RIP-Seq/qPCR檢測(cè)驗(yàn)證
RIP-Seq是一種檢測(cè)細(xì)胞內(nèi)蛋白/RNA互作組的高通量技術(shù)。該技術(shù)通過聯(lián)合免疫共沉淀技術(shù)和RNA測(cè)序技術(shù)對(duì)目的蛋白在特定細(xì)胞/組織內(nèi)的互作蛋白/RNA,進(jìn)行系統(tǒng)的檢測(cè)和分析。該技術(shù)適用于目的蛋白在特定細(xì)胞/組織中的蛋白/RNA互作組數(shù)據(jù)檢測(cè),或用于不同遺傳背景/實(shí)驗(yàn)條件下的互作組差異研究。因此,該技術(shù)是研究細(xì)胞內(nèi)蛋白/RNA互作調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的常規(guī)前置技術(shù)。
RIP-qPCR是一種檢測(cè)細(xì)胞內(nèi)蛋白/RNA互作的靶向驗(yàn)證技術(shù)。該技術(shù)通過聯(lián)合免疫共沉淀技術(shù)和RT-qPCR檢測(cè)技術(shù),對(duì)目的蛋白在特定細(xì)胞/組織內(nèi)的蛋白/RNA互作關(guān)系進(jìn)行驗(yàn)證,明確蛋白/RNA的相互作用關(guān)系。該技術(shù)適用于目的蛋白在特定細(xì)胞/組織中的蛋白/RNA互作檢測(cè)驗(yàn)證,或用于不同遺傳背景/實(shí)驗(yàn)條件下的互作差異研究。因此,該技術(shù)是研究細(xì)胞內(nèi)蛋白/RNA互作調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的常規(guī)檢測(cè)技術(shù)。
RIP-Seq檢測(cè)和RIP-qPCR驗(yàn)證技術(shù)價(jià)值:
(1)蛋白與RNA相互作用數(shù)據(jù),是探究轉(zhuǎn)錄后調(diào)控機(jī)制研究的重要內(nèi)容,體現(xiàn)機(jī)制研究的深度,能明顯提升臨床基礎(chǔ)類研究文章的檔次。
(2)蛋白與RNA互作組檢測(cè),常用于RBP蛋白的結(jié)合譜研究,如m6A-RIP-Seq。但理論上蛋白和RNA生物大分子,均有結(jié)合調(diào)控的可能。因此可用于目的蛋白結(jié)合RNA調(diào)控方向的機(jī)制探究,可用于是經(jīng)典老基因的機(jī)制突破。
(3)蛋白與RNA互作,其結(jié)合RNA的區(qū)域,是進(jìn)一步研究互作機(jī)制和功能的關(guān)鍵內(nèi)容,能夠明顯提高機(jī)制研究的高度。