生化模式凈水主要是靠硝化細(xì)菌，硝化細(xì)菌從無到有這個(gè)過程俗稱掛膜。硝化細(xì)菌掛膜需要濾材（細(xì)菌屋）；硝化細(xì)菌屬于好氧細(xì)菌，因此需要氧氣；硝化細(xì)菌繁殖還需要養(yǎng)分，也就是魚糞。再滿足上訴三個(gè)情況下，保持25度水溫，硝化細(xì)菌從無到有需要將近35天，15度水溫情況下需要50天或者更久，這個(gè)過程叫冷啟動(dòng)。想快速啟動(dòng)，可以使用液體硝化細(xì)菌，或者添加一些其他已經(jīng)掛膜的濾材進(jìn)來進(jìn)行引菌，這個(gè)過程叫熱啟動(dòng)。海水系統(tǒng)應(yīng)為高鹽度的問題，自然掛膜時(shí)間比淡水系統(tǒng)要長(zhǎng)一倍以上，時(shí)間也隨鹽度升高而延長(zhǎng)。
循環(huán)水系統(tǒng)處理的對(duì)象一般是含有大量固體懸浮物或溶解性的物質(zhì)，這些物質(zhì)排入到養(yǎng)殖水中后會(huì)在細(xì)菌的作用下，分解成氨、硫化氫等對(duì)水生動(dòng)物有毒的物質(zhì)。因此，一時(shí)間將這些污染物截留并盡可能地將這些污染物變廢為寶，是循環(huán)水處理系統(tǒng)的功能所在。循環(huán)水處理系統(tǒng)首先包括機(jī)械過濾部分。這些設(shè)備會(huì)將水中的固體懸浮物在一時(shí)間過濾出來。經(jīng)常用到的設(shè)備是蛋白質(zhì)分離器、微濾機(jī)、精密過濾器等設(shè)備。其次，循環(huán)水處理系統(tǒng)還有生化過濾設(shè)備。這些設(shè)備是為了培養(yǎng)相應(yīng)的微生物來對(duì)水中溶解性物質(zhì)進(jìn)行分解分離的。
氣壓的降低，造成水體對(duì)氧的溶解度降低，導(dǎo)致水體缺氧。在氣壓低的情況下，?？梢娝w底部污染物泛起，這就是所謂“泛塘現(xiàn)象?！胺禾痢钡慕Y(jié)果造成水底因缺氧而抑制的好氧菌重新得到獲取氧氣的機(jī)會(huì)，由此急劇消耗水體溶氧。工廠化循環(huán)水養(yǎng)殖模式仍然是未來具有發(fā)展?jié)摿Φ年懟h(huán)水養(yǎng)殖模式, 是中國(guó)開創(chuàng)現(xiàn)代水產(chǎn)業(yè)的重要組成部分。隨著核心裝備的國(guó)產(chǎn)化、水處理工藝的成熟化、養(yǎng)殖管理的科學(xué)化, 集“裝備工程化、技術(shù)現(xiàn)代化、生產(chǎn)工廠化、管理工業(yè)化”為一體的現(xiàn)代工業(yè)化養(yǎng)殖產(chǎn)業(yè)新模式將會(huì)被建立, 水產(chǎn)業(yè)的轉(zhuǎn)型升級(jí), 海淡水養(yǎng)魚大產(chǎn)業(yè)的架構(gòu), 才能夠?qū)崿F(xiàn), 而中國(guó)水產(chǎn)業(yè)將進(jìn)入工業(yè)化養(yǎng)殖新時(shí)代, 屆時(shí), 中國(guó)不僅是世界水產(chǎn)大國(guó), 也同樣會(huì)是世界水產(chǎn)強(qiáng)國(guó)。