循環(huán)水養(yǎng)殖系統(tǒng)難點是解決氮循環(huán)的問題，要消除氨氮和亞硝(xiao)酸氮的影響。環(huán)控公司的解決方案是在循環(huán)水養(yǎng)殖系統(tǒng)中加入了反硝化反應池，但由于反硝化作用需要在嚴格厭氧條件下進行，因此硝化作用反應池需要跟反硝化作用反應池分開。目前循環(huán)水養(yǎng)殖設備已實現(xiàn)工廠化生產(chǎn)，做到了養(yǎng)殖池與養(yǎng)殖凈化設備的無縫連接。通過一系列的物理過濾、化學沉淀以及通過微生物的作用去除氨氮、硝氮和亞硝氮再通過殺菌消毒、充氧等操作，水體重新流回到循環(huán)水養(yǎng)殖系統(tǒng)中，實現(xiàn)養(yǎng)殖水的循環(huán)利用。
20世紀90年代，在淡水養(yǎng)殖方面，隨著經(jīng)濟的快速發(fā)展，全國各地興建了很多水產(chǎn)養(yǎng)殖示范區(qū)，建立了一批淡水魚類工廠化循環(huán)水養(yǎng)殖系統(tǒng)，但是其經(jīng)濟性矛盾依然突出。而工廠化循環(huán)水苗種繁殖生產(chǎn)系統(tǒng)具有水環(huán)境可控、苗種質(zhì)量高等優(yōu)點，適應了苗種生產(chǎn)的反季節(jié)性、水質(zhì)條件要求高的特點，并且苗種的單位產(chǎn)值高，使之得到了一定程度的應用。以大菱鲆工廠化流水養(yǎng)殖為代表的海水工廠化養(yǎng)殖的大力推廣，隨之而來的是優(yōu)質(zhì)水資源大量耗用，尤其是地下水資源，造成地下水位下降、地陷等諸多問題。“九五”以來，國家有關科研計劃大力支持海水工廠化循環(huán)水養(yǎng)殖的研究，并取得了重要的階段性成果。
對于“白便”疾病很多專家也都對其進行研究，據(jù)研究報道指出：白便的診斷特點是蝦肝胰腺中內(nèi)側脫落許多小管上皮細胞，目前把他作為來源于蝦胃的致病菌的一個未知結果毒素。發(fā)現(xiàn)對蝦產(chǎn)生的的白色糞便和肝胰腺中有大量蠕蟲狀體（ATM），是肝胰腺微絨毛脫落，原始細胞裂解，形成蠕蟲狀體，像簇蟲而并非簇蟲。白便通過肉眼不難看出，并非消化不好的糞便，而發(fā)病蝦很多表現(xiàn)為空腸空胃，不難判斷這個白色物質(zhì)主要是肝胰臟所產(chǎn)生的分泌物。