但目前來看，工廠化循環(huán)水養(yǎng)殖技術(shù)和系統(tǒng)的推廣還存在以下問題：是基礎(chǔ)建設(shè)成本高，投入大?，F(xiàn)在采用循環(huán)水養(yǎng)殖系統(tǒng)的企業(yè)大多數(shù)為具有一定規(guī)模，技術(shù)力量和實(shí)力較為雄厚的養(yǎng)殖企業(yè)，而對(duì)大部分小本經(jīng)營(yíng)的養(yǎng)殖戶（單位）來說是可望而不可即，這也使循環(huán)水養(yǎng)殖系統(tǒng)和技術(shù)的大范圍推廣受到了制約。部分工廠化循環(huán)水養(yǎng)殖系統(tǒng)由于設(shè)計(jì)存在問題或其他一些人為原因，運(yùn)行不充分或運(yùn)行效率較低，影響了工廠化循環(huán)水養(yǎng)殖的總體水平，節(jié)水節(jié)能技術(shù)路線有待進(jìn)一步探討、完善。
我們應(yīng)該用目標(biāo)產(chǎn)量和預(yù)算來衡量需要做多大面積的工廠化循環(huán)水養(yǎng)殖系統(tǒng)，而不是簡(jiǎn)單的用面積來做對(duì)比。 工廠化循環(huán)水養(yǎng)殖系統(tǒng)前期投入相對(duì)較高，如果簡(jiǎn)單套用原來池塘養(yǎng)殖的經(jīng)驗(yàn)和面積，總投資額會(huì)是一個(gè)很龐大的數(shù)字，普通養(yǎng)殖戶難以接受，也無形中放大了工廠化循環(huán)水養(yǎng)殖的高投入印象，不利于養(yǎng)殖戶對(duì)工廠化養(yǎng)殖產(chǎn)生合理的理解。 在從傳統(tǒng)池塘養(yǎng)殖轉(zhuǎn)換到工廠化循環(huán)水養(yǎng)殖的過程中，我們可以用一個(gè)簡(jiǎn)單的比例來進(jìn)行換算，同樣的產(chǎn)量，工廠化循環(huán)水養(yǎng)殖僅需池塘養(yǎng)殖面積的10%。有了這個(gè)比例，就能更科學(xué)的規(guī)劃養(yǎng)殖面積和預(yù)算。
目前我國(guó)的循環(huán)水養(yǎng)殖系統(tǒng)技術(shù)的系統(tǒng)設(shè)施和養(yǎng)殖生產(chǎn)處于相脫節(jié)的狀況，也就是說只有少數(shù)人真正掌握循環(huán)水養(yǎng)殖設(shè)施正常管理技術(shù)，大多數(shù)已建的循環(huán)水養(yǎng)殖設(shè)施很大一部分不能正常運(yùn)轉(zhuǎn)。究其原因，一是循環(huán)水養(yǎng)殖管理要求復(fù)雜，技術(shù)上有缺陷，不易實(shí)現(xiàn)平穩(wěn)運(yùn)行；二是一般養(yǎng)殖場(chǎng)的人員素質(zhì)和結(jié)構(gòu)不能滿足循環(huán)水養(yǎng)殖的要求。因此，今后養(yǎng)殖設(shè)施的開發(fā)應(yīng)更加注重從整體上整合養(yǎng)殖設(shè)施和養(yǎng)殖技術(shù)，做到“軟硬件”真正的統(tǒng)一，并不斷提高設(shè)施的信息化和智能化水平，降低管理維護(hù)難度。