河南基因組學(xué)高通量篩選

來源: 發(fā)布時(shí)間:2022-11-11

熒光素和羅丹明等有機(jī)染料的壽命約為3-4ns,它們?cè)谶B接到分子量在0.5-10kDa范圍內(nèi)的生物分子時(shí)為敏感?;诩?xì)胞水平的篩選的關(guān)鍵特征之一是可以一次篩選多個(gè)靶標(biāo)?;诩?xì)胞的篩選常用于以下情況下:1)所需的分子靶標(biāo)未知,2)靶標(biāo)無法在生化測(cè)定中充分重組,3)所需的表型只存在于細(xì)胞環(huán)境中,例如從一種細(xì)胞類型分化到另一種細(xì)胞類型。基于細(xì)胞的檢測(cè)貫穿于藥物發(fā)現(xiàn)的所有階段:靶標(biāo)選擇和驗(yàn)證、初步篩選、先導(dǎo)化合物識(shí)別、先導(dǎo)化合物優(yōu)化以及安全和毒理學(xué)篩選。介紹一些細(xì)胞水平分析的方法:細(xì)胞活力、報(bào)告基因、第二信使和高內(nèi)涵成像等。高通量篩選技巧是什么。河南基因組學(xué)高通量篩選

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環(huán)特生物是一家以斑馬魚生物技術(shù)應(yīng)用為的國(guó)家高新生物科技企業(yè)。作為行業(yè)獨(dú)一家同時(shí)獲得國(guó)家CNAS認(rèn)可、CMA資質(zhì)認(rèn)定、AAALAC國(guó)際實(shí)驗(yàn)動(dòng)物認(rèn)證的斑馬魚科技公司,多項(xiàng)技術(shù)成果先后榮獲德國(guó)紐倫堡國(guó)際發(fā)明金獎(jiǎng)、英國(guó)國(guó)際發(fā)明展金獎(jiǎng)及杰出創(chuàng)新獎(jiǎng)和中國(guó)發(fā)明協(xié)會(huì)發(fā)明創(chuàng)業(yè)獎(jiǎng)項(xiàng)目獎(jiǎng)金獎(jiǎng)等多項(xiàng)發(fā)明類國(guó)內(nèi)外大獎(jiǎng)。環(huán)特高通量篩選技術(shù)支持化合物篩選、新藥篩選、中藥篩選、藥物有效成分篩選、活性成分篩選、動(dòng)物模型篩選藥物、藥物毒性篩選、菌株菌種高通量篩選和抑制劑篩選等各類需求。北京基因組學(xué)高通量篩選傳統(tǒng)高通量篩選設(shè)備。

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然而傳統(tǒng)的針對(duì)單一靶點(diǎn)的研究方法已經(jīng)難以適應(yīng)一些多基因疾病和病毒等相關(guān)藥物的研究。而基于細(xì)胞水平的高內(nèi)涵篩選(high content screening, HCS)技術(shù)實(shí)現(xiàn)了對(duì)化合物多靶點(diǎn)多參數(shù)的同時(shí)檢測(cè),從疾病相關(guān)基因調(diào)控通路和網(wǎng)絡(luò)水平上研究藥物的作用機(jī)制、代謝途徑和潛在毒性等,也使在細(xì)胞水平評(píng)價(jià)活性化合物的成成為可能。從篩選載體上看,HCS和HTS并沒有的區(qū)別,它的檢測(cè)體積并未因檢測(cè)指標(biāo)增加而增高,操作步驟同樣簡(jiǎn)單可行、可自動(dòng)化。故HCS在新藥研發(fā)中發(fā)揮越來越重要的作用。

時(shí)間分辨熒光共振能量轉(zhuǎn)移(TR-FRET)原理為具有長(zhǎng)壽命熒光(通常為100秒的毫秒至毫秒)的鑭系配合物用作FRET供體,熒光蛋白或有機(jī)熒光團(tuán)(例如,別藻藍(lán)素或Cy5)用作受體。普通熒光的半衰期為納秒級(jí),鑭系元素的半衰期為毫秒級(jí),有6個(gè)數(shù)量級(jí)的差別。所以在檢測(cè)時(shí),TR-FRET有一個(gè)時(shí)間延遲~100微秒,從而使反應(yīng)體系內(nèi)普通背景熒光信號(hào)消耗掉,因此TR-FRET的背景信號(hào)非常低,能夠反映樣品實(shí)際情況?;诩?xì)胞水平的篩選的關(guān)鍵特征之一是可以一次篩選多個(gè)靶標(biāo)。基于細(xì)胞的篩選常用于以下情況下:1)所需的分子靶標(biāo)未知,2)靶標(biāo)無法在生化測(cè)定中充分重組,3)所需的表型只存在于細(xì)胞環(huán)境中,例如從一種細(xì)胞類型分化到另一種細(xì)胞類型。基于細(xì)胞的檢測(cè)貫穿于藥物發(fā)現(xiàn)的所有階段:靶標(biāo)選擇和驗(yàn)證、初步篩選、先導(dǎo)化合物識(shí)別、先導(dǎo)化合物優(yōu)化以及安全和毒理學(xué)篩選。介紹一些細(xì)胞水平分析的方法:細(xì)胞活力、報(bào)告基因、第二信使和高內(nèi)涵成像等。高通量篩選研究現(xiàn)狀。

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微生物菌種的改造是現(xiàn)代微生物發(fā)酵行業(yè)中,提高其工業(yè)化生產(chǎn)性能,提高酶和菌的性能非常重要的一個(gè)環(huán)節(jié)。而快速高效的高通量篩選方法的建立又是菌株改造中非常重要的一個(gè)環(huán)節(jié)。傳統(tǒng)的微生物快速篩選方法,瓊脂平板法可分為表型活性篩選和表型生長(zhǎng)選擇。表型活性篩選利用菌落周圍產(chǎn)生的水解圈、顏色圈或熒光產(chǎn)物等進(jìn)行酶活或目標(biāo)產(chǎn)物篩選;表型生長(zhǎng)選擇根據(jù)細(xì)胞對(duì)或其他有害物質(zhì)的抗性或營(yíng)養(yǎng)缺陷型互補(bǔ),在選擇培養(yǎng)基中依據(jù)生長(zhǎng)情況進(jìn)行篩選。瓊脂平板篩選法基于透明圈、顏色圈的瓊脂平板活性篩選或基于營(yíng)養(yǎng)缺陷型或抗性的瓊脂平板生長(zhǎng)選擇可作為簡(jiǎn)單易行的初篩方法,用于排除大量無活性和極低活性的突變體。但并不是所有的改造目標(biāo)都能建立瓊脂平板篩選法。瓊脂平板篩選法,是一種簡(jiǎn)單直接的篩選方法,已用于多種水解酶(如脂肪酶、酯酶、蛋白酶)和氧化還原酶(如漆酶)等突變庫的初步篩選中。高通量篩選的主要目的是什么。河南基因組學(xué)高通量篩選

高通量篩選技術(shù)的優(yōu)點(diǎn)。河南基因組學(xué)高通量篩選

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