水體微生物分析服務(wù)

來源: 發(fā)布時間:2022-01-28

宏基因組測序相關(guān)知識:宏基因組測序是對人體樣本或特定環(huán)境樣品中的總核酸(DNA或RNA)進行高通量測序,通過比對數(shù)據(jù)庫,得到傳染病原體的信息,能夠檢測出新發(fā)和罕見病原體,特別是在未知病原檢測中發(fā)揮了難以替代的作用,當(dāng)然宏基因組檢測方法也面臨不少挑戰(zhàn),檢測結(jié)果的靈敏度受宿主及其他微生物背景核酸的影響。高通量測序技術(shù)能夠提供準(zhǔn)確而科學(xué)的基因測序分析結(jié)果,為病情防控提供有力技術(shù)保障??茖W(xué)家通過對病毒進行全基因組測序,可以了解病毒不同傳播階段的變異情況,推測病毒對人的傳染力的變化及傳播情況。宏基因組學(xué)是以功能基因篩選和/或測序分析為研究手段。水體微生物分析服務(wù)

水體微生物分析服務(wù),病毒宏基因組測序

病毒宏基因組測序:在運用宏基因組測序方法檢測的樣本量位居全球前列,樣本總數(shù)居國內(nèi)第二,其中腦脊液檢測量位列全球前二強。除了傳染病的應(yīng)用場景之外,利用mNGS還可以對菌群進行菌株鑒定分型、耐藥基因與毒力基因的檢測,適用于抗傳染院內(nèi)傳染管理的評估。在越來越多的證據(jù)表明微生物對人體免疫系統(tǒng)能夠產(chǎn)生影響,以及微生物菌群會參與到神經(jīng)退行性疾病、糖尿病等疾病的發(fā)生和發(fā)展當(dāng)中,微生物療法獲得了越來越多的關(guān)注,而mNGS未來也可以為人們深入分析人體菌群微生態(tài)、研究微生物療法提供一種可靠的技術(shù)手段。河北病毒宏基因組測序分析找哪家通過對樣本進行宏病毒組測序,我們可以了解單個樣本里百度的相對含量是多少,優(yōu)勢物種是什么。

水體微生物分析服務(wù),病毒宏基因組測序

病毒宏基因組學(xué)應(yīng)用:病毒宏基因組學(xué)已經(jīng)應(yīng)用到人類、動物和環(huán)境中,涉及到農(nóng)業(yè)、工業(yè)及畜牧業(yè)等各個領(lǐng)域,其應(yīng)用范圍已延伸到海洋、湖水、熱泉、下水道等無機環(huán)境,以及組織病料、血液、呼吸道、動物排泄物等有機環(huán)境。應(yīng)用病毒宏基因組學(xué)的方法研究佛羅里達綠海龜?shù)睦w維狀瘤組織中發(fā)現(xiàn)了單鏈DNA病毒(Seaturtletornovirus1,STTV1)。分析了來自馬里蘭淡水湖中的RNA病毒宏基因組,結(jié)果獲得淡水湖中30多個RNA病毒家族序列,其中包含小RNA病毒、小雙股病毒及正黏病毒等。

在傳統(tǒng)的診斷檢測中對病原體的診斷檢測是通過體外培養(yǎng)的方式進行,但是不同微生物的培養(yǎng)條件不一樣;不同的微生物的培養(yǎng)技術(shù)要求也不一樣;同時,體外培養(yǎng)受時間、空間和培養(yǎng)技術(shù)人員的限制。宏基因組分析技術(shù)是一種的病源體診斷檢測技術(shù),可以在不通過任何培養(yǎng)過程的條件下,通過基因序列的比對,發(fā)現(xiàn)和鑒別罕見病源體引起的疾病,從而針對性地使用藥物,使病源微生物傳染所形成的疾病的準(zhǔn)確、高效。元基因組(宏基因組)學(xué)研究不要求對每個微生物進行分離、純化和培養(yǎng),而是直接從樣品中提取基因組DNA后進行測序分析。通過元基因組測序,能夠揭示微生物群落多樣性、種群結(jié)構(gòu)、進化關(guān)系、功能活性及環(huán)境之間的相互協(xié)作關(guān)系,極大地擴展了微生物學(xué)的研究范圍。宏病毒組是病毒的宏基因組,該技術(shù)是隨著高通量測序技術(shù)的興起而發(fā)展起來的。

水體微生物分析服務(wù),病毒宏基因組測序

宏病毒組是病毒的宏基因組,該技術(shù)是隨著高通量測序技術(shù)的興起而發(fā)展起來的。該技術(shù)主要是使用大量微生物群體樣本的測序數(shù)據(jù)和生物信息學(xué)分析手段,以多種數(shù)據(jù)庫為基礎(chǔ),進行群體的種類和功能分析。因此,它主要的應(yīng)用場景在于微生物群體研究,如腸道微生物、皮膚微生物、口腔微生物、水體微生物、土壤微生物等。一直以來宏基因組技術(shù)都是在細菌領(lǐng)域使用,病毒的樣本收集困難、文庫構(gòu)建繁瑣、數(shù)據(jù)庫不完善,因此宏基因組技術(shù)未能獲得普遍應(yīng)用。上海探普生物科技有限公司立志專門解決病毒方向的基因組研究難題,開發(fā)了整套的樣本處理和生信分析流程,基于這套流程,研究者們想對樣本進行宏病毒組測序就很容易實現(xiàn)了。通過對樣本進行宏病毒組測序,我們可以了解單個樣本里有什么病毒。水體微生物分析服務(wù)

宏基因組技術(shù)都是在細菌領(lǐng)域使用的。水體微生物分析服務(wù)

優(yōu)化臨床制備病毒宏基因組測序所用樣本的方法:①介紹高通量病毒宏基因組測序的樣本制備步驟,對臨床樣本的總核酸進行隨機擴增;②檢測了從血漿樣本中富集/擴增DNA及RNA病毒的不同方法,一種包括過濾、核酸酶消化、在不同反應(yīng)中隨機擴增DNA及RNA的步驟是較好的;③隨后在包含了不同病毒科的樣本中驗證此方法,可高讀數(shù)地檢測到大多數(shù)病毒序列,且優(yōu)于現(xiàn)行的其它樣本制備方法;④該方法不只適用于血漿樣本,還可用于尿液、咽喉拭子等臨床樣本。水體微生物分析服務(wù)

上海探普生物科技有限公司總部位于放鶴路1088號6號樓307,是一家從事生物科技專業(yè)領(lǐng)域內(nèi)技術(shù)開發(fā)、技術(shù)轉(zhuǎn)讓、技術(shù)咨詢、技術(shù)服務(wù),化工原料及產(chǎn)品(除危險化學(xué)品、監(jiān)控化學(xué)品、煙花爆竹、易制毒化學(xué)品),實驗室設(shè)備,計算機、軟件及輔助設(shè)備,電子產(chǎn)品銷售,計算機軟件開發(fā)及維護,計算機信息系統(tǒng)集成服務(wù)等。的公司。公司自創(chuàng)立以來,投身于病毒測序,病毒全基因組測序,病毒宏基因組測序,未知病原鑒定,是醫(yī)藥健康的主力軍。上海探普生物不斷開拓創(chuàng)新,追求出色,以技術(shù)為先導(dǎo),以產(chǎn)品為平臺,以應(yīng)用為重點,以服務(wù)為保證,不斷為客戶創(chuàng)造更高價值,提供更優(yōu)服務(wù)。上海探普生物始終關(guān)注醫(yī)藥健康市場,以敏銳的市場洞察力,實現(xiàn)與客戶的成長共贏。