云南細(xì)胞pcr原理

來源: 發(fā)布時(shí)間:2022-02-21

PCR實(shí)驗(yàn)技術(shù)中的兼并引物PCR(DegeneratePrimer)介紹:兼并引物是指代替編碼單個(gè)氨基酸所有不同堿基可能性的不同序列的混合物。兼并度越低,產(chǎn)物特異性越強(qiáng)。設(shè)計(jì)引物時(shí)應(yīng)盡量選擇兼并性小的氨基酸,并避免引物3’末端兼并,因?yàn)?'端末尾3個(gè)堿基的退火足以在錯(cuò)誤位點(diǎn)起始PCR;次黃嘌呤可以同所有的堿基配對,降低引物的退火溫度。因此,在引物設(shè)計(jì)時(shí),比較選擇兼并性小的氨基酸,并避免引物3'端被兼并,因?yàn)?'端末尾3個(gè)堿基的退火足以在錯(cuò)誤位點(diǎn)起始PCR;次黃嘌呤可以同所有的堿基配對,降低引物的退火溫度。實(shí)驗(yàn)證明,用脫氧肌苷引物進(jìn)行PCR,可以代替編碼蛋白的多種兼并密碼子中的兼并堿基。英瀚斯生物可承接臨床樣本、動物組織、細(xì)胞樣本各類pcr檢測。云南細(xì)胞pcr原理

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PCR樣本可分2種,DNA樣本和RNA樣本。一,DNA樣本:已經(jīng)提取好的DNA樣本,負(fù)80度保存,干冰運(yùn)輸;血液樣本,需全血,加入抗凝劑,抗凝管4度保存;組織樣本,需凍存管或干凈滅菌的離心管裝,負(fù)80度保存,干冰運(yùn)輸;細(xì)胞樣本,用胰酶消化后的細(xì)胞沉淀,負(fù)20度或負(fù)80度保存。二,RNA樣本:提取好的RNA樣本,負(fù)80度保存,干冰運(yùn)輸;血液樣本,全血,加入抗凝劑,4度冰箱保存;組織樣本,凍存管或干凈滅菌離心管,負(fù)80度保存,干冰運(yùn)輸;細(xì)胞樣本,用胰酶消化后的細(xì)胞沉淀,負(fù)20度或負(fù)80度保存。長時(shí)間保存,可加Trizol,其中血液用TrizolLS組織和細(xì)胞沉淀用Trizol。湖北樣本pcr外包如何挑選pcr檢測試劑盒?

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PCR設(shè)計(jì)引物應(yīng)遵循以下原則:①引物長度:15-30bp,常用為20bp左右。②引物擴(kuò)增跨度:以200-500bp為宜,特定條件下可擴(kuò)增長至10kb的片段。③引物堿基:G+C含量以40-60%為宜,G+C太少擴(kuò)增效果不佳,G+C過多易出現(xiàn)非特異條帶。ATGC比較好隨機(jī)分布,避免5個(gè)以上的嘌呤或嘧啶核苷酸的成串排列。④避免引物內(nèi)部出現(xiàn)二級結(jié)構(gòu),避免兩條引物間互補(bǔ),特別是3'端的互補(bǔ),否則會形成引物二聚體,產(chǎn)生非特異的擴(kuò)增條帶。⑤引物3'端的堿基,特別是較末及倒數(shù)第二個(gè)堿基,應(yīng)嚴(yán)格要求配對,以避免因末端堿基不配對而導(dǎo)致PCR失敗。⑥引物中有或能加上合適的酶切位點(diǎn),被擴(kuò)增的靶序列比較好有適宜的酶切位點(diǎn),這對酶切分析或分子克隆很有好處。⑦引物的特異性:引物應(yīng)與核酸序列數(shù)據(jù)庫的其它序列無明顯同源性。引物量:每條引物的濃度0.1~1umol或10~100pmol,以比較低引物量產(chǎn)生所需要的結(jié)果為好,引物濃度偏高會引起錯(cuò)配和非特異性擴(kuò)增,且可增加引物之間形成二聚體的機(jī)會。

PCR實(shí)驗(yàn)技術(shù)中的RT-PCR一步法和兩步法的優(yōu)缺點(diǎn)介紹:一步法:利用同一緩沖液,在同一體系中加入逆轉(zhuǎn)錄酶、引物、Taq酶、4種dNTP直接進(jìn)行mRNA反轉(zhuǎn)錄與PCR擴(kuò)增。發(fā)現(xiàn)Taq酶不僅具有DNA多聚酶的作用,而且具有反轉(zhuǎn)錄酶活性,可利用其雙重作用在同一體系中直接以mRNA為模板進(jìn)行反轉(zhuǎn)錄和其后PCR擴(kuò)增,從而使mRNA的PCR步驟更為簡化。所需樣品量減少到比較低限度,臨床小樣品的檢測非常有利。用一步法擴(kuò)增可檢測出總RNA中小于1ng的低豐度mRNA.該法可用于低豐度mRNA的cDNA文庫的構(gòu)建及特異cDNA的克隆,并有可能與Taq酶的測序技術(shù)相組合,使得自動反轉(zhuǎn)錄、基因擴(kuò)增與基因轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物的測序在單管中進(jìn)行。兩步法:由于單管反應(yīng)時(shí)RT和PCR都不能在比較好條件下進(jìn)行并且容易相互干擾,常只適宜用基因特異引物擴(kuò)增較短的基因,及定量PCR.兩步法則是將RT和PCR分別進(jìn)行,這樣使得兩個(gè)反應(yīng)充分發(fā)揮各自的特點(diǎn),更為靈活而且嚴(yán)謹(jǐn),適合那些GC含量、二級結(jié)構(gòu)嚴(yán)重的模板或者是未知模板,以及多個(gè)基因的RT-PCR。一步法熒光定量pcr在哪做?

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PCR實(shí)驗(yàn)技術(shù)中的Touch-downPCR介紹:Touch-downPCR又稱降落PCR.即選定一個(gè)溫度范圍,如50—35℃,每降1-2℃進(jìn)行1-2個(gè)循環(huán),然后在50度下進(jìn)行15個(gè)循環(huán)。Touch-down的原理隨著退火溫度的降低,特異性逐步降低,但特異性條帶在溫度較高時(shí)已經(jīng)擴(kuò)增出來,其濃度遠(yuǎn)遠(yuǎn)超過非特異性條帶,隨著退火溫度的降低,特異性條帶優(yōu)先被擴(kuò)增。選擇初始復(fù)性溫度的原則起始復(fù)性溫度應(yīng)該比引物的Tm值高出5-10度,然后每個(gè)循環(huán)遞減1-2度Touch-downPCR的應(yīng)用范圍lowcopyoftargetedDNA;highdegreedegeneracy(orlessspecific)ofthefirstsetofprimers;做pcr,樣本該如何保存?黑龍江什么是pcr哪家好

簡述熒光定量pcr的基本原理。云南細(xì)胞pcr原理

PCR實(shí)驗(yàn)技術(shù)中的巢氏PCR(NestedPCR)介紹:巢氏PCR需要兩到三對引物,一般采用較為套引物擴(kuò)增15-30個(gè)循環(huán),再用擴(kuò)增DNA的片段內(nèi)設(shè)定的第二套引物擴(kuò)增15-30個(gè)循環(huán),這樣可使待擴(kuò)增序列得到高效擴(kuò)增,而次級結(jié)構(gòu)卻很少擴(kuò)增。套式引物PCR減少了引物非特異性退火,從而增加了特異性擴(kuò)增,提高了擴(kuò)增效率。若將套失PCR的內(nèi)外引物稍加改變,延長外引物長度(25-30bp),同時(shí)縮短內(nèi)引物長度(15-17bp),使外引物先在高退火溫度下復(fù)性,做雙溫?cái)U(kuò)增,然后改換至三溫循環(huán),使內(nèi)引物在外引物擴(kuò)增的基礎(chǔ)上,在低退火溫度復(fù)性,直到擴(kuò)增完成,這樣就可以使兩套引物一次同時(shí)加入。云南細(xì)胞pcr原理

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