在報告基因檢測(也稱為信號通路檢測)中,報告蛋白的序列編碼是在相關(guān)通路的轉(zhuǎn)錄控制下引入的。通過熒光或光學(xué)讀數(shù)監(jiān)測報告基因的表達(dá),通過這些指標(biāo)來間接反應(yīng)啟動子的或抑制程度。觀察到的信號是整個通路的產(chǎn)物,篩選的化合物可以在該通路上的任何點相互作用。常見的報告基因是CAT(氯霉素乙酰轉(zhuǎn)移酶)、GAL(β-半乳糖苷酶)、LAC(β-內(nèi)酰胺酶)、LUC(熒光素酶)和GFP。我們通常使用的為LUC(熒光素酶),但也可以使用其他報告基因。藥物高通量篩選平臺。重慶高通量篩選相關(guān)的實驗
化合物庫的質(zhì)量包括三個方面:多樣性、有效濃度、化合物庫大小?;衔飵斓亩鄻有灾萍s著苗頭化合物的新穎性,而化合物的有效濃度則影響著活性化合物的檢出概率。因此化合物庫的多樣性越大,化合物的有效濃度越高意味著苗頭化合物檢出率更有保證。但是兩者之前需要有一個平衡,一個化合物庫里單一化合物簇(Cluster)維持在4~12個化合物的時候,多樣性和有效濃度都能得到保障。另外,對于化合物庫大小而言,理論情況下(基于多樣性、有效濃度以及靶點的成藥難度基本一致的隨機(jī)篩選而言),大的化合物庫有利于發(fā)現(xiàn)更多的苗頭化合物。但是基于此次有限的匯總數(shù)據(jù)來看(有4個化合物庫達(dá)到了百萬級(0.6M~1.8M)),定向化合物庫(FocusLibrary)(圖七中紅色圈部分)由于其自身的特點檢出率較好,而大的化合物庫并沒有帶來更高的苗頭化合物檢出率以及更高質(zhì)量的苗頭化合物福建高通量篩選報價高通量篩選技術(shù)的方法有哪些。
高通量篩選(Highthroughputscreening,HTS)技術(shù)包括機(jī)器人技術(shù)、液體處理器、數(shù)據(jù)處理、相當(dāng)多的軟件和敏感的檢測系統(tǒng)。它是一種藥物發(fā)現(xiàn)過程,可以使生化或細(xì)胞事件能夠重復(fù)和快速測試化合物數(shù)十萬次。HTS可根據(jù)待測樣品的種類大致分為細(xì)胞水平篩選和分子水平篩選兩類。細(xì)胞水平篩選是在細(xì)胞個體水平上完成的檢測,由于含有諸如信號傳導(dǎo)、物質(zhì)代謝等關(guān)于細(xì)胞生命活動的信息,因此可以省去體外篩選中的許多步驟。下面將圍繞細(xì)胞水平篩選介紹幾種常用的檢測方法:離子通道檢測、報告基因檢測和細(xì)胞增殖檢測。
高通量篩選的特色效用高通量篩選技術(shù)是將多種技術(shù)方法有機(jī)結(jié)合而形成的一種新技術(shù)體系,它以微板形式作為實驗工具載體,以自動化操作系統(tǒng)執(zhí)行實驗過程,以靈敏快速的檢測儀器采集實驗數(shù)據(jù),以計算機(jī)對數(shù)以千計的樣品數(shù)據(jù)進(jìn)行分析處理,從而得出科學(xué)準(zhǔn)確的實驗結(jié)果和特色效用。英國學(xué)者AlanD研究提示,一個實驗室采用傳統(tǒng)的方法,借助20余種藥物作用靶位,1年內(nèi)能篩選75000個樣品;1997年高通量篩選技術(shù)發(fā)展初期,采用100余種靶位,每年可篩選100萬個樣品;1999年高通量篩選技術(shù)進(jìn)一步完善后,每天的篩選量就高達(dá)10萬種化合物。高通量篩選菌種技術(shù)。
藥物研發(fā)與開發(fā)是一個復(fù)雜與漫長的過程,特別是小分子藥物的研發(fā),其難點和關(guān)鍵在于如何快速高效的找到先導(dǎo)化合物(LeadCompound)。采用高通量藥物篩選(High-throughputscreening,HTS)來發(fā)現(xiàn)新的先導(dǎo)化合物仍然是小分子藥物研發(fā)的優(yōu)先。傳統(tǒng)藥物篩選是一個耗時長且昂貴的過程,一般需要消耗大量的樣品和實驗動物,對技術(shù)人員的操作技能有較高要求,難以在短時間內(nèi)對一定數(shù)量的樣品開展有效和經(jīng)濟(jì)的篩選。隨著各類化合物樣品庫儲量的不斷增加以及組合化學(xué)技術(shù)的應(yīng)用,采用傳統(tǒng)手段篩選海量樣品不僅不可能而且極大地限制了新藥研究之進(jìn)程。高通量篩選的技術(shù)優(yōu)點。重慶高通量篩選相關(guān)的實驗
高通量篩選的前提是什么。重慶高通量篩選相關(guān)的實驗
一種廣泛應(yīng)用的HTS技術(shù)是熒光各向異性(FA)/熒光偏振光(FP)。FA和FP方法實際上通過測量了染料所經(jīng)歷的旋轉(zhuǎn)相關(guān)時間或翻滾時間的變化來表征分子量。在這些技術(shù)中,用偏振光激發(fā)熒光團(tuán),并用平行或垂直于入射光偏振的偏振器測量熒光發(fā)射。隨著時間的推移,染料標(biāo)記的分子下降,發(fā)射信號去極化。與大分子結(jié)合降低了熒光團(tuán)的遷移率,從而增加了極化或各向異性,并允許定量結(jié)合。根據(jù)所涉及的質(zhì)量,選擇染料的壽命以比較大化結(jié)合后的信號變化。熒光素和羅丹明等有機(jī)染料的壽命約為3-4ns,它們在連接到分子量在0.5-10kDa范圍內(nèi)的生物分子時為敏感。重慶高通量篩選相關(guān)的實驗