天津酶的高通量篩選

來源: 發(fā)布時間:2023-01-19

離子通道是目前藥物發(fā)現(xiàn)的重要靶點(diǎn)。例如在心血管疾病中,離子通道檢測可以應(yīng)用于原發(fā)性電障礙(長QT綜合癥、短QT綜合癥、Brugada綜合癥)等方面的藥物篩選。以NovelKCNQ2channelactivatorsdiscoveredusingfluorescence-basedandautomatedpatch-clamp-basedhigh-throughputscreeningtechniques一文為例,通過一種改進(jìn)的高通量篩選技術(shù),篩選新型KCNQ2通道劑。在這篇文獻(xiàn)中,作者團(tuán)隊(duì)以ZTZ240(KCNQ2通道劑)作為陽性對照,通過鉈通量測定法從80000種化合物篩選出了565個比ZTZ240更強(qiáng)活性的化合物。然后使用384孔自動化膜片鉗,進(jìn)一步篩選出了38個KCNQ2通道劑。,使用傳統(tǒng)的膜片鉗表征劑,得到ZG1732和ZG2083(EC50分別為1.04μM和1.37μM)。催化劑高通量篩選技術(shù)。天津酶的高通量篩選

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蛋白質(zhì)片段互補(bǔ)分析(PCA,也稱為雙分子熒光互補(bǔ))和雙雜交篩選允許檢測細(xì)胞中蛋白質(zhì)相互作用的形成/抑制。PCA將單個檢測蛋白(熒光素酶、GFP、GAL)分成兩部分,這些部分與感興趣的蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用融合;如果伴侶結(jié)合,檢測蛋白會重新形成并檢測到信號。高內(nèi)涵成像平臺(HCS)由于其能夠提供出色的單細(xì)胞分析功能和短的數(shù)據(jù)采集時間獲得大家的青睞。一般的實(shí)驗(yàn)流程為設(shè)計實(shí)驗(yàn)并使用自動分液儀將細(xì)胞接種到96、384或1536孔板中;然后加入化合物,由于細(xì)胞在孵育過程中會對化合物做出反應(yīng),隨后對細(xì)胞進(jìn)行染色,并通過HCS成像系統(tǒng)獲取圖像,通過軟件分析獲取的圖像以確定化合物的劑量反應(yīng)。云南高通量篩選技術(shù)高內(nèi)涵高通量篩選系統(tǒng)。

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我國進(jìn)行藥物高通量篩選的優(yōu)勢首先是化合物來源,且多為天然;其次是對化合物生物活性的篩選目的較明確,無目的合成的化合物較少;第三,我國傳統(tǒng)藥物為篩選研究提供了一個巨大的資源庫,可從中藥中提取分離篩選新的化合物。這些優(yōu)勢為藥物的高通量篩選打下了堅(jiān)實(shí)基礎(chǔ)。我國藥物高通量篩選初現(xiàn)規(guī)模:藥物高通量篩選工作在我國起步較晚,且不規(guī)范。近幾年,我國進(jìn)行了外引內(nèi)聯(lián)的整體化、規(guī)?;A(chǔ)建設(shè),已初見成效。1996年中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院引進(jìn)國內(nèi)臺Biomek2000型實(shí)驗(yàn)自動化工作站;1998年又引進(jìn)臺Topcount微量閃爍計數(shù)器,使放射配基實(shí)驗(yàn)、放射免疫實(shí)驗(yàn)等技術(shù)微量化、自動化。

正如之前提到,在高通量篩選中Assay的檢出方法有很多,用于衡量酶活性多的當(dāng)屬于熒光檢出法和吸光度檢出法。這兩種方法都能非常便捷的與高通量進(jìn)行匹配。但是這兩種檢出方法也有不適用的場景,比如吸光度檢出法,在終點(diǎn)法測定(endpointassay)時,如果化合物庫的吸收低于~410nm,實(shí)驗(yàn)的背景吸收會引入假陽性(false-positive)和假陰性(false-negative)結(jié)果。雖然假陽性結(jié)果可以通過動力學(xué)Assay或者驗(yàn)證Assay來解決,但是由于微量定量板有位于340~410nm的強(qiáng)吸收,所以仍舊會導(dǎo)致Z因子降低,直接結(jié)果就是較弱活性的苗頭化合物將很難被篩選出來。而對于熒光檢出法而言,自發(fā)熒光化合物庫或者具有光敏特性的化合物庫同樣會遇到假陽性和假陰性結(jié)果。在某種程度上,選擇合適的檢出方法可以減少甚至避免上述問題,比如使用更長波段的光源,對于熒光檢出來說,>500nm會是比較好的選擇。高通量篩選是什么平臺。

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熒光共振能量轉(zhuǎn)移(FRET)是指在兩個不同的熒光基團(tuán)中,如果一個熒光基團(tuán)(供體Donor)的發(fā)射光譜與另一個基團(tuán)(受體Acceptor)的吸收光譜有一定的重疊,當(dāng)這兩個熒光基團(tuán)間的距離合適時,就可觀察到熒光能量由供體向受體轉(zhuǎn)移的現(xiàn)象,即以前一種基團(tuán)的激發(fā)波長激發(fā)時,可觀察到后一個基團(tuán)發(fā)射的熒光。常見的供體-受體對之間的有效距離通常為2-6nm,適用于許多蛋白質(zhì)相互作用。染料通常是有機(jī)分子,如與蛋白質(zhì)偶聯(lián)的熒光素和羅丹明,或與感興趣的蛋白質(zhì)融合的熒光蛋白。高通量篩選菌種是什么。山西酶的高通量篩選

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高通量篩選時每天要對數(shù)以千萬的樣品進(jìn)行檢測,工作枯燥,步驟單一,操作人員容易疲勞、出錯。自動化操作系統(tǒng)由計算機(jī)及其操作軟件、自動化加樣設(shè)備、溫孵離心設(shè)備和堆棧4個部分組成。自動化操作系統(tǒng)代替人工操作顯然有諸多優(yōu)勢,它利用計算機(jī)通過操作軟件控制整個實(shí)驗(yàn)過程,編程過程簡潔明了。微量篩選系統(tǒng) 由于高通量篩選采用的是細(xì)胞、分子水平的篩選模型.樣品用量一般在微克級(μg),節(jié)省了樣品資源,奠定了“一藥多篩”的物質(zhì)基礎(chǔ),同時節(jié)省了實(shí)驗(yàn)材料,降低了單藥篩選成本。天津酶的高通量篩選

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