循環(huán)水養(yǎng)殖系統(tǒng)難點(diǎn)是解決氮循環(huán)的問題，要消除氨氮和亞硝/酸氮的影響。傳統(tǒng)的解決方案是在循環(huán)水養(yǎng)殖系統(tǒng)中加入了反硝化反應(yīng)池，但由于反硝化作用需要在嚴(yán)格厭氧條件下進(jìn)行，因此硝化作用反應(yīng)池需要跟反硝化作用反應(yīng)池分開，這就增加了循環(huán)水養(yǎng)殖系統(tǒng)的成本。前循環(huán)水養(yǎng)殖設(shè)備已實(shí)現(xiàn)工廠化生產(chǎn)，實(shí)現(xiàn)養(yǎng)殖池與養(yǎng)殖凈化設(shè)備的無(wú)縫連接。通過一系列的物理過濾、化學(xué)沉淀以及通過微生物的作用去除氨氮、硝氮和亞硝氮再通過殺菌消毒、充氧等操作，水體重新流回到循環(huán)水養(yǎng)殖系統(tǒng)中，實(shí)現(xiàn)養(yǎng)殖水的循環(huán)利用。
工廠化循環(huán)水養(yǎng)殖的實(shí)質(zhì)是養(yǎng)殖生產(chǎn)的工業(yè)化，生產(chǎn)過程可控，可以跨季節(jié)養(yǎng)殖，產(chǎn)品像工業(yè)品一樣可以有計(jì)劃地均衡上市。其特點(diǎn)：一是用水量少，可利用較低質(zhì)水源，對(duì)水資源要求較低；二是占地少，對(duì)土地資源的要求低；三是養(yǎng)殖密度高，單位耗水產(chǎn)量大；四是易于控制生長(zhǎng)環(huán)境，魚類(以及其他養(yǎng)殖種類)生長(zhǎng)速度快，生長(zhǎng)周期短；五是飼料利用率高；六是水循環(huán)使用，利用系數(shù)高；七是排放的廢水廢物少，能集中處理，對(duì)環(huán)境無(wú)壓力或很??；八是不受外界氣候的影響，可實(shí)現(xiàn)常年生產(chǎn)。
養(yǎng)殖三分靠技術(shù)，七分靠管理，技術(shù)手段代替不了管理，只能使管理更加的量化和程序化，降低了人為的不利因素，但同樣也對(duì)管理提出了新的要求。因此與其說是在談投資新的技術(shù)手段，不如說投資的是新的生產(chǎn)和管理理念。所以不要糾結(jié)在養(yǎng)殖系統(tǒng)上面，而要更關(guān)注管理。循環(huán)水養(yǎng)殖失敗的案例也有很多。魚的成活率太低或者全軍覆沒，只有不到10%是系統(tǒng)本身的原因，其余90%以上全都是管理不當(dāng)和操作失誤造成的，歸根到底還是人的問題。