廣州病毒多樣性分析診斷

病毒宏基因組測序：宏基因組測序?qū)Νh(huán)境樣本所有微生物基因組DNA進(jìn)行提取和高通量測序，分析樣本環(huán)境中所有微生物基因組信息。宏基因組測序解讀微生物群體的多樣性與豐度信息，分析微生物群體基因組及功能，也探求微生物與環(huán)境、微生物與宿主之間的關(guān)系，發(fā)掘和研究新的功能基因。生物信息分析內(nèi)容1.測序質(zhì)量分析與統(tǒng)計(jì)、評估；2.數(shù)據(jù)庫比對；3.物種豐度分析；4.功能基因注釋；5.基因功能豐度差異分析；6.Pathway富集分析；7.豐度差異基因/物種聚類分析；8.PCA分析。通過對樣本進(jìn)行宏病毒組測序，我們可以了解單個(gè)樣本里有什么病毒。廣州病毒多樣性分析診斷

病原宏基因組測序可與實(shí)時(shí)熒光定量PCR（RT-PCR）技術(shù)聯(lián)合使用，實(shí)現(xiàn)優(yōu)勢互補(bǔ)?！癛T-PCR由于其檢測速度快、操作流程簡單、成本較低的原因，更適用于大規(guī)模的篩查中，以便快速獲得是否為冠狀病毒核酸陽性的初步證據(jù)，而對于RT-PCR檢測陰性、但臨床表型高度疑似的患者，利用mNGS進(jìn)一步確認(rèn)可有效提高檢測結(jié)果的可靠性，并獲得是否有其他病原體傳染的信息?！睂τ赗T-PCR檢測陽性的樣本，也可以進(jìn)一步利用mNGS進(jìn)行病毒全序列的分析，從而幫助獲得病毒是否發(fā)生變異的信息，為疫苗、藥物研發(fā)等方面提供可靠證據(jù)。山東皮膚微生物多樣性測序分析方法宏基因組測序能夠快速全方面的展示序列信息的優(yōu)勢。

病毒宏基因組測序的流程：在探普生物進(jìn)行病毒宏基因組測序的流程非常簡單，簡而言之，客戶只需要說清楚樣品情況，準(zhǔn)備樣品即可，其他事宜都由探普來進(jìn)行安排。大致流程如下：1)與銷售人員溝通項(xiàng)目需求和樣本情況；2)探普生物工作人員擬定項(xiàng)目合同，雙方協(xié)商合同內(nèi)容后簽字蓋章；3)按樣本準(zhǔn)備指南準(zhǔn)備好樣本，填寫信息單后通知銷售人員預(yù)訂干冰，安排樣本寄運(yùn)輸；4)客戶支付項(xiàng)目啟動(dòng)款，探普生物啟動(dòng)項(xiàng)目實(shí)驗(yàn)和分析并提供測序報(bào)告；5)客戶支付項(xiàng)目尾款，探普生物提交測序數(shù)據(jù)和分析結(jié)果；6)售后問題處理，項(xiàng)目結(jié)題。

病毒宏基因組測序中人類想要征服新發(fā)人畜共患病，只有提前發(fā)掘潛在的新的致病的病原，并針對新病原進(jìn)行基因組分析、流行病學(xué)調(diào)查、疫苗和抗體的開發(fā)等方面的研究。病毒宏基因組學(xué)是在宏基因組學(xué)基礎(chǔ)上發(fā)展起來研究特定環(huán)境中病毒的新興技術(shù)，該技術(shù)結(jié)合深度測序技術(shù)（第二代、第三代測序技術(shù)）已經(jīng)在人類、動(dòng)物、特定環(huán)境中挖掘出大量的新病毒，該技術(shù)不依賴于病毒培養(yǎng)及病毒序列，在國內(nèi)外被普遍應(yīng)用于新發(fā)人畜共患病病原的挖掘與臨床診斷?？傊?，隨著病毒宏基因組學(xué)與各種新的分子生物學(xué)技術(shù)及深度測序技術(shù)的結(jié)合，該技術(shù)展現(xiàn)了區(qū)別于傳統(tǒng)病毒診斷技術(shù)的優(yōu)勢，而該技術(shù)對動(dòng)物病毒的挖掘及其他領(lǐng)域的應(yīng)用將更加普遍。病原微生物二代測序也稱宏基因組測序（mNGS）是目前臨床上針對病原常用的基因測序方法。

上海探普生物科技有限公司對樣本進(jìn)行宏病毒組測序以后的數(shù)據(jù)分析工作的進(jìn)行：寄生性質(zhì)的生物下機(jī)數(shù)據(jù)一般都伴隨大量的宿主和其他微生物的數(shù)據(jù)。探普生物基于該特點(diǎn)，優(yōu)化了自有數(shù)據(jù)庫，搭載了專門用的的生物信息學(xué)分析流程，可處理復(fù)雜背景下的目標(biāo)物種序列。生物信息學(xué)流程主要包括，1，基于數(shù)據(jù)庫，去除宿主數(shù)據(jù)和其他微生物數(shù)據(jù)，篩選出目的序列，然后進(jìn)行序列組裝，物種分類，豐度統(tǒng)計(jì)。樣本數(shù)量達(dá)到一定標(biāo)準(zhǔn)還可以進(jìn)行差異分析?，F(xiàn)有數(shù)據(jù)庫不夠完善，出于對數(shù)據(jù)真實(shí)性的尊重，探普生物一般不進(jìn)行功能相關(guān)的分析。預(yù)測性質(zhì)的分析可以根據(jù)具體項(xiàng)目評估數(shù)據(jù)庫質(zhì)量后進(jìn)行。在探普生物進(jìn)行病毒宏基因組測序，基于探普的專有流程，樣本要求低。宏病毒學(xué)測序分析價(jià)格

宏基因組測序以特定環(huán)境中的整個(gè)微生物群落作為研究的對象，不需對微生物進(jìn)行分離培養(yǎng)。廣州病毒多樣性分析診斷

病毒宏基因組測序注意事項(xiàng)：探普生物對樣本進(jìn)行宏病毒組測序?qū)嶒?yàn)基于二代測序技術(shù)。經(jīng)過核酸純化-文庫構(gòu)建-生物信息學(xué)分析這3大基本流程后，樣本轉(zhuǎn)換成了序列數(shù)據(jù)。先，在核酸純化環(huán)節(jié)，探普提供專門針對病毒的核酸純化樣本指南，以提高純度和得率，與此同時(shí)探普生物也提供核酸純化服務(wù)。第二，文庫構(gòu)建環(huán)節(jié)。樣本的核酸具備濃度低，總量少的特點(diǎn)。探普生物專門針對這一點(diǎn)開發(fā)了超微量核酸文庫構(gòu)建，可以將0.01ng/μl甚至更低濃度的核酸構(gòu)建成測序文庫。第三，生物信息學(xué)分析環(huán)節(jié)。寄生性質(zhì)的生物下機(jī)數(shù)據(jù)一般都伴隨大量的宿主和其他微生物的數(shù)據(jù)。探普生物基于該特點(diǎn)，優(yōu)化了自有數(shù)據(jù)庫，搭載了專門用的的生物信息學(xué)分析流程，可處理復(fù)雜背景下的目標(biāo)物種序列。廣州病毒多樣性分析診斷

上海探普生物科技有限公司是一家從事生物科技專業(yè)領(lǐng)域內(nèi)技術(shù)開發(fā)、技術(shù)轉(zhuǎn)讓、技術(shù)咨詢、技術(shù)服務(wù)，化工原料及產(chǎn)品（除危險(xiǎn)化學(xué)品、監(jiān)控化學(xué)品、煙花爆竹、易制毒化學(xué)品），實(shí)驗(yàn)室設(shè)備，計(jì)算機(jī)、軟件及輔助設(shè)備，電子產(chǎn)品銷售，計(jì)算機(jī)軟件開發(fā)及維護(hù)，計(jì)算機(jī)信息系統(tǒng)集成服務(wù)等。的公司，致力于發(fā)展為創(chuàng)新務(wù)實(shí)、誠實(shí)可信的企業(yè)。上海探普生物深耕行業(yè)多年，始終以客戶的需求為向?qū)?，為客戶提?**的病毒測序，病毒全基因組測序，病毒宏基因組測序，未知病原鑒定。上海探普生物不斷開拓創(chuàng)新，追求出色，以技術(shù)為先導(dǎo)，以產(chǎn)品為平臺(tái)，以應(yīng)用為重點(diǎn)，以服務(wù)為保證，不斷為客戶創(chuàng)造更高價(jià)值，提供更優(yōu)服務(wù)。上海探普生物創(chuàng)始人喻利，始終關(guān)注客戶，創(chuàng)新科技，竭誠為客戶提供良好的服務(wù)。