高通量測(cè)序技術(shù)具有的作用：高通量測(cè)序技術(shù)在冠狀病毒的鑒定中發(fā)揮了重要作用，先通過(guò)該技術(shù)確認(rèn)了該病原為以前未知的β冠狀病毒，其次確認(rèn)了該病毒與蝙蝠相關(guān)冠狀病毒ZC45和ZXC21密切相關(guān)，同源性約為88%，后高通量測(cè)序?yàn)楹罄m(xù)的診斷提供了強(qiáng)有力的技術(shù)支撐。高通量測(cè)序能否定向檢測(cè)細(xì)菌病毒等微生物？例如某人有皮膚病，提取組織，能否通過(guò)高通量測(cè)序來(lái)檢測(cè)后列出所有的致病菌?；蛘弋?dāng)懷疑的時(shí)候，在人體組織中檢測(cè)是否有某種特定的細(xì)菌或者病毒。（不求原理），就是想知道現(xiàn)在的測(cè)序技術(shù)能否替代傳統(tǒng)臨床檢驗(yàn)方法。相比傳統(tǒng)培養(yǎng)等方法，對(duì)樣本的全微生物檢測(cè)，或者特定微生物檢測(cè)，基因測(cè)序技術(shù)目前的時(shí)間消耗，準(zhǔn)確率，和金錢成本大概如何?？梢远ㄏ驒z測(cè)，用特異引物就可以。病毒全基因組測(cè)序是針對(duì)疑難報(bào)告，由**進(jìn)行深度解析。DNA二代測(cè)序分析上哪找
病毒基因組測(cè)序：病毒基因組測(cè)序包括完成圖測(cè)序、掃描圖測(cè)序和重測(cè)序三個(gè)層面，通過(guò)二代/三代測(cè)序平臺(tái)，獲得病毒的基因組的序列信息，并在結(jié)構(gòu)基因組學(xué)、比較基因組學(xué)層面通過(guò)差異分析、同源基因分析、共線性分析、物種進(jìn)化分析等手段探究病毒的毒力系統(tǒng)、基因組的進(jìn)化與演變歷程等。對(duì)疑似傳染標(biāo)本采集提取后直接進(jìn)行高通量測(cè)序，通過(guò)病原微生物專門用的數(shù)據(jù)庫(kù)比對(duì)和智能化算法分析，獲得疑似致病微生物種屬信息，并提供全方面深入的報(bào)告，為疑難危重傳染提供快速準(zhǔn)確診斷依據(jù)，促進(jìn)藥物的合理應(yīng)用。國(guó)內(nèi)病毒全基因組測(cè)序技術(shù)深度測(cè)序技術(shù)促進(jìn)了基因檢測(cè)的普及。
人類的病毒性傳染很普遍，病毒可以通過(guò)呼吸道、消化道、皮膚等多種途徑進(jìn)行傳播，常常會(huì)導(dǎo)致嚴(yán)重的公共健康問(wèn)題，對(duì)人類的健康造成威脅。傳統(tǒng)的病毒檢測(cè)方法主要依賴于細(xì)胞培養(yǎng)法、抗原抗體結(jié)合法等，這些方法耗時(shí)久，靈敏度低，往往不能夠滿足臨床檢測(cè)需求。隨著分子生物學(xué)的發(fā)展，PCR方法用于病毒檢測(cè)的案例越來(lái)越多，但該方法的特異性限制了其同時(shí)檢測(cè)其它病毒的能力。因此，需要通過(guò)新的技術(shù)來(lái)實(shí)現(xiàn)。隨著二代測(cè)序技術(shù)成本的降低與普及，二代測(cè)序在臨床病原體檢測(cè)方面的優(yōu)勢(shì)也越加突顯。該技術(shù)基于二代測(cè)序平臺(tái)，可以直接從樣本中獲得病原體的核酸序列信息，再通過(guò)生物信息學(xué)的方法對(duì)得到的序列進(jìn)行分析，可以快速地對(duì)樣本中可能存在的全部病原體進(jìn)行鑒定，縮短了臨床檢測(cè)的周期。
深度測(cè)序技術(shù)對(duì)科學(xué)研究范式相關(guān)影響：個(gè)性化醫(yī)學(xué)、P4醫(yī)學(xué)和準(zhǔn)確醫(yī)學(xué)等研究范式都是在近幾年深度測(cè)序技術(shù)迅猛發(fā)展的基礎(chǔ)上提出的。個(gè)人基因組測(cè)定的可行性，使得大眾有可能測(cè)定和分析自己的基因組、尋找到個(gè)人健康相關(guān)的基因風(fēng)險(xiǎn)因素，從而可以在生活習(xí)慣、飲食等方面提早進(jìn)行個(gè)性化預(yù)測(cè)和預(yù)防。由于互聯(lián)網(wǎng)的發(fā)展和即時(shí)檢驗(yàn)技術(shù)（point-of-care-testing，POCT）的應(yīng)用，人們可以通過(guò)網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行交流和參與到整個(gè)診療過(guò)程，這便是P4醫(yī)學(xué)的概念：預(yù)測(cè)性（predictive）、預(yù)防性（preventive）、個(gè)性化（personalized）及參與性（participatory）。DNA病毒基因組測(cè)序：一種指定DNA病毒盡量完整的序列。
能實(shí)現(xiàn)對(duì)病毒的全基因組進(jìn)行測(cè)序的技術(shù)手段：早期在高通量測(cè)序技術(shù)普及之前，對(duì)病毒的全基因組進(jìn)行測(cè)序是通過(guò)非特異性擴(kuò)增+克隆結(jié)合sanger測(cè)序來(lái)完成的。當(dāng)物種有了參考的序列之后，可以通過(guò)特異性擴(kuò)增+sanger測(cè)序獲得全基因組序列。Sanger測(cè)序準(zhǔn)確度高，讀長(zhǎng)很長(zhǎng)，但與此同時(shí)，擴(kuò)增和克隆工作費(fèi)時(shí)費(fèi)力，由于流程繁瑣，加上快速變異導(dǎo)致引物無(wú)法通用，該方法對(duì)于大量基因組的測(cè)序工作而言，可操作性不強(qiáng)，這對(duì)于研究者一直是一個(gè)困擾。高通量測(cè)序技術(shù)正式啟用之后，研究者可以將樣品處理至標(biāo)準(zhǔn)濃度和體積后進(jìn)行測(cè)序和分析，減少了工作量，增加了成功率。探普生物進(jìn)行了大量有針對(duì)性的研發(fā)和測(cè)試，開發(fā)了全套的實(shí)驗(yàn)和分析流程用于對(duì)病毒的全基因組進(jìn)行測(cè)序，該流程自運(yùn)行以來(lái)廣受研究者們好評(píng)。測(cè)序覆蓋度是反映測(cè)序隨機(jī)性的指標(biāo)之一。國(guó)內(nèi)病毒全基因組測(cè)序突變分析原理
在探普生物進(jìn)行病毒基因組測(cè)序是比較簡(jiǎn)單的。DNA二代測(cè)序分析上哪找
病毒是由一種核酸分子（DNA或RNA）與蛋白質(zhì)（Protein）構(gòu)成或只由蛋白質(zhì)構(gòu)成（如朊病毒）。根據(jù)遺傳物質(zhì)的組成，可分為單鏈DNA病毒（ssDNA）、雙鏈DNA病毒（dsDNA）、單鏈RNA病毒（ssRNA）、雙鏈RNA病毒（dsRNA）和蛋白質(zhì)病毒（如朊病毒）。根據(jù)宿主類型的不同，可以分為噬菌體（細(xì)菌病毒）、植物病毒（煙花葉病毒）和動(dòng)物病毒（如禽流感病毒、天花病毒和HIV等）。病毒全基因組測(cè)序（VirusWholeGenomeSequencing，VWGS），是指基于第二代高通量測(cè)序技術(shù)，對(duì)病毒全基因組進(jìn)行測(cè)序，利用生物信息分析手段，得到病毒的全基因組序列，解析編碼信息，并獲得相應(yīng)的變異信息。DNA二代測(cè)序分析上哪找
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