無錫微流控芯片數(shù)字PCR如何選型

來源: 發(fā)布時間:2021-12-21

dPCR的基本原理

       目前dPCR主要有兩種形式,芯片式和液滴式,但基本原理都是將大量稀釋后的核酸溶液分散至芯片的微反應器或微滴中,每個反應器的核酸模板數(shù)少于或者等于1個。這樣經(jīng)過PCR循環(huán)之后,有一個核酸分子模板的反應器就會給出熒光信號,沒有模板的反應器就沒有熒光信號。根據(jù)相對比例和反應器的體積,就可以推算出原始溶液的核酸濃度??梢允褂脦追N不同的方法來分配樣品,包括微孔板,毛細管,油乳劑和帶有核酸結(jié)合表面的小型化腔室陣列。樣品的分配使人們可以通過假設分子種群遵循泊松分布來估計不同分子的數(shù)量,根據(jù)泊松分布的原理,反應體系中目標分子的拷貝數(shù)可以通過公式A=-ln[(N-X)/N]*N計算,從而解決了多個目標分子存在于單個液滴中的可能性。 全封閉防污染設計,一鍵式自動化操作。無錫微流控芯片數(shù)字PCR如何選型

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相對于二代測序、基因芯片和定量PCR而言,數(shù)字PCR具備以下優(yōu)勢:

● 靈敏度可達到單個核酸分子:檢測限低至0.001%,主要系為數(shù)字PCR可以實現(xiàn)靶標DNA/RNA的生物濃縮;

● 無需標準曲線活參照基因進行對比來測定核算量,可對靶分子起始量進行***定量,直接獨處DNA分子的個數(shù);

● 適合環(huán)境復雜樣品的檢測:終點PCR檢測,不依賴Ct值,不依賴擴增效率,能克服PCR***劑的影響,避免樣品間的交叉***問題,適合各類復雜環(huán)境中的樣本進行***定量,如動血樣、糞便、尿液、痰液、水樣、土壤、植物等; 杭州JUE對定量數(shù)字PCR正規(guī)代理支持多重數(shù)字PCR,可選全中文分析軟件。

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二代測序輔助建庫

       目前靶向測序建庫方法包括擴增子方法,在均相溶液中,當擴增引物增加時,由于擴增引物之間的相互作用,從而影響擴增的效率;如果將其分散到大量微液滴中擴增,將可降低引物間相互作用,提高擴增效率。同時還可以實現(xiàn)對于少量模板的有效擴增,得到更多的有效測序數(shù)據(jù)。


CRISPR-Cas9基因編輯結(jié)果驗證

       CRISPR-Cas9技術的發(fā)明,是基因編輯技術的一大突破,但如何驗證實驗是否成功,仍需要高靈敏度的檢測方法,數(shù)字PCR技術可以滿足這一需求。Broad研究所張鋒團隊發(fā)明了以CRISPR為基礎的SHERLOCK技術可以對核酸進行高靈敏度的定性檢測,但精確定量評估時仍采取了數(shù)字PCR進行確認。

       要了解為什么傳統(tǒng) PCR 存在限制,務必要了解 PCR 反應過程中發(fā)生了什么。基本 PCR 運行可以分為三個階段:

指數(shù)期

       每個循環(huán)積聚的產(chǎn)物準確加倍(假定 ** 反應效率)。該反應具有高度特異性和精確度。出現(xiàn)指數(shù)式擴增,因為所有試劑均新鮮可用,反應的動力學推動反應有利于擴增子加倍。

線性期(高變異性)

       隨著反應繼續(xù),一些試劑因擴增而被消耗。反應開始減緩,并且每個循環(huán)的 PCR 產(chǎn)物不再加倍。

平臺期(終點:使用傳統(tǒng)方法進行凝膠檢測)

       反應停止,不再產(chǎn)生更多產(chǎn)物,并且如果放置時間夠長,PCR 產(chǎn)物將開始降解。因為每個樣品具有不同的反應動力學,所以每支試管或每個反應將在不同的時間點進入平臺期。在平臺期可以看到這些差異。在平臺期內(nèi),傳統(tǒng) PCR 進行測量,又稱為終點檢測。 檢測數(shù)量一次可達96個樣品。

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研究方向

甲基化含量鑒定

作為表觀遺傳學研究中重要的一個研究方向——甲基化程度分析,現(xiàn)階段有不同的方法或技術來進行研究:如傳統(tǒng)的亞硫酸氫鹽處理后的克隆測序統(tǒng)計法、抗體檢測法、定量PCR檢測法等。這些方法皆因方法學的問題而不能獲得精確的定量,而微滴式數(shù)字PCR系統(tǒng)通過對樣品的微滴化處理及目標因子的***拷貝數(shù)定量,為甲基化程度的精確定量檢測提供了一種全新的技術。


*****的伴隨診斷

常用體液來源(如血液,胸腹水,唾液及尿液等)的待檢標本中的DNA,有正常脫落體細胞和病變脫落細胞兩種來源,前者的量遠大于后者。通過微液滴處理能在每個微液滴中有效減少正常體細胞DNA的干擾,實現(xiàn)**標記物的有效檢測,如EGFR,ALK,ROS1,KRAS、BRAF等基因的突變檢測、乳腺*/胃*的HER2基因擴增檢測等,應用于**精細醫(yī)學的伴隨診斷。 您了解數(shù)字PCR儀的優(yōu)勢嗎?杭州JUE對定量數(shù)字PCR正規(guī)代理

超高靈敏度,適用于稀有序列及稀有突變的檢測。無錫微流控芯片數(shù)字PCR如何選型

       我國***擁有完全自主知識產(chǎn)權的微滴式數(shù)字PCR儀MiniDrop?研發(fā)成功并投入生產(chǎn)。MiniDrop?創(chuàng)新性采用高壓驅(qū)動的方法將樣本分割成50萬份,打破了國外廠商在微滴式數(shù)字PCR領域的壟斷。永諾生物依以微滴式數(shù)字PCR儀為**,打造了全自動液體處理工作站、核酸提取試劑盒等創(chuàng)新產(chǎn)品,致力于解決**、***領域的精細診斷這是國內(nèi)***微滴式數(shù)字PCR檢測系統(tǒng),能廣泛應用于醫(yī)療、農(nóng)業(yè)、環(huán)境等領域,未來,采用外周血、唾液、尿液、腦脊液等樣本進行低成本、高靈敏、快速的無創(chuàng)檢測成為可能。無錫微流控芯片數(shù)字PCR如何選型

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