高密的養(yǎng)殖下，一旦系統(tǒng)崩潰、疾病爆發(fā)或循環(huán)水養(yǎng)殖系統(tǒng)運行的穩(wěn)定性和系統(tǒng)總水量的平衡、生物濾池的維護、過濾設施的定期清理、合理的投喂策略、適宜的養(yǎng)殖密度以及水質(zhì)的檢測和疾病的預防都是分不開的。因此，循環(huán)水系統(tǒng)的科學有效運行是多學科知識的綜合體現(xiàn)。研究調(diào)查發(fā)現(xiàn)，很多企業(yè)對循環(huán)水養(yǎng)殖的原理、水處理設施設備的作用、運行參數(shù)等知之甚少，直接影響到系統(tǒng)的運行管理。較高的進入門檻也進一步加大了循環(huán)水養(yǎng)殖模式的推廣難度。
未來社會工業(yè)化的發(fā)展趨勢以及世界先進養(yǎng)殖模式的發(fā)展水平預示，工廠化循環(huán)水養(yǎng)殖系統(tǒng)將是未來水產(chǎn)養(yǎng)殖的重要模式。因此，工廠化循環(huán)水養(yǎng)殖是我國水產(chǎn)養(yǎng)殖的重要發(fā)展方向。國際上沒有工廠化養(yǎng)殖這一提法，與工廠化循環(huán)水養(yǎng)殖系統(tǒng)相對應的是循環(huán)水養(yǎng)殖系統(tǒng)（RAS），其主要特征是水體循環(huán)利用，日均水利用率在95%以上，如低于此指標，即為流水養(yǎng)殖。工廠化循環(huán)水養(yǎng)殖與傳統(tǒng)養(yǎng)殖方式相比，具有節(jié)水、節(jié)地、高密度集約化和排放可控的特點，符合可持續(xù)發(fā)展要求，是未來水產(chǎn)養(yǎng)殖方式轉(zhuǎn)變的必然趨勢。
很多人會問自來水可以進行水產(chǎn)養(yǎng)殖嗎，答案是否定的。讓我們來先了解一下魚的免疫系統(tǒng)，魚身體的表皮層內(nèi)長有一種杯狀細胞，不斷地在分泌著粘液，使魚體減少游在水中的摩擦，同時，粘液又能保護魚體不受寄生物、霉菌、細菌和其他微小生物的侵蝕，并使皮膚具有一種正常的滲透能力。為什么說自來水不適合水產(chǎn)養(yǎng)殖呢，因為自來水中主要含有"氯"的成份。自來水中的氯卻是一種強氧化劑，在水中生成很不穩(wěn)定的強氧化劑---次氯酸。