jiān)測某幾個(gè)關(guān)鍵基因,搭載一定頻率的全基因組測序。這樣的組合省時(shí)省力省經(jīng)費(fèi),同時(shí)能達(dá)到研究目的。此外,有的單位需要對傳染病的病原進(jìn)行流行病學(xué)監(jiān)測和研究,如疾控/疫控中心、醫(yī)院的傳染病科室以及一些高校和研究所的相應(yīng)課題組,可能需要對病毒的全基因組進(jìn)行測序以后,結(jié)合其他上下游的研究數(shù)據(jù),達(dá)到研究或者監(jiān)測疫病的目的。病毒全基因組測序產(chǎn)品特點(diǎn):病原診斷更準(zhǔn)確。深圳病毒基因測序分析診斷

全基因組測序注意事項(xiàng):要找正規(guī)的機(jī)構(gòu)。國內(nèi)病毒全基因組測序突變分析檢測

需要對病毒的全基因組進(jìn)行測序的應(yīng)用場景:在探普生物長時(shí)間運(yùn)行過程中,我們接觸到的對病毒的全基因組進(jìn)行測序項(xiàng)目有比較豐富的應(yīng)用場景。先,從事基因進(jìn)化/疫苗/藥品/抗體研制方向的研究的研究者一定會(huì)用到測序。這種場景一般是用密集的sanger測序監(jiān)測某幾個(gè)關(guān)鍵基因,搭載一定頻率的全基因組測序。這樣的組合省時(shí)省力省經(jīng)費(fèi),同時(shí)能達(dá)到研究目的。此外,有的單位需要對傳染病的病原進(jìn)行流行病學(xué)監(jiān)測和研究,如疾控/疫控中心、醫(yī)院的傳染病科室以及一些高校和研究所的相應(yīng)課題組,可能需要對病毒的全基因組進(jìn)行測序以后,結(jié)合其他上下游的研究數(shù)據(jù),達(dá)到研究或者監(jiān)測疫病的目的。國內(nèi)病毒全基因組測序突變分析檢測

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