保持水深在40～80厘米。氨氮含量小于每升0.2毫克，溶氧大于每升5毫克，保持水質清新。光照強度500～2000勒克斯，光照均勻。根據要求調節(jié)水溫和換水量。養(yǎng)殖過程需按時測定水溫、pH值、溶解氧、鹽度、COD、氨氮、亞硝(xiao)酸鹽、硝(xiao)酸鹽、磷酸鹽等相關指標，將各項指標控制在合適的范圍內。當水溫高于20℃時，需要加大地下低溫海水的添加量和循環(huán)水量，并采取加大純氧供給量的措施，使氧氣飽和度達到100～150%（有液氧設施）。由于夜晚時間比較長，也是魚類生長速度比較快的時段，因此每天傍晚要堅持清潔養(yǎng)殖池一次，并進行一次池底排污操作，給魚苗創(chuàng)造一個良好生長的環(huán)境。
在分解細菌的作用下，再進一步轉化成了氨。被魚類吃掉的一部分經過魚類的消化，也轉變成氨。殊途同歸的氨在分子態(tài)時是一種劇毒物質。在硝化細菌的作用下，它會被轉化成亞鹽。亞鹽是一種不太穩(wěn)定的物質。在高氧化還原電位的情況下，會被氧化成亞鹽。此時如果有反硝化細菌，鹽就會被轉化成N2從水中溢出。這樣，水體中的氮元素就完成了一個完整的轉化分離過程。 在實踐中，生物過濾的細菌需要適宜的條件才能起到相應的作用。如水體的溫度、PH、溶氧量、合適的碳氧化、殺菌劑等。因此，不僅要求其他系統(tǒng)設備與生物過濾器配套，更對操作者有一定的技術要求。
常見寄生在鰓部的苗種寄生蟲有：鰓隱鞭蟲、口絲蟲、錐體蟲、魚波豆蟲等等，這些寄生蟲會逐步破壞魚苗鰓部的功能，導致會出現魚不吃食或者浮頭等現象。預防寄生蟲的*有效方法就是管理好養(yǎng)殖水的質量，假如真的發(fā)現了魚不吃食或者浮頭等現象，千萬不要著急，不要妄自猜測，不要亂用藥，首先要確定是不是寄生蟲引起的，再者要確定到底是哪種寄生蟲引起的，*后才是用藥。